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生物学和数学需要更立体的交织，当这一点实现时，时间已经又过去了将近一个世纪。休厄尔·赖特和费希尔是这个领域的先驱，他们用数学理论填补了传统达尔文进化论和孟德尔遗传学之间的空隙，首次通过计算预测了自然选择对推动生物进化的助益程度，为现代进化论的建立奠定了基础。而后半个世纪转瞬即逝，直到系统生物学出现，我们才窥见微观分子的相互作用如何造就了生物复杂的行为和表现型。当然，如果不是这些研究，我们也不会知道细胞比生命游戏中的方块要复杂得多。细胞的调控环路与人类大脑中的神经网络类似，它们都能通过执行复杂的计算以调节分子行为，维持自身的存活。虽然生物的调控环路与数字计算机差异巨大，但是拥有实体的生物与虚拟的数学和算法之间却有着某种深深的羁绊，这连康韦和达尔文都没有猜到。
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系统生物学中强大的数学工具让我们能够破译自然图书馆中每个基因型所对应的表现型，这是我们利用计算机研究生物进化的先决条件。在研究的过程中，我们意识到了基因型网络的存在，而基因型网络正是新性状的源头（不管是新的代谢、生物大分子还是调控环路），也就是生命的源头。生命从混沌之初发展到单细胞生物，从细菌、真菌的远古祖先到原始的蠕虫、鱼类、两栖类、爬行类，直到人类出现，经历了万亿年的繁衍生息。而在这个过程中，基因型网络功不可没。
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光有基因型网络还不够，如同宇宙尘埃只是循着引力的引导就形成了巨大的星系，数学让我们意识到自然图书馆在自组织过程中也遵循一个简单的规律。这个规律就是普遍存在的发育稳态，而遗传上的稳定性来自复杂性。一定程度的复杂性让生物能够适应不断变化的环境。由此，我们发现了自然图书馆中馆藏之间紧密交织的相互关系。
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我们在书中探讨的图书馆与解剖学家研究的肌肉、神经和结缔组织完全不一样。它们甚至不像单细胞生物那样能够用显微镜看到，也不能用观察DNA晶体结构的X射线成像。它们是触不可及的抽象概念和数学模型，只允许我们借助思维徜徉其中。
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那这些图书馆是不是只存在于我们的想象中呢？它们是客观存在的，还是我们凭空捏造的呢？
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那么知识（尤其是数学）到底是客观存在的，还是我们发明创造的呢？哲学家们对这个问题的讨论至少可以追溯到毕达哥拉斯或者柏拉图，已经有超过2 500年的历史了。柏拉图认为，人类肉眼可见的世界不过是墙上的虚幻投影，在其之上是更高阶的理性世界，正是这个更真实的世界将自己的影子投射在感官世界的墙面上。柏拉图学派认为，客观的真理是存在的，只是它们存在于更高阶的理性世界之中。真理本身并不以人类的存在为前提，比如不管人类有没有观察或者意识到，月球的背面一直都客观存在。而相反的声音也一直存在，比如奥地利哲学家路德维希·维特根斯坦（Ludwig Wittgenstein）就认为，数学是人类发明的产物，用维特根斯坦自己的话说就是“数学家是发明家，不是发现家”。
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柏拉图学派在这场辩论中略占上风，虽然最好的论据可能连柏拉图本人都不知道。这个论据就是数学理论与物理事实之间惊人的吻合性，借用伽利略的一句名言：“数学是上帝书写宇宙时用的语言。”所有天真的创世论者都应当听听这句话。诺贝尔奖得主、匈牙利籍物理和数学家尤金·魏格纳（Eugene Wigner）曾经说：“数学在研究自然科学中简直有用得难以置信。”
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确实难以置信。我们不知道为什么牛顿定律除了预测苹果下落的速度之外，还能用来计算行星的自转、预测星系的形成。但它们就是可以。此外还有无数数学定律，它们能够解释许多时空上遥不可及的现象，我们甚至都不用直接观察或是体验到它们。数学与现实之间的联系着实紧密，瑞典理论物理学家迈克斯·泰格马克（Max Tegmark）[27]甚至直言，宇宙的本质就是数学。
