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3．细胞凋亡
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1990年Rumore等人发现系统性红斑狼疮患者循环血浆中DNA大约为150～200、400、600和800bp, 接近细胞凋亡过程中释放出的电泳图呈梯形的寡聚核苷酸DNA。1994年Emlen和Joamn发现系统性红斑狼疮患者外周淋巴细胞在体外凋亡加速，活动期患者淋巴细胞凋亡快于非活动期患者，推测凋亡细胞释放到细胞外间质中的完整核小体可能作为自身抗原驱动自身免疫反应。
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类风湿关节炎是另一个典型的自身免疫性疾病，其病理特征为滑膜增生。1994年，Mounts提出滑膜细胞增殖与细胞凋亡障碍有关，引起人们广泛的注意。
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4．组织相容性抗原
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在自身免疫病的发病机制中，一般认为具有某种特定空间构型的组织相容性抗原分子是外源或自身抗原的载体。T细胞受体识别抗原多肽与组织相容性分子结合形成多肽——组织相容性分子复合物，引起一系列自身免疫反应而导致自身免疫病。1978年Stastny首次报道了类风湿关节炎与HLA-DR4相关，进一步的研究发现在以色列犹太人、希腊人、部分亚洲印度人群中类风湿关节炎与HLA-DR4无相关性，而与HLA-DR1、HLA-DR10或HLA-DR6有相关性。Nepom等还发现在白人中，表达两个疾病相关HLA-DRB1*04等位基因的个体发展成临床类风湿关节炎的危险性比表达一个疾病相关HLA-DRB1*04等位基因的个体约高5倍。从临床上看，具有两个致病基因的患者的疾病进展快，关节破坏严重，都有关节外表现，说明致病基因有“剂量作用”。新的疾病易感基因定位正在进展中。
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5．神经—内分泌—免疫网络
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大量研究证明神经、内分泌和免疫系统之间信息交流的存在。控制产热、行为、睡眠和情绪的神经靶位点受到感染过程中激活的巨噬细胞和单核细胞分泌的炎症性细胞因子影响。在中枢神经系统内的大脑损伤、细菌和病毒感染、神经退行性变过程中也已经发现各种细胞因子的产生。神经内分泌系统可通过诸如脾、胸腺、淋巴结等免疫器官内的交感神经和感觉神经元的支配来直接调节免疫系统。例如，2/3的大鼠肠黏膜的肥大细胞与表皮下多肽神经元密切接触。交感神经系统直接参与机体免疫功能的证据还来自于交感神经切断术和大脑某些特殊部位的损伤都能加强和（或）减弱免疫反应。例如下丘脑部位的精确的切割可引起大颗粒淋巴细胞数量的减少。已经发现下丘脑前叶的切割与免疫反应性降低有关。已知垂体切除术能损害机体的体液免疫和细胞免疫功能。这种损害又能通过一些诸如催乳素或生长激素等神经调节性的介质作用而得到纠正。已经发现，大鼠和小鼠的垂体切除术能抑制体液免疫的抗体产生，延长移植物生存时间，减少淋巴细胞增殖，减少脾脏自然杀伤细胞活性以及阻止佐剂性关节炎的发生。机体免疫器官的神经支持需要局部存在高浓度的神经肽和其他神经介质，这样才能与表达于免疫活性细胞上的受体相互作用。有人还观察到免疫活性细胞进入神经系统的过程。单核细胞、巨噬细胞和T细胞能够通过血脑屏障。巨噬细胞作为大脑的小胶质细胞能存活相当长一段时间，并且大约占到胶质细胞总量的10％。激活的T细胞如果与中枢神经系统的抗原起特异反应，则能停留数天。许多不同的刺激物能诱导星状胶原细胞、小胶质细胞和寡树突状细胞（oligo dendrocytes）表达MHC分子。这些细胞能提呈抗原并成为细胞毒性T细胞的靶细胞。已经发现，在免疫反应和炎症反应部位存在一些达到具有生物学功能浓度的神经肽。许多不同种类的分子，包括细胞因子、神经激素、神经递质和许多非肽类介质与神经免疫系统的信号通路的放大、协调和调节有关。这些物质似乎不但作用于经典的神经内分泌靶细胞，而且还作为机体免疫系统的内源性调节剂，作用表达免疫细胞的受体并且具有自分泌和（或）旁分泌功能。
