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例如，人类基因组计划取得了巨大成功，弄清楚了人类基因组中的所有基因序列，但对于那些指望马上得到基因疾病良药的人来说，会感到巨大的失望。人类基因组计划就像一部大词典，其中有23000个词条，但没有任何解释。这部词典里全是空白的页面，但每一个基因的拼写完全正确。这个计划是一种突破，但同时它只是弄清楚这些基因的功能以及它们之间相互作用的第一步。
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同样，仅仅有一张包含大脑中所有神经连接的完整图画，并不意味着我们会明白这些神经元的功能和它们之间的互动。反向工程是比较容易的一部分，之后，困难的部分会开始，即理解这些数据。
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心灵的未来 未来
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先让我们假设这个时刻已经来临。科学家带着吹嘘的口吻庄严地宣布，他们对整个人类大脑的反向工程取得了成功。
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然后呢？
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一种直接应用是寻找某些精神疾病的来源。人们认为很多精神疾病并非由神经元的大面积损伤造成，而是由简单的错误连接造成的。设想那些由简单突变造成的基因疾病，如亨廷顿氏舞蹈病、泰氏-萨氏病（家族黑蒙性白痴症）或囊肿性纤维化症。在人的30亿个碱基对中，只要一个出错（或重复出现）就会造成肢体不可控制地乱动和颤抖，这是我们在亨廷顿氏舞蹈病中看到的。即使基因组的99.9999999％准确，一个微小的缺陷还是会使整个序列失效。这就是为什么基因疗法认为这些单个突变是有可能治愈的基因疾病。
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同样，一旦大脑被反向工程后，我们可能进行大脑模拟，故意打断某些连接，观察是否会引起某些疾病。也许只有几个神经元可能对我们的认知造成重要影响。标定这些出现错误激活的神经元可能是大脑反向工程的一项重要工作。
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卡普格拉妄想症（Capgras delusion，又称“替身幻觉综合征”）可以作为一个例证。有这种幻觉的人可以认出自己的妈妈，但同时认为这个人是假冒的。根据V．S．拉玛钱德朗博士的看法，这种罕见的疾病可能是由于大脑中两个部分的错误连接造成的。位于颞叶的梭状回负责识别妈妈的脸，但由杏仁核负责见到妈妈时的情感表现。当这两个中枢的连接断裂时，一个人会正确地识别出妈妈的脸，但由于没有情感回应，他会认为这个人是假冒者。
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大脑反向工程的另一个实际用途是精确标定哪些神经元出现错误激活。我们看到，深部大脑刺激术（DBS）会使用微小的探针减弱大脑一小部分的活动，如某些深度抑郁病例中的布洛德曼25区。利用大脑反向工程图，也许可能精确地找到神经元错误激活的部位，这里很可能只包含少数几个神经元。
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大脑反向工程对于人工智能也可能有所帮助。大脑可以毫不费力地进行视觉和人脸识别，但最先进的计算机都很难完成这种工作。例如，计算机对数据库中储存的正面人脸的识别精度达到95％，或者说精度很高，但如果人脸的角度发生改变，或者识别的人脸不在数据库中，计算机很可能会识别失败。我们可以在1秒钟之内从不同角度认出我们所熟悉的面孔。这个过程对于大脑来说如此简单，我们甚至都没有意识到我们在识别。大脑反向工程也许可以揭示我们是怎么做到的。
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涉及大脑多重故障的疾病，如精神分裂症，可能更复杂些。这个病症涉及多个基因，加之与周围环境的互动，这又造成不同大脑区域的反常活动。但即使是这种情况，大脑反向工程还是可能告诉我们某些症状（如幻觉）到底是如何形成的，为找到可能的药物奠定基础。
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大脑反向工程还能解决一些基本的但仍未解决的问题，如记忆能储存多久。我们知道大脑的某些部位储存记忆，如海马体和杏仁核，但记忆是如何分散到不同的皮层，然后又重新组合成记忆的仍不清楚。
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一旦用反向工程构建的大脑发挥作用，那么就是打开它的所有通路，检验它是否能像人类一样做出反应（即，看看它能否通过图灵测验）的时候了。由于长期记忆已经在反向工程大脑中得到编码，这个大脑能否像人类一样做出反应应该能够很快体现出来。
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最后，大脑反向工程还有一个影响，人们虽然很少讨论，但存在于很多人心中的一个问题是：能否长生不老。如果意识可以转移到计算机中，这是否意味着我们不会死去呢？
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心灵的未来 12 未来：物质以外的心灵
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猜测从不是浪费时间。它把错综复杂推理中的朽木清除。
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——伊丽莎白·彼得斯（Elizabeth Peters）
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我们的文明是科学文明……即知识及其完整性是至关重要的文明。科学一词在拉丁语中就是知识的意思……知识是我们的归宿。
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——雅各布·布罗诺夫斯基（Jacob Bronowski）
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意识能够不受我们肉身的束缚而独自存在吗？我们能够离开终将逝去的躯体，像神灵一样在这被称为宇宙的乐园里游荡吗？《星际迷航》采用了这个主题，“进取号”星舰的柯克（Kirk）船长遇到一个超人种族，比行星联盟领先近100万年。他们已经先进到很早就抛弃了脆弱的、终将死去的躯壳，住在由纯能量构成的脉冲球体中。那些令人心醉的感觉，如呼吸新鲜空气、触摸另一个人的手或者感受肉体的爱，对于他们来说已经是千年之前的事了。他们的领袖萨尔贡（Sargon）欢迎“进取号”到自己的行星来。柯克船长接受了这个邀请，同时非常清楚这个文明能够把“进取号”瞬间汽化，如果它愿意这么做的话。
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但船员们并不知道，这些超级生物有一个致命弱点。他们虽然拥有先进的技术，但他们没有肉体，他们从肉体中分离出来已经有几十万年。所以，他们渴望体验肉体感觉的冲击，渴望重新变为人类。
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