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益生菌有很多种形式。现在，很多婴儿配方奶已经添加了益生菌。酸奶和开菲尔发酵乳等乳制品也含有益生菌。另外，日本纳豆、印尼豆豉以及大豆饮料等中也可能找到。益生菌补充剂（粉末、胶囊）一般在保健品店可以买到；对于如何正确使用商业销售的益生菌，儿科医生们还在激烈的讨论中——例如，什么是最佳剂量、服用的最佳频率是多少，还有，到底是否应该用它们来预防或治疗某些疾病？截至目前，没有足够的证据支持应该给重病的孩子使用益生菌，也没有具有说服力的数据推荐在婴儿配方奶中使用益生菌。
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对于大多数儿童来说，虽然含有益生菌的食物偶尔有可能引起轻微腹胀，但它们似乎是安全的。如果益生菌补充剂等产品暴露于高温或潮湿的环境下，这种有活性的“好”细菌就有可能被灭活，当然产品也就无效了。目前来说，如果你有兴趣尝试一下益生菌的话，应该先向儿科医生咨询一下（想了解更多关于益生菌的知识，见此处）。
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一些医生建议，相比益生菌来说，更应该考虑一下益生元。益生菌是一种活的细菌，而益生元是一种不会被消化的食物成分（例如，多糖和纤维素）。它们可以帮助肠道内的有益细菌繁殖，从而在增加肠道里有益菌群数量的同时，抑制有害细菌的生长。它们同样也有可能降低肠道炎症的严重程度，并促进钙质的吸收。
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母乳是一种非常不错的益生元来源。另外，一些常见的食物，例如，麦麸、豆角等豆科植物、大麦，某些蔬菜（芦笋、菠菜、洋葱）和水果（草莓、香蕉）等也是非常不错的益生元来源。
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食物中毒和食品污染
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食物中毒发生在进食了被细菌污染的食品之后。食物中毒的症状基本上和胃肠流感的症状差不多：腹部痉挛性疼痛、恶心、呕吐、腹泻及发热。但如果孩子和其他吃了相同的食物的人出现了相同的症状，那就更有可能是食物中毒，而不是胃肠流感。引起食物中毒的细菌肉眼不可见，而且闻不出、尝不出，所以当孩子将其吃进嘴里的时候并不会意识到。这些病菌微生物包括下列几种。
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金黄色葡萄球菌（金葡菌）
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金葡菌感染是最常见的一种食物中毒。这些细菌往往容易引起皮肤感染，例如，痤疮、疖子等，并且，当感染了金葡菌的感染者接触食物时，就很容易引起传播。当食物放置于某个温度，如37.8℃的时候——总的来说就是一个不足以让食物保温的温度——金葡菌就开始繁殖，并释放出一种毒素，常规的烹饪是无法破坏这种毒素结构的。这种食物中毒的症状会在进食污染食物1～6小时之后开始发作，且不适感一般会持续1天左右。
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沙门菌
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在美国，沙门菌（包括多种亚型）感染是另一种引起食物中毒的重要病因。最常见的污染食物是生肉（包括鸡肉）、生的或没炒熟的鸡蛋、没有经过巴氏消毒的牛奶，以及蔬菜。幸运的是，食物在得到彻底烹饪之后，沙门菌就可以被杀灭。沙门菌引起的食物中毒会在进食污染食物16～48小时后出现，而且往往会持续2～7天。沙门菌感染虽然往往能自愈，但病情也可能会非常严重。所以当你的孩子生病高热时，请速去就医。
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大肠埃希菌
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大肠埃希菌（也叫作大肠杆菌）是一群正常寄生于人体肠道（包括成人和儿童）的菌群。这些细菌中的一部分会引起孩子出现与进食食物有关的疾病。没有烹熟的牛肉是一种常见的大肠杆菌感染源。不过，有时候其他一些生的食品和污染的水源也会引起疾病暴发。
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这种感染的典型症状包括腹泻（严重程度由轻到重不等）、腹痛，少数病例会出现恶心、呕吐。一些大肠杆菌暴发会非常严重，在某些情况下甚至引起死亡。对于大肠杆菌感染的最佳治疗是休息和补液（用以弥补脱水）。如果症状比较严重，你就应该和儿科医生聊一聊了。
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产气荚膜杆菌
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产气荚膜杆菌是一种常见于泥土、下水道以及人类和动物肠道内的细菌。它的传播一般是由准备食物的人直接带到食物里，并在此产生毒素。产气荚膜杆菌常见于校园食堂里，因为这里的食物是大批量烹饪的，并且会在室温环境下，在潮湿的桌子上放置很长时间。最常见的污染食物有烹制的牛肉、家禽、肉汁、鱼、砂锅菜、炖菜以及豆制品和墨西哥玉米饼。这种类型的食物中毒症状会在进食后6～24小时出现，并且会持续1天到很多天不等。
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志贺菌
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志贺菌感染，也叫作志贺菌感染性痢疾，是一种由志贺菌的某种（些）亚型引起的肠道感染。这些细菌可以通过污染的食物和饮水而传染。另外，较差的卫生条件（例如，孩子所在的幼儿园）也会引起该疾病的传播。这种细菌侵入小肠内膜，可以引起腹泻、发热以及腹部痉挛性疼痛等症状。
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志贺菌感染性痢疾及其症状一般会在5～7天后逐渐缓解。同时，孩子也需要多喝水，并且（如果儿科医生建议的话）补充一些防止脱水的液体。对于重症患儿，医生可能开一些抗生素，用以缩短感染的持续时间，减轻感染程度。
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弯曲菌
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有一种感染性食物中毒是由弯曲菌引起的。当孩子进食了生的或没有完全烹熟的鸡肉、喝了没有经过巴氏消毒的牛奶或被污染了的水时，就有可能吞下这种细菌。这种感染最典型的症状是在进食后2～5天出现水样便（有时候是稀薄的血便）、腹痛以及发热。
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为了确诊弯曲菌感染，医生可能要求采集孩子的粪便来做细菌培养及分析。幸运的是，大多数弯曲菌感染的孩子不需要任何治疗就能自愈，你只需要让孩子喝足量的水来弥补因腹泻而丢失的液体就可以了。然而，当症状变得严重，医生就可能会为他开抗生素。大多数情况下，孩子会在2～5天后恢复正常。
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肉毒杆菌
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这是一种能引起致命性食物中毒的细菌。虽然这种细菌就生活在周围的土壤和水里，由它们引起的疾病却非常少见，因为它们繁殖和释放毒素的条件非常苛刻。肉毒杆菌在无氧及某些化学条件下生存得最好，这就解释了为什么一些包装不当的罐头及弱酸性蔬菜（如绿豆、玉米、甜菜、豌豆）最容易被污染。蜂蜜也很容易被其污染，并引起严重的疾病，特别是对于1岁以下的婴儿。所以，千万不要给1岁以下的孩子喂蜂蜜。
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肉毒杆菌侵袭神经系统，可引起复视、眼睑下垂、肌力（肌紧张能力）下降，吞咽和呼吸困难。它同时还会引起呕吐、腹泻及腹痛。症状在进食污染食品后18～36小时出现，并且持续好几周甚至几个月。没有及时治疗的话，肉毒杆菌能引起死亡。即使接受了治疗，也会引起严重的神经系统损伤。
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隐孢子虫
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