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已经证明，外周血循环中的免疫活性细胞是一种流动着的神经调节剂的源泉。这些调节剂分子能达到机体内几乎所有类型的细胞。大多数内分泌腺都含有大量的淋巴样细胞。例如，这些淋巴样细胞可以占肾上腺所有细胞总数的20％。然而，许多免疫系统中经典的细胞因子可以由许多不同的包括神经元和胶质细胞在内的脑细胞产生。免疫反应中神经激素的作用早已为人知，尤其是糖皮质激素的免疫抑制作用已得到广泛的应用。在鼠类肾上腺产生皮质酮以及在人类肾上腺产生可的松都是受ACTH刺激的结果。垂体切除能引起肾上腺萎缩，因为肾上腺依赖于垂体分泌的ACTH。皮质激素的含量升高能抑制垂体ACTH的分泌，而且同时关闭特异性下丘脑释放因子的产生，这正是调节垂体激素合成的机制。IL-1可抑制这些细胞产生催乳素。当静脉注射IL-1时，抗促皮质激素释放因子的抗体能封闭皮质类固醇激素的诱导产生。ACTH的合成增强可引起皮质类固醇的产生增多，继而引起巨噬细胞减少IL-1的产生。已经证明，IL-1也是神经分化因子和神经指导因子的诱导剂。这些因子能改变特殊神经元神经递质类型的利用。
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临床上免疫紊乱性疾病中的一些神经内分泌介质的改变可能在发病机制中起着重要作用。正由于这些重要作用以及临床上使用单纯免疫抑制剂收效有限，我们有理由相信这将为今后探索免疫紊乱性疾病的发生机制提供新的研究方向，伴随而来的有关神经肽、内分泌肽拮抗剂的研制也将为某些免疫紊乱性疾病的治疗展示新的前景。
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（三）新病种不断发现
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由于有了许多风湿病特异而又敏感的试验方法，因此新的病种不断被发现。夏普（Sharp）1971年建立了抗RNP抗体检测方法，发现一种当时认为新的风湿病，即现在所谓的混合结缔组织病（mixed connective tissue disease, 简称MCTD)。舒曼（Shuman）于1974年通过临床和免疫学研究发现一种需与进行性系统性硬皮病仔细鉴别的新风湿病即伴有嗜酸粒细胞增多的弥漫性嗜酸性筋膜炎。从20世纪50年代在非洲大陆发现获得性免疫缺陷综合征，称之为艾滋病（AIDS）以来，该病在非洲大陆迅速蔓延。同时随着国家间往来增加，直到现在仍然呈无法控制的态势并向非洲以外世界各国蔓延传播。随着我国对外开放30多年来，与国外交往日益频繁，艾滋病在我国迅速蔓延，我国艾滋病的发病率呈快速增加。艾滋病是一种慢病毒感染性疾病，由于体内长期持续形成抗原抗体复合物，以及组织受免疫缺损病毒（HIV）感染后，其抗原性受到修饰，体内继发自身免疫异常，从而引起自身免疫性病变，出现骨关节病、干燥综合征的特征。故20世纪90年代以来由艾滋病继发风湿病症状群日益受到人们的重视，它与慢性肝炎病毒感染继发引起风湿病症状群一样，严重危害着人们的健康及生存，这是我国医务工作者必须引起高度重视的问题。像艾滋病一样，近年来梅毒在我国呈急剧上升趋势，由梅毒引起的骨关节病及心血管病也必须引起医学工作者的高度重视，这样既有利于患者的及时合理治疗，又有利于风湿病专业工作者的鉴别诊断。
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（四）新检查和诊断手段不断出现
