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细胞质 细胞内部在细胞核之外的胶状物质。细胞质含有水样的胞质溶胶，包围着细胞内部的各个结构，比如线粒体。细胞骨架是细胞内部的动态蛋白支架，会随着细胞形状的变化而延伸和重组。
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细菌 生物的三大域之一。另外两个域是古菌和真核生物（包括人类）。细菌是原核生物，没有细胞核储存DNA，也没有复杂真核生物的各种精巧繁复的内部构造。
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线粒体 真核细胞中散布的“动力工厂”。它们源于α－变形菌，现在还保有一个微小但极为重要的基因组。线粒体基因是指位于线粒体内部的基因。线粒体生物合成是指新线粒体的复制、生长过程，需要核基因参与。
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新陈代谢 活细胞中维持生命的一系列化学反应。
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性别决定 控制生物发育成雄性或雌性的过程。
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选择性清除 环境对特定基因变体（等位基因）的强选择，最终使其取代种群中其他所有的等位基因。
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雪球地球 全球发生低温冰冻的气候事件，赤道地区的冰川都会延伸到海平面处。研究认为，地球史上出现过多次雪球地球时期。
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氧化 从物质的原子中夺去一个或多个电子，这时我们称物质被氧化了。
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氧化还原 氧化反应和还原反应相结合的过程，实质是电子从供体转移给受体。氧化还原对是指一对特定的电子供体和受体。氧化还原中心先接受一个电子，然后把它传递下去，所以氧化还原中心既是电子供体又是电子受体。
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叶绿体 植物和藻类细胞内一种特化的细胞器，是进行光合作用的场所。它们源于能进行光合作用的细菌，即蓝细菌。
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有性生殖 一种生殖循环。细胞先经过减数分裂形成配子，每个配子只有正常细胞一半的染色体；然后两个配子再结合，形成一个受精卵。
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有氧呼吸 我们的呼吸方式。食物与氧气发生反应，释放的能量被生物利用来做功。细菌也可以用氧气“燃烧”矿物或其他气体。请参考无氧呼吸和呼吸作用。
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原核生物 所有没有细胞核的简单细胞的统称（“原核”的字面意思是“细胞核出现之前”）。原核生物包括细菌和古菌，即涵盖了生物三大域中的两个域。
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原生生物 所有单细胞真核生物的统称。有些原生生物可以非常复杂，有多达4万个基因，其细胞的平均体积至少是细菌的15,000倍。原生动物是一个虽然字面意思很形象，但其实已经过时的术语（字面意思是“最早的动物”），原指阿米巴原虫等行为类似于动物的原生生物。
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源真核生物 不要与古菌混淆！源真核生物是多种单细胞的简单真核生物。过去曾被误认为是细菌与复杂真核生物之间“缺失的环节”。
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真核生物 由一个或多个真核细胞组成的生物，其细胞都有细胞核和其他高度特化的结构，如线粒体。包括植物、动物、真菌、藻类和原生生物（如阿米巴原虫）在内的所有复杂生命形态，都由真核细胞组成。真核生物是生物的三大域之一，其他两个域是形态更简单的细菌和古菌。
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脂肪酸 一种长链碳氢化合物，通常有15～20个相连的碳原子，是细菌和真核生物脂质膜的组成成分。长链的一端是一个酸性基因。
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直系同源基因 不同种生物基因组中的相同基因，功能也相同。所有这些基因都继承自同一个共同祖先。
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质粒 一小段环状的寄生DNA，会从一个细胞传递给另一个细胞。质粒可以为宿主细胞提供有用的基因（比如增强抗药性的基因）。
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质子 一种亚原子粒子，带有一个单位正电荷。一个氢原子由一个质子和一个电子组成。氢原子失去电子、只剩下氢原子核后，就是一个带正电的质子，用H+表示。
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质子梯度 膜两侧因质子浓度不同而造成的势差。质子动力是由膜两侧电荷差异和质子浓度差异共同形成的电化学力。
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种系 动物体内特化的、进行有性生殖的细胞（如精子和卵子）。所有细胞中只有它们负责传递基因，繁殖下一代。
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转录 根据DNA序列复制成较短的RNA代码脚本（信使RNA），是合成蛋白质的第一步。
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转译 根据RNA代码脚本（信使RNA）指定的精确氨基酸序列，在核糖体上把氨基酸组装成新蛋白质。
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自私冲突 比喻两个不同实体之间存在利益冲突。这可以发生在不同的内共生体之间，或者质粒与宿主细胞之间。
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