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有性生殖 一种生殖循环。细胞先经过减数分裂形成配子，每个配子只有正常细胞一半的染色体；然后两个配子再结合，形成一个受精卵。
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有氧呼吸 我们的呼吸方式。食物与氧气发生反应，释放的能量被生物利用来做功。细菌也可以用氧气“燃烧”矿物或其他气体。请参考无氧呼吸和呼吸作用。
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原核生物 所有没有细胞核的简单细胞的统称（“原核”的字面意思是“细胞核出现之前”）。原核生物包括细菌和古菌，即涵盖了生物三大域中的两个域。
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原生生物 所有单细胞真核生物的统称。有些原生生物可以非常复杂，有多达4万个基因，其细胞的平均体积至少是细菌的15,000倍。原生动物是一个虽然字面意思很形象，但其实已经过时的术语（字面意思是“最早的动物”），原指阿米巴原虫等行为类似于动物的原生生物。
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源真核生物 不要与古菌混淆！源真核生物是多种单细胞的简单真核生物。过去曾被误认为是细菌与复杂真核生物之间“缺失的环节”。
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真核生物 由一个或多个真核细胞组成的生物，其细胞都有细胞核和其他高度特化的结构，如线粒体。包括植物、动物、真菌、藻类和原生生物（如阿米巴原虫）在内的所有复杂生命形态，都由真核细胞组成。真核生物是生物的三大域之一，其他两个域是形态更简单的细菌和古菌。
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脂肪酸 一种长链碳氢化合物，通常有15～20个相连的碳原子，是细菌和真核生物脂质膜的组成成分。长链的一端是一个酸性基因。
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直系同源基因 不同种生物基因组中的相同基因，功能也相同。所有这些基因都继承自同一个共同祖先。
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质粒 一小段环状的寄生DNA，会从一个细胞传递给另一个细胞。质粒可以为宿主细胞提供有用的基因（比如增强抗药性的基因）。
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质子 一种亚原子粒子，带有一个单位正电荷。一个氢原子由一个质子和一个电子组成。氢原子失去电子、只剩下氢原子核后，就是一个带正电的质子，用H+表示。
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质子梯度 膜两侧因质子浓度不同而造成的势差。质子动力是由膜两侧电荷差异和质子浓度差异共同形成的电化学力。
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种系 动物体内特化的、进行有性生殖的细胞（如精子和卵子）。所有细胞中只有它们负责传递基因，繁殖下一代。
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转录 根据DNA序列复制成较短的RNA代码脚本（信使RNA），是合成蛋白质的第一步。
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转译 根据RNA代码脚本（信使RNA）指定的精确氨基酸序列，在核糖体上把氨基酸组装成新蛋白质。
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自私冲突 比喻两个不同实体之间存在利益冲突。这可以发生在不同的内共生体之间，或者质粒与宿主细胞之间。
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自由基 有一个不成对电子的原子或分子。不成对的电子使自由基不稳定、反应性强。在呼吸作用中泄漏的氧自由基，可能在生物的衰老和疾病过程中扮演着重要的角色。
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自由能 可以用来做功的能量（不是热能）。
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复杂生命的起源 致谢