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1．诊断抗体
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1982年Davies等首先从局灶性坏死性肾小球肾炎患者血清中发现抗中性粒细胞胞浆抗体。1989年Falk等用乙醇固定的中性粒细胞作底物，用免疫荧光法测定ANCA, 发现有两种染色类型。抗Sa抗体是1992年由加拿大学者Despres首先从一个名为Savoie的患者血清中发现的，它在类风湿关节炎患者中的阳性率为7％～61％，特异性为94％～98.9％。它在疾病早期出现，对疾病的早期诊断有帮助。由于自身抗体的产生导致多个系统损害。一般情况下SLE中的某些自身抗体在SLE症状表现之前的很长时间就已经产生。如88％的患者在SLE诊断之前的3.3年，血清中至少出现过一种自身抗体，如抗核抗体（ANA)、抗磷脂抗体、抗Ro和抗La抗体出现在诊断SLE前的3.4年出现，抗 ds-DNA抗体在SLE诊断前的2.2年出现。抗Sm和抗核核糖核蛋白抗体则在诊断前1.2年出现，是最晚出现的先兆性抗体。一旦确立SLE的诊断，某些自身抗体可以作为疾病活动性或器官特异性表现的标志。狼疮性肾炎的患者硫乙酰肝素（heparan sulphate, HS）活性显著增强；SLE活动期及狼疮性肾炎的患者抗核小体抗体明显增高。患有SLE的孕妇，抗Ro抗体标识其子女患新生儿狼疮和先天性心脏传导阻滞的危险性显著增加，需要慎重监测。抗磷脂抗体与SLE孕妇流产、胎儿生长迟滞和早产密切相关，这类患者应加强抗凝治疗。另外，处于临床健康状态的孕妇若抗Ro和抗La抗体阳性，则其将来可能患有SLE和干燥综合征。抗磷脂抗体和抗核糖体P蛋白抗体可能是SLE中枢神经系统损害的先兆。
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天疱疮的特征是自身抗体诱导表皮细胞的分离（棘层松解），这些自身抗体主要是针对角质形成细胞桥粒抗原的循环IgG自身抗体。抗桥粒核心糖蛋白（desmoglein, Dsg）3和抗Dsg1自身抗体分别是寻常型天疱疮和落叶型天疱疮的主要自身抗体。研究发现，抗Dsg1抗体在落叶型天疱疮发病前的几个月甚至几年即可检测到；同时，疾病活动性亦与这些自身抗体密切相关。因此，特异性自身抗体可能预示无症状性天疱疮患者。
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系统性硬皮病的特点是组织纤维化、小血管病变以及对多种特异性自身抗体的自身免疫应答。系统性硬皮病疾病的初发起始于皮肤的受累，但亦有研究者认为应将雷诺氏症的出现作为硬皮病病程的起始点。但不管如何定义硬皮病临床症状的起始，自身抗体却在临床症状开始前即已经表达，而且这些自身抗体与硬皮病特异性临床表型密切相关。例如，抗着丝粒抗体与局限性硬皮病和CREST综合征有关；抗拓扑异构酶抗体预示弥漫性硬皮病和重症间质性肺病；抗RNA聚合酶抗体标识弥漫性硬皮病和肾脏损害以及患者预后不良；抗B23（核仁磷蛋白）抗体与硬皮病肺动脉高压有关；抗核纤维蛋白抗体说明患者病情严重，可能出现肌肉和心肺病变；抗PM-Scl（核蛋白复合体）抗体与硬皮病炎症性肌病有关；而抗U1snRNP（核RNA剪接体）抗体则表明硬皮病与其他自身免疫性疾病的重叠。
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2．核磁共振和超声波检查
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普通X像可显示类风湿关节炎的骨侵蚀，有助于类风湿关节炎的诊断和疗效观察，但它的敏感性低，应用价值有限。新的多维影像设备（如核磁共振和超声诊断）可显示软组织和骨骼的早期改变，能够使我们对早期类风湿关节炎的发病机制和治疗反应有更好的了解。一些研究证实，核磁共振可发现早期类风湿关节炎的骨侵蚀，在这一方面，它比X线检查更敏感。在应用静脉对照剂的情况下，核磁共振是一个检测滑膜炎的好方法。核磁共振测定的滑膜体积是一个判定临床活动度的敏感指标。因此核磁共振可用于类风湿关节炎的早期诊断和追踪观察。和核磁共振一样，近年来超声技术在类风湿关节炎中的应用也是热门话题。随着微处理系统、数字成像系统的改善和高分辨率传感器的出现，软组织和骨的超声成像更清晰。初步研究显示磁共振、CT和超声比普通X像更敏感，磁共振和超声敏感性相似，两者均优于CT。
