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[3]严格地说，只有雌蕊和雄蕊才是特化的孢子叶，花瓣、花萼等只是特化的叶——当然，孢子叶本身也是特化的叶。
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[4]叶发育成新植株的情形比较罕见，这一方面是因为叶中保留的分生组织比较少，分布零星，另一方面是因为叶中存储的营养也比较少，不足以维持分生组织的旺盛代谢。所以在自然环境下，只有少数叶片肥厚，或者生活在水中的植物才把叶当作营养繁殖的器官。但如果是在实验室的培养基上，叶片就很容易发育成新的植株，甚至某些已经高度分化的植物细胞也能脱分化（去分化），重新发展成分生组织，进而发展成新的植株。
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[5]种子植物和蕨类植物合称“维管植物”，维管植物和苔藓合称“有胚植物”，有胚植物和轮藻合称“链型植物”，链型植物和绿藻统称“绿色植物”，也就是狭义的植物界，植物界与红藻、灰藻等几个小类群合称“泛植物”，也就是广义的植物界。
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[6]苔藓的再生能力非常强，园艺上如果要种植苔藓，可以把苔藓用搅拌机打成糊糊，与尿之类的营养液混合均匀，一泼就行。
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[7]刺胞动物门原本叫作“腔肠动物门”。但我们后来发现栉水母只是长得像水母，实际上根本不是水母，也不属于这个门，所以把栉水母拆分出来，成立了一个“栉水母动物门”，剩余的腔肠动物门就该叫“刺胞动物门”了。
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[8]刺胞动物门并不是只有珊瑚能够永生，它们的“水螅体”普遍不会衰老，珊瑚只是水螅体最著名的代表。在这里，所谓“水螅体”，是刺胞动物门的一个“生活世代”，它与“水母体”的循环就是刺胞动物门的完整生活史：水螅体可以无性生殖（出芽生殖）出更多的水螅体，也可以无性生殖（断裂生殖）出水母体；水母体只能有性生殖，它们制造的受精卵会孵化水螅体。但并不是所有的刺胞动物都有这个完整的循环，比如珊瑚就没有水母体世代，它们可以直接有性生殖，制造更多的水螅体，也就是珊瑚；而大型的钵水母没有水螅体世代，它们有性生殖的产物就是新的水母。
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[9]所以这三个门都属于一个被称为“触手冠动物”的类群。
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[10]脊索动物门的尾索动物亚门是与脊椎动物关系最近的一个类群，包括海鞘纲、樽海鞘纲、尾海鞘纲三个纲。本文所说的海鞘包括了海鞘纲和樽海鞘纲的物种，它们个体发育早期酷似蝌蚪，有带脊索的摆动的尾巴，但会在变态发育中丢失脊索，变成酷似珊瑚虫的样子。
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[11]当然，我们不可能真的统计这几百代以来的每一个细胞，因为2¹⁰⁰ 是个惊人的数字，就算把整个银河系都做成硬盘也存不下那么多细菌的统计数据。
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[12]原核生物的DNA是环形的，无头无尾，当然就没有下文的一切问题了。
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[13]真核生物的端粒酶进化得非常复杂，由多个基因合作制造。比如人的端粒酶就包括了端粒酶RNA（hTR）、端粒酶结合蛋白（hTP1）和端粒酶活性催化单位（hTERT）等，它们每一个都有各自的基因，并处于不同的染色体上。
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[14]生物学规律几乎必有例外。有些生物的有些细胞会在分化之后真的丢失那些已经关闭的基因，比如线虫的体细胞；有些生物存在局部的多倍体细胞，比如被子植物的胚乳是三倍体；还有些快速分裂的细胞会发生无丝分裂，这使得两个子细胞的染色体不能均等分配，比如蛙的红细胞。但请不要纠结这些细节，它们并不影响讨论。
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[15]珊瑚大部分的营养来自组织间共生的虫黄藻的光合作用，其次来自水流带来的有机碎屑。海绵也一样，但是后者占的比例更大。
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[16]这里是指寄生性的植物或真菌。比如菟丝子（Cuscuta chinensis）是寄生在植物上的植物，天麻（Gastrodiaelata）是寄生在真菌上的植物，茭白是菰黑粉菌（Ustilago esculenta）寄生在植物上的产物。
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[17]哺乳动物在胎生过程中，来自母体子宫内膜的细胞可能混入胚胎，并留在胚胎体内，但请不要纠缠这样的偶然细节。
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生命的起源：所有生命的共同祖先在40亿年前是怎样诞生的？ 增章二生命的麦克斯韦妖
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*建议没有生物化学基础的读者在读完正文之后阅读这则增章。
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在正文的第四章，我们遇到了一个有些眉目，却又解决得没那么透彻的问题——生命因为汲取负熵而持存，不论这句话怎样表述，但是，生命是怎样汲取的负熵呢？
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后来，我们又说生命是一个控制系统，它的控制对象是它的自身，那么，生命是怎样的控制系统，又是怎样控制了自身，怎样维持了自身的持存呢？
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这两个看起来很不相同的问题，其实是同一个问题。在第四章里讨论控制系统的时候，我们已经简单透露了这则增章的结论，现在让我们把这个结论说得更详细一些，它包括了下面这样两个部分。
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首先，生命作为一个控制系统，会控制构成自身的所有物质，使它们维持恰当的位置和状态，所以，只要生命的控制功能足够准确，构成它的物质就不会陷入混沌，生命就会持续存在。用薛定谔的话说，就是“维持在非平衡态上”。
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但是，一个控制系统要在保证精度的同时持续运行，就必然向周围耗散能量，给环境带来熵增。考虑到这些控制行为削弱甚至扭转了自身的熵增趋势，维持了自身的低熵状态，那么它的控制效果就将会体现为持续不断的“汲取负熵”。
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在接下来的故事里，我们会在上下半章中分头讲述这两个部分。不过，考虑到“控制系统”是一个既陌生又抽象的概念，这则增章余下的部分将会用“计算”这个更加熟悉的概念代替“控制”，用“计算机”这个更加具体的概念代替“控制系统”，问题会因此清晰很多——这就如同面对看不透的平面几何问题，数学老师往往会建议你画一个直角坐标系，把它转化成解析几何，用更加熟练的代数方法破解它。
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