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·每层中每个神经元的输入数量，各个神经元的、各个网络层的输入的数量（即神经元间的连接）可互不相同
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·真正的“线路”（即连接）。对于每一个神经元、每一层来说，这包括一系列神经元、形成该神经元输入的其他神经元的输出，这代表着设计的关键。设置方法有许多：
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i）随意连接神经网络
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ii）使用进化算法（见附录中的下一部分）决定最佳连接
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iii）使用系统设计者的最佳判断来决定连接法
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·每个连接的初始突触强度（即权值）。设置方法有许多：
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i）将突触强度的值设置一致
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ii）将突触强度随意设置为不同值
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iii）使用进化算法来决定最佳初始值
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iv）使用系统设计者的最佳判断来决定初始值
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·每个神经元的阈值
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·输出的决定。输出可以是：
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i）第M层上神经元的输出
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ii）单个输出神经元的输出，这些神经元的输入是第M层上神经元的输出
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iii）第M层上神经元输出的函数（即总和）
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iv）多个层次当中神经元输出的函数
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·决定训练神经网络过程中所有连接的突触强度如何修正。这是一个关键的设计决策，也是大量神经网络研究和讨论的主题。设置方法有许多：
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i）针对每一次识别实验，通过（通常是较小的）固定的数量增加或减少每一个突触的强度，从而使神经网络的输出更接近正确值。其中一种方案是试着同时增加和减少突触的强度，从而比较哪种方法的影响较好。也许这样做比较耗时，所以还有其他针对是否要增加或减少每个突触强度的方法来做本地决定
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ii）还有其他统计方法可以在每次识别测试后改善突触强度，这样实验中的神经网络可以更接近正确答案
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要注意，即便训练测试的答案并不完全正确，神经网络训练也会起作用。这样就可以使用有固有误差率的真实数据进行训练。基于神经网络识别系统取得成功的关键因素之一，就是训练使用的数据量大小。通常，要得到令人满意的结果，就需要大量的数据。就好比人类学生，神经网络在学习课程上所消耗的大量时间是其性能的关键
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变量
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上述很多变量都是可操作的，这些变量包括：
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·如上文所述，有很多不同方式构建拓扑结构，尤其是神经元之间的连接可以随机设定或是用进化算法来设定
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·如上文所述，有许多不同方式来设定初始突触强度
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·第i层上的神经元输入没必要全部来自第（i–1）层，每层神经元的输入可以来自底层或任意层
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