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按照阮雄生的要求，各进攻方向仍按照旧的突破方向冲击，若在越军炮火准备阶段法军没有占领A1高地东坡旧阵地，那么部队冲击前只进行3分钟的炮兵压制射击即可。虽然如此，各个步兵连为了破坏法军临时在阵地前沿布设的障碍物，还是得准备足够的爆破筒，随时实施爆破作业。纵深战斗行动继续沿袭第174团旧作战计划，但阮雄生少校强调各连一定要做好打敌反扑的准备，特别指示主要突击方向的第18营营长要带部队迅速冲上A1高地山顶，炸毁山顶大碉堡，粉碎法军的抵抗中枢。
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在第102团团指匆忙准备作战计划的同时，参加战斗的第54营和第18营2个连也抓紧时间调整组织，补充弹药和动员部队准备战斗。当团指紧张拟好作战计划时，各单位立即行军开赴攻击前出发阵地。在行军途中，各连长接到团指传达的具体战斗计划。由于来不及召开战地会议，各连长只能在部队沿着交通壕机动时派人分头向排班干部和全体战士传达作战计划，并要求全体指战员严格执行团指的命令，一定要打赢这次A1高地攻坚战。由于没有时间观察地形和敌情，虽然第102团已经向参加战斗的18营和54营4个连传达了具体作战计划，可部队还是对具体情况和敌情不甚了解。在这种准备仓促，既不知己又不知彼的情况下，越军对A1高地发动了第二次进攻。
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3月31日17点00分，第102团开始出击。18点00分，第102团4个连全部进抵进攻出发线。在次要方向上，第174团参加战斗的一个排因地貌完全改变（经过一夜战斗的缘故），没能占领预定进攻出发线。
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在主要进攻方向上，地形地貌也发生了巨大变化。负责给第102团带路的第174团侦察员走着走着就迷了路，一直到22点15分才带着102团找到前一日的突破口。这时，第102团各连长发现原突破口的各碉堡和火力点已被法军复占。
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在这种情况下，第18营和第54营各连决定解散爆破排编制，临时组织突击排（爆破排拆成各个爆破组，配属给突击排和后续排）。第102团团长阮雄生少校也决定取消破坏射击阶段，直接进行炮兵压制射击，然后步兵就冲锋。
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3月31日22点30分，越军对A1高地的第二次进攻拉开帷幕。在进行3分钟炮兵火力压制后，第102团4个连的步兵发起冲击，很快越过突破口。复占突破口周围碉堡和火力点的法军被越军炮兵压制射击给打了个措手不及，损失部分兵力后放弃阵地往纵深退却。第102团兵分两路继续冲击，经过15分钟战斗，第102团就拿下了整个A区，活捉法军15人。这时，法军也从错愕中惊醒过来，很快组织各种武器实施猛烈拦阻射击。担任102团主攻连的第54营267连在副营长指挥下继续往B区东北发展进攻，并以一部分兵力冲上山顶，寻找山顶大碉堡地下室出口。但他们没能找到出口，对山顶大碉堡实施爆破也没有成功，反而被在炮兵支援下的A1高地的法军各种轻武器火力打退。第102团进攻受阻，难以发展。
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在次要进攻方向上，第174团251营674连1个排在向D区发展进攻时，遭到法军反冲锋，虽然勉强击退了法军反扑，但也被法军火力压制，被迫退却。
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这个时候，阮雄生才意识到，对A1高地进攻的越军来说，大敌是航岗区和芒清区的法军105毫米榴弹炮群和120毫米重迫击炮群。在给第308大团长王承武的电话中，阮雄生请求第45炮兵团压住芒清区和航岗区的法军炮兵，同时他还命令配属给第102团的75毫米山炮连和120毫米重迫击炮连集中全部火力继续压制A1高地西面规定的各个目标，掩护主要进攻和次要进攻方向的102团4个连和174团674连1个排直插山顶，炸毁山顶大碉堡，并打敌反扑。
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在75毫米山炮连和120毫米重迫击炮连火力支援下，主要方向进攻的第102团4个连拿下了A1高地山顶前的部分掩体和火力点，并继续组织对山顶大碉堡的冲击，依旧遭到法军猛烈的炮火封锁，伤亡逐渐增大，且无法前进一步。此时，第102团冲在最前面的2个连伤亡很大，无力继续发展进攻，后续部队又没能及时跟进。战斗一如前一晚那样陷入了胶着状态。越军不管多么努力，就是没法冲上山顶，更不要说炸毁山顶大碉堡。
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对越军第102团二打A1高地，法军战史记载道：
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在3月31日夜的激战中，不少法军分队也摸上了E2高地，包括第8殖民地伞兵营营部连的1个57毫米无后坐力炮小组。在越军波波相连、持续不断的冲击下，守军又一次被逼到山顶，E2高地再次告急！