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3．诊断技术和水平的不断提高
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在20世纪50年代，类风湿因子（RA）和狼疮细胞（LE细胞）曾对自身免疫性风湿病的诊断起到重要的推动作用。随着免疫生物学和免疫化学的进展，免疫活性细胞起源、分化和功能，以及免疫调控反应机制的实验研究，充分证实了这些疾病的发生是因机体免疫调节功能失调造成的。免疫化学研究已确定了参与风湿病致病的免疫分子结构、种类和功能，如类风湿因子、补体系统、细胞活性因子及白细胞抗原（HLA）等。免疫荧光技术、免疫电镜技术及单克隆技术的问世及应用，已肯定了造成这类疾病组织损伤的原因是免疫病理改变及致病物质（即免疫复合物），该种致病物质就是由自身抗体、补体及细胞因子组成的。通过免疫化学、免疫荧光技术及免疫电泳技术的综合应用，从而建立了免疫荧光抗核抗体、抗DNA抗体、抗ENA（可提取的核抗原）抗体谱（包括抗RNP、Sm、SSA/Ro、SSB/La、PM-1、Jo-1抗体等）。这就为风湿病的诊断、鉴别诊断及深入研究提供了特异性高的免疫学检查方法，并且对其研究也有巨大的推动作用。应用免疫荧光技术和酶标技术建立抗中性粒细胞浆自身抗体（ANCA）试验方法对韦格内肉芽肿及多种血管炎的诊断提供了较为敏感而相对特异性的血清学检查。该试验检查对于血管炎类疾病的诊断、鉴别诊断起到良好的筛选作用，是对血管炎类疾病研究的灵敏方法，目前国内不少医院开展了该试验。
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医学免疫学研究的不断深化，发现新的细胞因子。就白细胞介素（interleukin.IL）而言，目前已发现30多种，并初步确定了它们各自的生物学功能，进一步确定了其他细胞因子如干扰素、肿瘤坏死因子等的生物效应，同时也阐明了各细胞因子间的相互调节及对整个免疫系统的调控作用，从而深化了对风湿病发病机制的了解，这无疑对风湿病的医疗实践起到良好的指导作用，如应用抗肿瘤坏死因子以及TNF-α单克隆抗体治疗类风湿关节炎，已获得初步疗效。
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近年，由于分子免疫学的建立，发现了一类介导细胞间、细胞与细胞外起黏附作用的细胞表面糖蛋白，它们对胚胎发育和组织分化、正常组织结构的维持、炎症的发生、免疫应答、创伤修复和肿瘤的浸润、转移等多种病理生理过程均具有重要的作用。这类起黏附作用的生物分子称为黏附分子，其种类繁多，目前已知包括选择素家族、整合素家族、免疫球蛋白超家族、钙依赖黏附素等。它们的发现，对指导风湿病临床研究起到了重要的作用。
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由于免疫遗传学的建立，业已肯定了人类白细胞抗原（HLA）对免疫反应具有调控作用。通过大量实验研究和临床研究证实，HLA与许多风湿病有相关作用，如强直性脊柱炎与HLAB27相关，对可疑的病例进行HLA表现型测定，即可辅助诊断。
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（五）新的诊疗方法和观念不断应用于临床
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1．治疗水平的提高
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