1700265890
1700265891
制造生物燃料、帮助改善干细胞生物学，这些都是合成生物学。如果你能改变人们的体细胞，你并不一定要从生殖细胞系开始，那样风险更小；还可以让你做出更多的快速原型，并且减轻人们的担忧。生殖细胞系是一类特别令人担忧的事物，如果你要从它开始改造人体细胞的话你能做的事情很少，实际上在某种方式下你本来可以做更多，因为要预测某人从一个受精卵会变成什么样子是很困难的，但是预测他们在30岁时会是什么样子就容易一点。这其实不是预测，这只是观察。也许修复要更难，但是至少你会开发出工具，而且你也会变得更加小心谨慎。
1700265892
1700265893
我们已经取得了大量进展，现在我们可以建造更多的多能细胞，比如说从哺乳动物的皮肤细胞中建造多能细胞，这就使得合成生物学朝那个方向前进。甚至我们有一些项目是国家科学基金会资助的，联合了伯克利大学、加州大学旧金山分校和麻省理工学院，去改变细菌的细胞结构，与哺乳动物的免疫系统相容，所以它们就能在你的血液里运动。比如说，它们可以导向目标追踪肿瘤。它们可以感知到自己在场，当它们靠近一个肿瘤时就会比平时专注1 000倍，它的所有部分在工作，但是整体并没有工作，它们会感知它们在那里，并通过作为一个具有入侵性的蛋白质去入侵那个肿瘤细胞，然后把药物留在那个肿瘤细胞里面，从而摧毁它。这种能力，在哺乳动物的免疫系统里运作得很好，其工作范围从利用你自己的与免疫系统完美相融的细胞，延伸到利用那些被改变了结构的细菌细胞。
1700265894
1700265895
我还可以说很多事情，但是它们可以更轻松地在提问时被说出来。但愿我提出了足够引人深思的观点，好让你们提出有趣的问题。
1700265896
1700265897
约翰·布罗克曼：你们的工作和文特尔的有什么不同？
1700265898
1700265899
乔治·丘奇：他的工作产出率更高。
1700265900
1700265901
克雷格·文特尔：我使用的是丘奇的技术。
1700265902
1700265903
乔治·丘奇：好吧，他实在是太好了！我们开发了为大多数企业服务的技术。通常我们都会试图让其他机构可以自己去生产。我将创办一个公司或者与一些基因组学研究中心合作，去实现我们的测序或合成技术。从一个综合的视角来看，我们的工作最主要的区别是，文特尔对从零开始创造一个合成基因组没什么兴趣；而我们主要的兴趣就是在基因组上做变异，我很肯定，文特尔和我交换领域去做研究的话，我们也很乐意。
1700265904
1700265905
他提到说制造100万个染色体的组合。其实，我们也在做这个，比如，我们在实验室研究进化，我们让上百万个染色体相互竞争。你可以通过自发地重新组合每一个碱基对来完成，这样你每次只能获得一个变异。用这种方式我们逐步获得了3或4次变异，或者我们做定点诱变，而且我们使用了一种新的自动化的方式来这样做。我们可以在9天之内获得一系列的23个变异，一次一个，直到做300天。
1700265906
1700265907
还有一件有趣的事情，文特尔想要做的某种事情正是我们现在着手做的，就是建造一个镜像的生物学世界，从DNA聚合酶开始做起，这在某种含义上是说，它需要从比合成生物学更基础的层面上开始做起。我们这一类合成生物学家会用细胞来做基因的聚合酶链式反应（PCR），这依赖于生命本身。
1700265908
1700265909
文特尔和我将从核苷酸里合成基因，那基本上只依赖于知识和少量手性碳原子，但是如果你确实翻转了手征性，你就真的接近于处理原子了。
1700265910
1700265911
塞思·劳埃德：你们这样做是出于安全的原因吗？
1700265912
1700265913
乔治·丘奇：没错，对每一件那样的事情，我们都应该问自己，我们为什么要这么做。我们要做分子的原因很明显，我们要做干细胞和制药的原因也很明显。出于安全的原因，我们在正常的手征性里改变基因密码，从而增加氨基酸的数量。在每一个那样的案例里，你必须以某种方式保证手征性不变，因为改变手征性就会让它与其他部分不相容，但是那也会使它变成更大或更小的威胁，这取决于你要做的其他事情。它可能会变成更大的威胁，因为现在它不仅排斥噬菌体，还排斥酶，像蛋白酶和核糖核酸酶，而且抗体也包含在内。现在，如果你放入一个镜像细胞，你会获得一个新抗体，这不是问题。
1700265914
1700265915
当然安全性一直是我们感兴趣的，而且也是合成生物学和密码子设备公司的一个主题，除了对安全性的考虑，我们对它感兴趣的另一个原因是，比如说，你可以根据你所喜欢的方式来让DNA和RNA分子进行进化。从某种意义上说，这就是从零开始产生形态：你创造出一个完全随机的对多核苷酸的选择，你可以根据你所喜欢的外观或分子来创造它。在某种程度上，你并没有定义那个外观，而是从一个随机集合里发现了它。这就接近于我们想要获得的结果了。当你在实际操作中利用它们时，它们就会降解为生物流体。由于你是完全从零开始的，你并没有任何预先形成的陈规，你只是通过有限的选择来指导进化，你可以从一个镜像氨基酸集合开始做，这个集合像是一座图书馆，其中囊括了数万亿分子，你会在里面发现自己喜欢的分子，并且它对酶有抵抗力。这是我们最早决定创造时的一个动机，第一次我们创造出了DNA聚合酶。我们想做出镜像聚合酶链式反应，这样你就能够用一个聚合酶放大DNA。一位博士后已经仔细检查了一个中等规模（含有353个氨基酸）的原型聚合酶，他全部完成了，其中有4个缩氨酸黏合在一起了。所以我们即将获得第一个聚合酶。