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午夜，第1轻骑兵团3连连长埃尔夫特上尉派尼耶上士的坦克排越过楠云河渡口，直接开上了E2高地，支援守军。越军早有准备，反坦克小组的火箭筒和无后坐力炮对M24“霞飞”坦克群构成了巨大威胁——尼耶上士的坐骑（绰号“埃林根”）被命中6次，维勒中士的坦克也被命中2次，但两辆坦克带伤作战，勇猛地冲进越军进攻队形，到处开火，打退了越军的进攻。
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A1高地纵深战斗僵持局面一直持续到4月1日凌晨04点00分，负责统一指挥纵深战斗的越军第102团18营营长决定把最后的预备队——第54营263连拉上去，投入A1高地的攻坚战斗。然而，在从进攻出发阵地往前运动过程中，第263连遭到法军炮兵火力封锁，伤亡很大，只剩2个排。这时，法军也巩固了A1高地剩下来的阵地，在得到预备队的增强下，加大了对越军第102团的火力突击力度。此时，第102团在A1高地纵深的部队目前只勉强守住既得阵地，打敌反扑，继续发展进攻已是痴人说梦。
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至4点30分，第102团18营和54营损失很大，基本丧失了进攻能力，且大部分工事被法军火力破坏，部队难以在A1高地山顶和山腰坚持战斗，被迫退回突破口附近的交通壕。鉴于267连伤亡很大，18营营长只得把267连撤下A1高地，收容残存兵力，充当102团预备队。
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174团进攻失败后，越军战役指挥部又把第102团拉上来打，虽然他们一度冲上了A1高地山顶，可还是被打败了。
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在进攻遇到很大困难的情况下，第102团团长阮雄生只得命令：各单位坚决守住既得阵地，迅速改造工事，组织火力击溃敌人各次反冲锋，为第102团组织新的进攻创造有利条件。
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发现越军战斗力耗尽，已经无力继续组织进攻，而且后续梯队也受阻于后方时，法军来了精神，马上组织起连续反扑，力求把越军第102团赶下A1高地。4月1日凌晨05点00分，法军2辆坦克在步兵的配合下从芒清区出动，兵分两路对越军2个突破口实施反扑。为了支援步坦联合反扑，法军还用直射火力压制越军的两个突破口，同时组织炮兵火力猛烈轰击A1高地东面和越军进攻出发线，试图切断在A1高地纵深的越军和后续部队的联系。
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在主要突击方向，第102团团长亲自前往A1高地纵深指挥战斗，他指示各连要依托临时工事顽强坚守突破口周围阵地，把法军放近再集中火力消灭，粉碎法军的反扑。在次要突击方向，第174团674连也顽强死守突破口阵地，用火力分割了法军的步坦协同，掩护连里的2名战士用巴祖卡火箭筒打坏了法军1辆坦克，迫使法军步兵退却。
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结果，第102团和174团连续击退了法军的反扑，可当他们试图发展进攻时又被法军火力挡住，仅仅前进了15米就再也动弹不得。
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4月1日09点30分，法军又组织了一次反冲锋，可还是被越军击退。从这时起一直到15点00分，法军不再组织步坦联合反冲锋，而是用炮兵火力轰击越军阵地。根据团长阮雄生少校的指示，留守A1高地纵深指挥部队战斗的部分干部积极带部队加强工事，减少法军炮火杀伤，并准备打击法军反冲锋。
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4月1日15点00分，法军2辆坦克冲到B区南面，接着2个步兵连也从芒清区冲过来，在A1高地守军的配合下，实施新一轮反扑，力求把越军赶下高地。同时，法军使用炮兵和2架飞机轰炸与扫射秃山和越军的进攻出发线，掩护法军步坦协同反扑。由于工事少、阵地窄，经过2个小时的激烈战斗，越军被迫退出突破口。这时，直接参加战斗的兵力只剩17位指战员，剩下的大部分牺牲或负伤，少数散布在山脚战壕掩体里，难以掌握。尽管如此，第102团团长阮雄生少校还是决心守住突破口，他又把第18营刚刚到位的第3个连投入战斗。可该连在越过突破口时又遭到法军炮兵猛烈轰击，伤亡惨重，只剩1个多排的兵力。在这种情况下，阮雄生少校只得直接指挥这个连剩余兵力，配合留守部队继续战斗，又打退了法军反冲锋，夺回了突破口。
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与此同时，第174团674连也守住了自己的突破口，可一昼夜战斗损耗太大了，全连只剩8名指战员，不堪再战。阮雄生只得让第18营最后一个连换下674连，保住A1高地两个突破口，为第三次打A1高地做准备。
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虽然法军又一次粉碎了越军对A1高地的进攻，第102团18营和54营损失惨重，但在具体战斗过程的描述上，特别是法军的反扑方面，越军的战斗报告和法军战史说法有相当大的出入。法军战史称：
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