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能量流令人惊叹，却又冷峻无情。哪怕是几分钟、几秒钟的改变，都可能让生命的实验走向终点。孢子可以躲避能量流的严厉，沉入代谢的休眠，醒来时继续幸运的生存；但其余所有的生物，包括我们，仍然要随时依赖这样的能量机制，与最初的活细胞没有区别。这些机制从未发生过根本改变。怎么可能改变呢？活着才有生命，而活着就需要永不停息的能量流。所以，能量流对演化路径施加了严格的限制，决定了什么可以，什么不行。细菌一直都是细菌，永远不能改动供给它们力量生长分裂、征服世界的火焰。一次偶然的意外：原核生物之间的内共生事件，终于突破了能量之障。但它也没有改动生命之火，而是在每个真核细胞中引燃星星点点的火种，最终演化出复杂生命。我们人类的生理与演化，完全依赖于火焰的继续燃烧，而火光也照亮了我们的过去与现在，种种不可索解之处。我们的头脑，宇宙中最不可思议的生物机器，被永恒的能量之流驱动，现在可以思考自身，追问生命为什么会是这样。这又是演化中何等的幸运！
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愿质子动力与你同在！
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① 明神海丘准核细胞的内共生体，发现于论文作者描述的“吞噬体”中（细胞中的一些液泡），尽管它仍有完整无缺的细胞壁。他们认为宿主细胞从前是一个吞噬细胞，但后来失去了这种能力。这不一定正确。再看一下图25：图中的细胞内细菌也被包裹在非常类似的“液泡”中，但这张图的宿主细胞明显是蓝细菌，所以肯定不会有吞噬作用。丹·武耶克（Dan Wujek）认为，这些包裹着内共生体的液泡是制备电子显微切片时缩水造成的。我猜测，明神海丘准核细胞内部的那些“吞噬体”，应该也是类似的人为缩水现象，与吞噬作用没有关系。如果是这样，就没有理由认为宿主细胞的祖先是更复杂的吞噬细胞。
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② 根据开普勒空间望远镜的观察数据，银河系中每五个类日恒星中就会有一个“类地行星”位于可居住带（habitable zone）。按这个比例测算，银河系中共有四百亿颗适合生命起源的行星。
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复杂生命的起源 术语表
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ATP 三磷酸腺苷的缩写，所有细胞通用的能量“货币”。生命体利用ATP后产生的分解产物是ADP（二磷酸腺苷）和磷酸基团（PO43–）。呼吸作用产生的能量会被用来重新结合磷酸基团和ADP，再次合成ATP。乙酰磷酸是一种更简单的（二碳）能量货币，作用方式与ATP类似。早期地球的地球化学作用可能可以直接合成乙酰磷酸。
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ATP合酶 一种精巧的蛋白质旋转机器。它是嵌在膜上的纳米涡轮，通过膜外质子回流驱动ATP合成。
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DNA 脱氧核糖核酸的简称。DNA是遗传物质，呈双螺旋结构。寄生DNA是指利用生物体的基因组藏身，“自私”地复制自己的DNA。
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pH值 酸度（准确地说是质子浓度）的衡量单位。酸的质子浓度高（pH值低，小于7）。而碱的质子浓度低（pH值高，7～14）。纯水呈中性，pH值为7。
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RNA 核糖核酸的简称。它是DNA的近亲，但是因为有两处微小的差异，结构和性质都有别于DNA。RNA有三种主要形式：信使RNA（转录自DNA的代码脚本）、转运RNA（会根据遗传密码运送指定的氨基酸）和核糖体RNA（充任核糖体机器的部件）。
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RNA世界 一种科学假说中的早期演化阶段，其中RNA同时充任自我复制的模板（如同DNA现在的地位）和加快反应的催化剂（如同现在蛋白质的地位）。
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埃（符号为Å） 一种长度单位，原子的尺寸大约是1埃。具体的换算如下所示：1埃等于1米的一百亿分之一（10–10 m）。1纳米等于10埃，即10–9米。
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氨基酸 一类生物小分子，共有20种，是生命的基础构件。各种氨基酸可以连成一条长链，形成蛋白质分子（一个蛋白质通常由几百个氨基酸分子相连而成）。
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不平衡状态 一种具有反应潜力的状态，分子“想要”互相发生反应，但还没有发生。有机物和氧气就处于不平衡状态；如果机会合适（比如点燃一根火柴），有机物就会氧化燃烧。
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重组 在“流动”的染色体中，某个染色体上的一小段DNA，与另一个染色体上相同位置的DNA互相交换。最终，重组后的染色体会带有位置相同但组成不同的基因（特别是指等位基因）。
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单亲遗传 子代细胞只从双亲中的一方系统地继承线粒体，通常继承自卵子而非精子。双亲遗传是指子代细胞的线粒体继承自双亲两方。
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单源辐射演化 从一个共同祖先（或是单独一个分类门）分化出多个物种的现象，可以用车轮的辐条从轮轴中心发散的结构类比想象。
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蛋白质 由氨基酸串成的长链分子，有严格的序列顺序，由基因中的DNA字母序列指定。多肽是较短的氨基酸链，不一定有严格规定的序列。
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等位基因 一个基因在生物种群中的特定形式。
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电子 一种亚原子粒子，带有一个单位负电荷。电子受体是得到一个或多个电子的原子或分子；而电子供体是失去电子的原子或分子。
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凋亡 细胞程序性死亡。这是一种由基因编码设定的耗能过程，细胞自己降解、拆碎自己，剩下的物质循环利用。
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