1700265916
1700265917
镜像核苷酸的部分很简单，因为你可以利用同样的机器去做镜像DNA。比起DNA合成机器，缩氨酸合成机器要原始得多，所以很多工作还要靠手去完成。但是，既然我们可以制造镜像DNA，接下来的目标就是制造镜像蛋白质，我们要重新开始制造所有的核蛋白体，我们认为这是有用的事情。比起制造DNA聚合酶，这大约要多做25倍的黏合工作。但是，像文特尔说的那样，25倍的规模扩张并不是很大的工程。在基因组计划里，比起刚开始的时候，我们现在基本上已经扩张了十万倍。而现在我们讨论的是要制造出很多基因组。我想我们将能制造出一个镜像DNA聚合酶和核蛋白体，这样你就能在此基础上直接在计算机上给它编程了。一旦你完成了所有这些工作，你就可以开始制造镜像蛋白质了。
1700265918
1700265919
克雷格·文特尔：这里有一个很大的前提条件，就是所有这些镜像产物要与原始对象的活动是一样的。
1700265920
1700265921
乔治·丘奇：它们的行为会是镜像活动。
1700265922
1700265923
克雷格·文特尔：在另一个手征性分子上会有镜像活动。这有任何证据吗？
1700265924
1700265925
乔治·丘奇：有证据，但只有少量证据。我反而倒希望没有，这样的话功劳就全是我们的了。但是我想艾滋病蛋白酶一直是以镜像形式被创造出来的，而且抑制它的事物也被证明是以镜像形式产生的。现在我们在这方面已经小有成果了。而且晶体学已经证明，组成镜像单元体的镜像的聚合物是被翻转过来的。几乎每一次我提到这件事，总有一部分人感觉不是这样的，还有一部分人就会说：“请你对此作出证明！”这两种态度我都乐于接受。
1700265926
1700265927
迪米特尔·萨塞洛夫：但这给我带来了一个问题。当你说合成生物学的时候，你感觉在未来几年之内，事物将会向文特尔所说的“从零开始的生命”的方向进化。你是否认为在这条路上会有一个明显的分水岭，或者它会逐渐地到达那里？
1700265928
1700265929
乔治·丘奇：我基本可以确定这将是渐进式的。在这个过程中将会有很多个里程碑。当然，文特尔曾在《科学》上发表的文章《细菌里的基因组移植》（Genome Transplantation in Bacteria）就是一个里程碑。当他把这个方式应用到合成生物学上时，那又将是一个里程碑。如果我们在手征性形式里获得合成核蛋白体的话，这又会是另一个里程碑。将会有很多个里程碑，但是每一个里程碑，你都可以发现它和最近进展的一些事物渐进相似。
1700265930
1700265931
迪米特尔·萨塞洛夫：你认为，并不需要跨过一个大鸿沟，你们就能实现吗？
1700265932
1700265933
克雷格·文特尔：这个大鸿沟就是利用无生命的物体并从中获取生命，这就是一个障碍，一旦能跨越它，实现我们所说的事情就相对会快很多。它必然会在某处被跨越。理智地说，它并不是一个鸿沟，但是在实现之前，在概念上，这是一个巨大的鸿沟。
1700265934
1700265935
乔治·丘奇：就像无论是从二氧化碳还是核酸糖里获取原子，那几乎是哲学上的问题。但是我看到大多数鸿沟都是实践方面的。这个领域越有实用性，将会发展得越来越快，而且“收益成本风险”的比率越高，人们就越不会去抗拒它。大多数人都能接受进化，甚至神创论者也能接受微观进化。如果我们开始在实验室里进行宏观进化，那些人也会在一定程度内接受。如果它不是在实验室里被证明的话，那么你可能会说“我不关心”或者说“证明出来”。现在，你可以论证说，虽然有些事情不能这样，但是宏观进化是可能的，当然我们正在做一流的微观进化。现在很多公司都依赖于结构上很惊人的变化来，但是，你可以说，他们在这个进程中某个地方拥有智能设计。但是我认为，设计的智能性越低，进化就越宏观，就会有越多人接受。
1700265936
1700265937
约翰·布罗克曼：你能从“愚弄人类基因组”和“玩弄上帝性”的角度，讲讲生物开放创造实验室（biofab lab）和它们的自我复制的本性吗？
1700265938
1700265939
乔治·丘奇：你当然不能创造出一个宇宙，你只是在建构事物，这个实验室在很大程度上是所有其他工程学科的延续，包括土木工程、电子工程、力学工程和化学工程。让人感到很讽刺的是，当这个术语被创造出来的时候，基因工程其实并没有被大多数工程师当作一门工程学科。他们现在认为，或者说他们中有部分人认为，这场革命终于使它变成了一门工程学科，其中有很多可交替的部分，包括等级设计、互通性系统和规范表这类东西。这些都是只有工程师才会热爱的装备。
[
上一页 ]
[ :1.70026589e+09 ]
[
下一页 ]