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1701067991 第12章曾讲过,大部分生物的细胞都有上百种代谢途径,代谢途径之间相互作用,形成代谢反应网络。巴拉巴西和他的同事仔细研究了43种生物的代谢网络结构,  [241]  发现它们都符合幂律分布——也就是说,是无尺度网络。代谢网络中的节点是化学反应物——化学反应的原料和产物。如果某种反应物参与了生成另一反应物的反应,就认为前者连接到后者。例如,在糖酵解这种代谢途径的第二步,葡萄糖—6—磷酸(glucose—6—phosphate)生成果糖—6—磷酸(fructose—6—phosphate),因此在网络中前一反应物有边连接到后一反应物。
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1701067993 既然代谢网络是无尺度的,就有少数中心节点是许多种反应的产物,涉及许多不同的反应物。结果发现,在所研究的所有生物中,这些中心节点代表的化学物质基本都是一样的——对生命最重要的化学物质。有假说认为,代谢网络之所以演化出无尺度特性,是为了确保代谢的稳定性,并优化不同反应物之间的“通信”。
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1701067995 流行病
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1701067997 20世纪80年代初,艾滋病流行的早期阶段,美国疾控中心(Centers for Disease Control)的流行病学家发现,有一个群体将艾滋病毒传播到了全世界许多城市的男同性恋,这群人中包括一位加拿大空乘——盖坦·杜格斯(Gaetan Dugas)。杜格斯后来被媒体蔑称为“零号病人”,北美第一个艾滋感染者,认为他对艾滋病毒在美国等地的传播负有责任。虽然后来的研究否认了杜格斯是北美的传染源,  [242]  但毫无疑问杜格斯感染了许多人,他承认自己每年都有上百个不同的性伴侣。用网络的术语说,杜格斯是性关系网络的中心节点。
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1701067999 研究性传播疾病的流行病学家经常需要研究性关系网络,这个网络中的节点代表人,边则代表人之间的性伴侣关系。最近,一个由社会学家和物理学家组成的团队分析了瑞典性行为调查数据,  [243]  结果发现得出的网络为无尺度结构;其他对性关系网络的研究也得出了类似结论  [244]  。
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1701068001 在这种情形下,移除中心节点就对我们有利。专家建议,安全性行为宣传、疫苗接种等干预措施应当主要针对这类中心节点。
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1701068003 但是得不到性关系的数据,绘制不出整个网络,又如何能识别出中心节点呢?
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1701068005 另一个网络科学家团体提出了一个巧妙而简单的方法  [245]  :从风险人群中随机选取一组人,让他们每人提供一位性伴侣的名字。然后给这些性伴侣接种疫苗。性伴侣很多的人出现在名单中的概率会很高,从而通过这种方案被接种疫苗。
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1701068007 当然这种方法也可以用到其他场合,用来进行“中心节点打靶”,比如对付通过电子邮件传播的病毒:对于这种情况,杀毒应当重点针对邮件通信录很长的用户的计算机,  [246]  而不是寄希望于所有计算机用户都能查杀病毒。
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1701068009 生态与食物网
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1701068011 在生态学中,食物链的传统概念已经转变成食物网(food web)的概念,食物网中的节点代表物种或物种群;如果物种B是物种A的食物,就有一条边从节点A连接到节点B。图16.1展示了一个食物网的简单例子。
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1701068016 ▲图16.1 食物网示例[图例来自美国地质勘探局阿拉斯加科学中心(USGS Alaska Science Center, http://www.absc.usgs.gov/research/seabird_foragefish/marinehabitat/home.html)]
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1701068018 绘制各种生态系统的食物网一直是生态学的重要内容。最近,科学家们开始用网络科学来研究食物网,深入理解生物多样性以及破坏生物多样性会带来的可能后果。
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1701068020 一些生态学家认为(至少部分)食物网具有小世界特性,其中一些还具有连接度无尺度分布,这种特点可能使食物网在面对物种的随机灭绝时具有一定的稳健性。另一些生态学家则不同意食物网具有无尺度结构,生物学界最近对这个问题有很多争议,  [247]  主要是对如何解读真实数据难以达成共识。
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1701068022 复杂 [:1701064823]
1701068023 网络思想的意义
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1701068025 网络思想对许多科技领域都有影响,前面只是一小部分例子。连接度无尺度分布、集群性和存在中心节点是共同的主题;这些特点使得网络具有小世界的通信能力,并且在随机删除节点时具有稳健性。所有这些特点都有助于理解科学和技术领域的复杂系统。
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1701068027 在科学领域,网络思想为描述自然界复杂系统的共性提供了新的语言,也使得从不同领域得到的知识能相互启发。就其本身来说,网络科学正是它自己所说的那种中心节点——它使得本来相隔遥远的学科变得很近。
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1701068029 在技术领域,网络思想为许多困难问题提供了新的思路,例如,如何让网络上的搜索变得高效,如何控制流行病,如何管理大型组织,如何保护生态系统,如何应对威胁身体中的复杂系统的疾病,如何应对现代犯罪和恐怖组织,以及在更高层面上,自然、社会和技术网络有怎样内在的稳健性和脆弱性,又应当如何利用和保护这种系统。
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1701068031 复杂 [:1701064824]
1701068032 无尺度网络是如何产生的  [248]  
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1701068034 没有谁有意识地将万维网设计成无尺度分布。万维网的连接度分布,同前面提到的所有网络一样,是网络在形成过程中涌现的产物,是由网络的生长方式决定的。
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1701068036 1999年,物理学家巴拉巴西和艾伯特提出了一种网络生长机制  [249]  ——偏好附连(preferential attachment),用来解释大部分真实世界网络的无尺度特性。其中的思想是,网络在增长时,连接度高的节点比连接度低的节点更有可能得到新连接。直观上很明显。朋友越多,就越有可能认识新朋友。网页的入度越高,就越容易被找到,因此也更有可能得到新的入连接。换句话说就是富者越富。巴拉巴西和艾伯特发现,偏好附连的增长方式会导致连接度无尺度分布。(他们当时不知道,这种机制以及所产生的幂律在以前至少被独立发现过三次  [250]  。)
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1701068038 科技文献引用网络的增长  [251]  是偏好附连效应的一个例子。在这个网络中节点是科技文献;一篇论文如果被另一篇论文引用,就得到一条入连接。因此论文被引用的次数越多,连接度就越高。人们一般认为被引用次数越多,论文就越重要;在科学界,这个指标会决定你的职位、加薪等等。不过,偏好附连似乎经常在其中扮演重要角色。设想你和科学家乔各自独立地就同一个问题写了很出色的论文。如果我在我的论文中碰巧引用了你的文章,却没有引用乔的,其他人如果只读了我的文章就很有可能会引用你的文章(经常是读都没读)。其他人如果读到了他们的文章,也会更有可能引用你的而不是乔的文章。局势会越来越有利于你,不利于乔,尽管乔的论文和你的论文质量一样好。偏好附连机制会导致作家格拉德威尔(Malcolm Gladwell)所说的引爆点  [252]  (tipping points)——论文引用、时尚流行等过程通过正反馈循环开始剧烈增长的点。另外,引爆点也可以指系统中的某处失效引发系统全面加速溃败,后面我们将讨论这种情况。
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