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微生物不仅有利于植物生长，还有利于酿酒。泸州老窖、茅台、古井贡酒等中国传统名酒，都是以产地命名，原产地才是最适合酿这些酒的地方，如果换了酿酒地点，哪怕配方相同，酿出来的酒也风味大减。
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这些风水宝地酿酒风味独特的秘诀，在于当地独特的“水（水质）、土（土壤）、气（气温）、气（气候）、生（微生物）”。其中微生物的作用至关重要，因为酿酒过程实质上就是微生物的代谢过程。
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酿酒的微生物存在于酒曲、窖泥和酒醅中。酒曲是长有微生物的粮食，其中的微生物包括酵母菌、细菌和曲霉（Aspergillus），用于使酿酒原料发酵。窖泥是酒在进行无氧发酵时用来封闭酒窖、隔绝空气的泥巴，大部分酒厂的窖泥都是多年循环使用的，酿酒业素有“千年老窖万年槽，酒好全凭窖池老”的说法，窖泥中的微生物主要为甲烷菌（methanotropic bacteria）和己酸菌（caproate acid bacteria），能产生丁酸、己酸、己酸乙酯等化学物质，为酒添加独特风味。发酵后的酿酒原料叫酒醅，可用于蒸馏酒水，其中的微生物主要来自酒曲和窖泥，种类比较复杂。因为酒曲、窖泥中微生物种类的不同，酿出来的酒也风味各异，有酱香型、清香型、浓香型等。
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泸州国窖（摄影：尹烨）
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2019年9月，茅台集团和华大基因在深圳签署了长期战略合作协议。双方将携手贵州工业微生物研发中心，建立酿酒微生物基因库，探索发酵过程中微生物的作用机制，解密茅台酿造地区的土地微生物特质，充分挖掘和利用微生物大数据价值，为茅台生产提供科学依据。这一合作有利于以茅台为代表的贵州白酒产业的可持续发展，带动其他高科技、高附加值的现代发酵产业实现突破。
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醇厚的美酒大受人类的欢迎，而人类在积极酿酒的同时也为这些微生物创造了合适的生存环境，也许这也是人类和微生物的一种互作吧。
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