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但如果仅仅是“有用得难以置信”，还不足以证明自然图书馆和基因型网络的真实性。让它们进入我们视野的另一位功臣是21世纪的工程技术。有了技术的帮助，一场纸上谈兵的辩论转而变成了一门实验科学。转变发生的原因是我们拥有了读取自然图书馆中馆藏的能力。比如，我们可以构建蛋白质图书馆中的任何一本馆藏，然后用生物化学手段解读它的化学含义。自然界的生物早就先我们一步找到了不少蛋白质，而它们在生物体内的作用常常出乎我们的意料，比如抗冻蛋白、晶体蛋白和Hox调节因子家族。我们几乎可以肯定，自然图书馆中还有无数的惊喜，远非人类的发明创造所能企及。
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当我们探讨自然图书馆时，我们的目的不仅仅是寻找生命的起源与科技创新的来源。我们希望哲学中最历久弥新的命题能够引发读者的些许思考。我们的研究发现，推动生命进化的动力可能比生命本身更古老，甚至比时间更古老。
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适者降临：自然如何创新 [:1700254206]
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适者降临：自然如何创新 译者后记
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听闻此书即将交付印刷出版，内心百感交集。
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与此书的相遇缘起于大学时的同学侯新智，侯作为科班的语言专业出身，领我入了英文书籍翻译的门，只可惜我到现在为止依旧是半路出家的水平。在湛庐文化的第一次翻译经历始于侯先斩后奏将手头正在翻译的半本书交给了我，在此也感谢简学老师对此的宽容大度。第一本书完成之后，简老师一错再错，把这本《适者降临》送到了我手上。非常感谢两位提供的机缘。
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郝莹老师现在步了简老师的“后尘”，承蒙错爱。
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翻译的过程说不上艰难险阻，但也并非顺风顺水。对于一个哲学门外汉来说，书中大量的哲学内容探讨让我甚是头疼，每每碰到理解上的难题时，幸而有哲学系的同学赵梦雪帮我出谋划策。书籍翻译不在势头猛，而在细水长流，翻译之中曾经一度陷入过困顿，这里也特别感谢同学赵璐洁的帮助。以上两位现在都在欧洲求学，遥祝她们一切顺利，学有所成。
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能够坐在笔记本前，敲下漫漫十多万字，少不了其他人在生活上的帮助。在这里，要感谢杨传剑，感谢室友陶昶煜、李文睿和朱奕彰，感谢同学丰俊林、杨子逸、杨樾、王国乾，感谢郑棒、李华铭、刑美英、吴宇佳，感谢老许。除此之外，承蒙太多关照，无法在这里一一赘述。
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翻译过程中恰逢自己毕业离校，难免面对熟悉的人各奔前程。如果说毕业典礼上的风光犹如浓缩了昔日在校期间的所有精华，那么平平淡淡的校园生活就相当于在这场浓缩里扮演了跬步和小流的角色。前者是突变论者喜闻乐见的场景，而后者则是渐进主义者青睐的论调。初入社会的不少同学在面对毕业这个突变时显示出了前所未有的谨慎，因为这意味着之前平静和按部就班的生活随即荡然无存。
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也许人们对于生活的期许有赖于对生活本身的看法，尤其是对于生活到底是离散还是连续的看法。相信生活是离散的人大概会更看重生活中的突变，就像相信生物进化依赖于突变的孟德尔学派；认为生活是连续的人大概更愿意强调眼前的每一件小事，正如愿意在生物进化中寻找每个微小改变的渐进主义学派。不过正如书中所说，突变论和渐进论的争论将生物进化的问题带上了一条歧途。问题的关键不在于变化剧烈与否，而在于给生活带来变化的动力起源于何处。
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早先有许多相识的人会诧异于我在翻译文章和书的事实。我的专业和翻译没有任何关系，甚至于可能几乎不用跟英语打交道。外语和语文本身并非我的兴趣，后者几乎可以说是软肋。也许大家常常会太过于关注一个突变的实际意义，突变可以是单基因突变，乃至于单核苷酸突变。除了错义突变和无义突变之外，单核苷酸突变也可以是同义突变。这类似于日本科学家木村资生提出的中性突变理论的事实基础：大部分的突变都缺乏进化上的意义。它们既不好，也不坏。
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我们起于殊途，也许归于同处。
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