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食物从胃进入小肠后，在小肠内进一步消化和吸收。小肠由十二指肠、空肠、回肠三个部分组成，全长可达6m之多。与胃壁相似，小肠壁也可分为黏膜层、肌层，最外面则包裹着腹膜。
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胃与小肠相连接的起始部位称为十二指肠，十二指肠位于胰腺后方，是小肠中长度最短、管径最粗、位置最深的一段肠管。十二指肠全长约25cm，它的长度与十二只手指并排放在一起时的长度近似。十二指肠外形颇似英文字母“C”，在消化道中起着举足轻重的作用。
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胆总管、胰管与十二指肠相通，肝脏产生的胆汁可暂时储存于胆囊内，待需要时胆汁再从胆囊内排出，经过胆总管进入十二指肠，而胰腺产生的胰液则可直接经过胰管进入十二指肠。在十二指肠的蠕动作用下，胆汁、胰液与食物充分混合，使食物能够更加有效地被小肠消化和吸收。
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除了十二指肠外，剩下的小肠又可分为空肠和回肠，空肠长度约占2/5，剩下的3/5则为回肠，二者功能相同，外形也大致相似。空肠、回肠的最外侧包裹着两层称为肠系膜的系膜组织，一方面可以将肠管悬挂于腹后壁，使肠管保持相对固定的状态，一方面又允许小肠在一定范围内自由地蠕动。小肠的最外面还悬覆着被称为大网膜的双层腹膜结构，大网膜不随小肠蠕动而改变位置，保护肠管的同时还能够起到重要的防御作用。
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空肠、回肠的肠壁内侧面还有很多环形皱襞，仔细观察这些肠壁，我们还可以发现这些肠壁上有很多绒毛样细小的突起，我们将这些突起形象地称为肠绒毛。环形皱襞和肠绒毛都最大限度地增加了小肠的表面积，使肠道能够更好地进行消化和吸收。
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全长可达6m之多
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小肠的长度也会随肠管的收缩和舒张有所变化，收缩时长度约为3m左右，而舒张时长度可延展至6m左右。
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肝脏
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肝脏位于右上腹，具有十分重要的生理作用，它不仅能够对肠道吸收的各类营养物质进行再加工、再处理，还具有极强的“解毒”作用，能够对人体产生或者摄入的各种有害物质进行降解，使其成为无毒无害的物质被人体吸收或排出体外。详情请参照此处。
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胆囊
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肝脏产生的胆汁可以暂时储存于胆囊中，待需要时由胆囊释放入十二指肠。详情请参照此处。
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胰腺
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十二指肠呈“C”形包绕于胰头外侧，胰腺可以分泌重要的胰岛素。详情请参照此处。
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■小肠（十二指肠、空肠、回肠）的构造
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漫画人体：一看就懂的人体结构书 三大营养素行踪大揭秘
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食物的消化和吸收主要在小肠内完成。碳水化合物、蛋白质、脂质、维生素和矿物质是人体必需的五大营养素，人体对于碳水化合物、蛋白质和脂质这三类营养素的需求量很大，而对维生素和矿物质的需求量较少，所以又称这两种营养素为微量营养素。碳水化合物、蛋白质和脂质这三大营养素作为重要的能量来源，是人体生长发育、维持生命活动缺一不可的物质基础，但是过量摄入也会引起代谢异常，使肝脏脂肪堆积形成脂肪肝，从而加重肝脏代谢负担。
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食物中的碳水化合物（谷物、糖类、薯类中含有大量碳水化合物）被唾液和胰液中的淀粉酶分解为葡萄糖后，可以暂时储存于肝脏中。当血液中的葡萄糖含量不足时，储存于肝脏中的这部分葡萄糖可以重新释放入血，提高血糖浓度。
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食物中的蛋白质（肉、鱼、蛋、大豆中含有大量蛋白质）在胃和小肠内被蛋白酶逐级水解，形成的氨基酸被小肠吸收入血后，可作为原料重新被人体利用，合成各种分泌蛋白抑或参与形成新的细胞和组织，在体内继续发挥重要作用。
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食物中的脂质（肉、鱼、油炸类食物中含有大量脂质）在小肠内各种消化酶的作用下最终被分解为甘油和脂肪酸，通过小肠被人体吸收而暂时储存于脂肪组织中。这些脂肪组织是人体重要的储备能源，脂质能够提供的能量是相同质量的碳水化合物的2倍之多。当人体能量不足时，这些储存于脂肪组织内的脂质可通过脂肪动员被调动起来，迅速为人体提供大量能量。
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维生素
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人体生存不可或缺的有机化合物，和三大营养素一起维持人体正常生理功能。