1700260645
1700260646
图4—22 核糖与脱氧核糖的比较图。如果你觉得右边还少了一个氢,那是因为在有机化学的键线式里,直接连接碳原子的氢原子通常省略不写。(作者绘)
1700260647
1700260648
1700260649
1700260650
1700260651
图4—23 双螺旋两种右旋构想图示。“碱基所在的曲面”是为了理解方便而构造的假想曲面,双螺旋的碱基会大致分布在这个曲面上,你可以将这幅图与图2—43对照一下。(作者绘)
1700260652
1700260653
就因为这一个氧原子的区别,DNA不仅拥有更加牢固的骨架,还更容易与互补链稳定地缠绕起来,形成那个著名的双螺旋结构。在第六章里,我们曾把碱基互补配对的双链核酸比作一架梯子,所谓双螺旋,就是让这架梯子绕着某个旋转轴扭起来。但是,梯子具体怎么扭,却有图4—23中的两种方式:一种是像左边那样,像缠胶带一样缠在旋转轴上;另一种是像右边那样,像拧麻花一样两端朝不同的方向转动,旋转轴就是梯子固有的对称轴[4]。
1700260654
1700260655
于是我们发现,某些以双链DNA为遗传物质的病毒,比如第十一章里那些新发现的巨型病毒,竟然可以拥有有上百万个碱基的基因组,编码上千种蛋白质。而对于细胞来说,哪怕只是一个细菌,也能用一个DNA双螺旋存下近千万个碱基组成的基因组,编码上万个蛋白质。这都是因为,DNA的双螺旋,实在要比RNA的双螺旋稳定得多了。
1700260656
1700260657
对于那些好奇DNA来自何处的读者,这一章结束之后会有一篇“延伸阅读”,介绍一类非常古老,足能追溯到末祖身上的酶。但在正文里,我们要继续观察DNA与RNA的另一项重大差异。
1700260658
1700260659
我们在中学的生物课上就已经知道,那个与腺嘌呤(A)配对的碱基,在RNA上是尿嘧啶(U),在DNA上却换成了胸腺嘧啶(T),比较一下这两个碱基的差别,你会发现T比U只多了一个甲基。
1700260660
1700260661
这是为什么?
1700260662
1700260663
因为碱基C并不是一种非常稳定的物质,它在水溶液里自己就会发生一种“自发脱氨反应”,直接变成碱基U。在我们这样的动物体内,每个细胞每天都会发生大约190次的C-U突变,而DNA肩负着遗传的功能,指望着要绵延无限长的岁月,这样频繁的突变日积月累,必成大患。
1700260664
1700260665
所以幸好DNA不使用碱基U,这样的突变一旦发生就会立刻暴露出来。今天的细胞都有一套精密的DNA修复系统,会沿着DNA不断巡查,把所有的U统一改成C,就能纠正这种错误了[5]。
1700260666
1700260667
对此,一定会有读者提出这个问题:细胞何不干脆放弃碱基U,无论DNA还是RNA,一律使用T,不就一了百了了吗?这是因为,RNA并不害怕这样的突变,倒是很厌恶那种纠错机制。
1700260668
1700260669
在今天的细胞里,信使RNA的寿命非常短,通常来不及突变就已经降解了,偶尔发生一次,遗传密码也有相当大的容错能力,未必影响到最后的蛋白质,即便破天荒地产生了一个严重错误的蛋白质,细胞还有精密的蛋白质回收机构[6],能把这个坏掉的蛋白质及时水解。
1700260670
1700260671
1700260672
1700260673
1700260674
图4—24 碱基C在水中自发脱氨基,变成碱基U。(作者绘)
1700260675
1700260676
1700260677
1700260678
1700260679
图4—25 碱基C突变成U以后仍能与G配对,只是少了一个氢键,错开了一点。(作者绘)
1700260680
1700260681
转运RNA与核糖体RNA的功能主要来自二级结构,也就是碱基之间的互补配对。但是,我们一直以来默认的那种“碱基互补配对原则”并不是唯一的,C可以与G配对,变成U之后照样可以配对,所以对于已经形成二级结构的RNA来说,C-U突变几乎不会有任何影响。
1700260682
1700260683
细胞之内除此之外的其他RNA尺寸更小,寿命更短,突变概率更低,所以,总的来说,RNA的C-U突变根本不用处理。
1700260684
1700260685
但是,如果有一套修复系统要在RNA链上不断巡逻,纠正这些错误,那反倒坏了事。因为RNA要参与各种活跃的生化反应,实在忙得很,中间突然附着上一个巡逻员,必然碍手碍脚。而且巡逻员既然要巡逻,势必要解除RNA的三维结构,把它抻直成一条线,好把碱基序列完全暴露出来。这下,RNA的武功算是全废了,什么生物活性都没了。更何况细胞要制造这些巡逻员出来还得消耗大量的氨基酸与能量,在RNA这种消耗品上折腾纯属柴火棍上雕花,卫生纸上刷漆。
1700260686
1700260687
更根本的是,今天的细胞并没有单独合成DNA单体的能力,我们都是先合成A、U、G、C四种碱基的RNA单体,再给它们的核糖脱氧,变成A、U、G、C四种碱基的DNA单体,最后再给碱基U的DNA单体加上一个甲基,变成碱基T的DNA单体。这整个过程中都没有碱基T的RNA单体,那么作为单体的聚合产物,RNA序列也当然绝少有T了[7]。
1700260688
1700260689
这个代谢过程强烈暗示了这样一件事:细胞最初只有RNA,后来才在此基础上加工改良,产生了DNA。如果你还记得序幕的两篇“延伸阅读”,也应该会记得改造旧结构产生新功能正是进化最擅长的事情。在RNA世界假说的诸多依据里,这也是非常重要的一个。
1700260690
1700260691
总之,把RNA变成DNA,把U换成T,细胞获得了空前的基因组容量和遗传稳定性,进化又将进入一个全新的阶段了。
1700260692
1700260693
可那个问题又来了:进化为什么会进入这个全新的阶段呢?
1700260694
[
上一页 ]
[ :1.700260645e+09 ]
[
下一页 ]