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这本书标志着我生命中一段漫长旅程的终点，同时也是另一段新旅程的起点。前面一段，始于我先前的另一本书《能量、性、死亡：线粒体与我们生命的意义》（由牛津大学出版社于2005年出版）。那时候我刚开始思考本书讨论的问题：复杂生命的起源。关于真核细胞起源的问题，我深受比尔·马丁的影响。他在这个问题上有很多杰出的贡献，同时他和地球化学家迈克·拉塞尔在生命的起源、细菌和古菌的早期分化问题上做了很多创新研究。我那本书（以及这一本）中所有的内容，都植根于这两位演化生物学大师开创的研究基础。不过，本书中的另一些想法是我自己的新观点。写书给人思考的空间，对我来说，为普通读者写书是一种莫大的乐趣：思维必须清晰，表达思想的方式首先要让自己能够理解。这让我诚实地面对很多自己也不理解的问题，然后惊喜地发现，其中许多问题原来大家都不知道答案。所以，《能量、性、死亡》必然会提出一些创新的观点，而从那时开始，我就一直在反复思索。
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我在许多国际研讨会和大学讲座中提出这些想法，同时也渐渐习惯于面对尖锐的批评。这些观点不断完善，我对能量在演化中的重要性也有了越来越透彻的整体理解。有些敝帚自珍的想法，我也认识到它们的错误而最终放弃。然而，无论一个观点有多精彩，只有表达成严谨的科学假说并加以检验时，才能成为真正的科学。直到2008年之前，这些都是不可企及的梦想。2008年，伦敦大学学院为鼓励“大胆的思想者”提出开创性新思想，设立了一个新的奖项：开创性研究院长奖（Provost’s Venture Research Prize）。这个奖项的设立要归功于唐纳德·布拉本（Donald Braben）教授的思想。他是一位活力无限的学者，长期以来致力于推动“科学自由”（scientific freedom）。布拉本认为，科学的本质是不可预测的，所以不应该用规范去限制；而社会为了控制“纳税人提供的经费”，经常人为规定科学研究的优先方向。真正突破性的科学思想，几乎总是来自最出人意料的方向，这其实是逻辑上的必然。而这些思想的突破性和开创性，不仅表现在科学上，同时也会辐射到更广泛的经济层面，因为科学进步是经济发展最重要的动力源之一。所以，对科学家的经费支持，最好能单纯以科学思想的力度为标准（当然这极难衡量），而不是根据眼下理解的、符合人类切身利益的标准。后一种策略通常都会失败，因为开创性的真知灼见经常来自于现有研究领域之外，完全无视人为设置的界线。①
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我很幸运地取得了申请伦敦大学学院新奖项的资格：我的书中充满了亟待验证的新思想。更幸运的是，布拉本教授最终接受了我的申请。他是这个奖项的设立者，对此我非常感激；在他之外，我同样感谢伦敦大学学院的研究副院长戴维·普莱斯教授（David Price），以及院长马尔科姆·格兰特教授（Malcom Grant）。他们的慷慨与科学视野，给予这个奖项和我本人诸多支持。我也非常感谢史蒂夫·琼斯教授（Steve Jones）的支持，他当时是遗传、演化与环境系主任，热情接纳我进入该系——对于我当时从事的研究，那是最理想的环境。
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自六年前获奖之后，我一直竭尽所能，从各种角度研究我自己提出的很多问题。“开创性研究奖”提供三年的研究经费，足够我厘清研究的方向，争取其他来源的经费继续工作。非常感谢利华休姆信托基金会，在过去三年间赞助了我关于生命起源的研究。很少有机构愿意支持真正实验性的科学研究，因为新方向的草创时期会遇到各式各样的难题。幸好，我们设计的小型台式生命起源反应器（bench-top origin-of-life reactor）已经开始产出令人兴奋的结果。如果没有基金会研究经费的支持，这些都不可能实现。本书就是这些研究初步结果的精华总结，也是一段新旅程的起点。
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当然，这些研究都不是以一人之力完成的。我与杜塞尔多夫大学分子演化生物学教授比尔·马丁进行过许多讨论和思辨。他贡献了大量的时间、精力和思想与我合作，也毫不犹豫地纠正我的逻辑错误，或是无知。与马丁共同发表多篇论文是我真正的荣幸，我认为它们是对这个研究领域的重要贡献。在我的生活中，很少有什么事情能带来和马丁一起写论文那样的挑战和乐趣。我还从马丁那里学到了宝贵的一课：不要让那些想象中合理，但没有在真实世界中发现的可能性把问题复杂化；专注于生命中已知的实际现象，再去问为什么。
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