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1701074311 现在,Zymergen和Ginkgo两家公司都想在它们的实验室里生产出各种各样的消费品,而这肯定将彻底颠覆整个化工行业。
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1701074316 人类2.0:在硅谷探索科技未来 [:1701070910]
1701074317 人类2.0:在硅谷探索科技未来 我们能用“基因密码”做什么
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1701074319 科学家们对人类的“基因密码”始终充满了好奇和热情,在个人基因组测序变得越来越便捷的今天,我们到底能用这些基因数据做什么——精准预测和治疗疾病?杀死癌症?长生不老乃至返老还童?这些都是人类内心最深处的渴望,这些尝试也都已经开始。
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1701074321 基因测序的“革命”
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1701074323 生物科技领域的创业公司五花八门,各种各样的都有。不过,自人类基因组计划后,个人基因图谱(即通过测定基因序列的方法将个人的基因详尽测定出来,从而获得独立的遗传基因信息)确实吸引了很多资金和人才,2007年5月30日,美国人詹姆斯·沃森成为世界上第一个拥有个人“生命之书”的人。
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1701074325 如今,提供个人基因组测序服务的有四家大的公司,分别是23andMe(最出名的基因组创业公司,也是首个将个人基因组测序商业化并提供给普通客户的公司),Generations Network的Ancestry DNA(2007年10月发布),国家地理(National Geographic)的基因地理工程(Genographic Project,2005年推出)以及Family Tree DNA(家谱DNA,2007年从德国公司DNA-Fingerprint中收购的技术)。
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1701074327 这四家公司目前已有了数百万人的基因标签。23andMe给他们的第一个客户贴上基因标签是在2007年11月,至2015年6月它完成了为第100万个客户贴基因标签的工作。能在短短8年内做到百万级数量,主要是因为基因测序的成本在大幅下降。人类基因组计划(人类基因组的首次分析)用时超过十年,耗费了约30亿美元。如今,23andMe的个人基因组测序服务只需约200美元。
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1701074329 2015年,位于马里兰州的Veritas Genetics,一家2014年由乔治·丘奇创立的公司(该公司在中国杭州也设有研发中心)推出了一项包括个人基因组测序+结果分析报告的“套餐”,价格只需1 000美元。
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1701074331 2016年,拉斯维加斯的Sure Genomics公司(2014年由一群没有生物学背景的人创立的公司)声称,他们能让用户仅通过在家里用唾液采样就可以做个人基因组测序,而且还能获得比23andMe公司的DNA检测更全面的结果。Sure Genomics提供的价格是2 500美元一次,比23andMe高很多。
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1701074333 为什么基因组测试的成本能下降这么多?这个故事略为复杂。但可以肯定的是,首先是因为测序仪器的成本在显著下降。基因测序仪器市场由三家公司主导:基于圣地亚哥的亿明达公司(2007年收购了Solexa的测序技术),位于硅谷的应用生物系统(Applied Biosystems)公司[被赛默飞世尔(Thermo Fisher Scientific)公司2014年收购]和454 Corporation(1999年由乔纳森·罗斯伯格在康涅狄格州创立,2007年被罗氏公司收购)。亿明达公司占有大约70%的市场。
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1701074335 亿明达曾预测,至2020年,个人基因组测序的市场会达到200亿美元。不过,这个预测是在个人基因组预测的费用大幅下滑之前做出来的。2003年,个人全基因组测序的装备价值30亿美元,且只有一个可选项:人类基因组计划。2009年,亿明达的成套测试装备已将个人基因组测序的费用降低到了4.8万美元,至2009年底,大约100个人已进行过个人基因组测序。近几年来,基因测序仪的价格更是不断下降,以至于越来越多的人想要知道自己的“基因密码”。
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1701074337 可以预见,当我们有便携式基因测序仪后,基因测序的下一次革命就会到来。这一天已经非常近了。2012年,牛津纳米孔(Oxford Nanopore)公司[2005年由牛津大学化学生物学教授黑根·贝利(Hagan Bayley)成立]开始测试一个名为Minion的便携式基因测序仪。该仪器很快就被医生们用于“读取”埃博拉病毒的基因组,这种病毒在几内亚肆虐时一度导致2万人死亡。Minion的用法很简单,只需要将它插入笔记本电脑的USB端口,它就能实时呈现读取出来的碱基结果,它甚至比芯片上的实验室(lab-on-a-chip)还要好,它是一个USB上的实验室(lab-on-a-USB-drive),你想带它到哪里都行。
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1701074339 虽然Minion第一版只能在短的基因组上运作良好,还不足以分析像人类基因组那样又长又复杂的基因组。但在不久的将来,像Minion这样的便携式设备会投入市场量产。一位生物学家可以把它装在背包里,带着它到丛林里对一些罕见的动物进行基因测序;警察可以用它快速识别陌生的有机体,用以判断是否是生化武器;NASA还可以让机器人带上它到火星去,寻找其他生命的痕迹。
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1701074341 基因大数据库的缺失
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1701074343 不过,人们关心的还是个人基因组测序目前到底能提供哪些价值?
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1701074345 好消息是DNA检测越来越便宜,普通人已能便捷地完成个人基因组测序。坏消息是它现在确实还并不怎么有用:DNA检测结果目前整体来说并不是“可实用的”(actionable)。比如,它还不能告诉你,根据你的基因信息,你要怎么做才能降低疾病的风险。事实上,目前个人基因组测序的价格往往都是不包含结果分析报告的,23andMe价格最低的个人基因组测序服务自然也不包含数据的“解释”。如今,尽管23andMe的竞争对手已经遍布全球,但这些初创企业里只有极少数可以提供全面的数据分析报告,即那种医疗专家可以帮你做真正有用的疾病预测的报告,而我们现在需要的却是能为“预测”医学服务的个人基因组学。
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1701074347 在“可操作”的个人基因组报告领域,目前有两位领袖企业,分别是来自波士顿的Knome(2007年第一个尝试将人类基因组测序商业化的创业公司,现在是犹他州Tute Genomics公司的一部分)和亿明达。但是,这两家公司对这类分析报告的收费高达1万美元。
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1701074349 你肯定会问,既然暂时并没有什么实际用处,为什么还有那么多人去做?我在硅谷观察到的现象是,大多数从23andMe或Ancestry尝鲜基因测序的人都是为了好玩,更多的是把它当成一种高科技“娱乐”,而不是严肃的“医疗保健”。
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1701074351 比如,如果你想知道自己是否有来自欧洲的祖先,一测便知。很多年轻人将自己进行基因组测序的过程“晒”到网上,觉得这件事本身就很酷。
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1701074353 基因组测序当然还有很多可能的应用。只是现在能实现的更多是“娱乐”罢了。最有用的主要是疾病预测和风险控制,很多人可能想提前知道自己患上老年痴呆症的概率有多大。再比如,来自波士顿的创业公司Good Start Genetics就可以告诉父母,他们未来的孩子患上严重遗传性疾病如囊性纤维化(属遗传性胰腺病)的概率有多大。
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1701074355 为什么看起来如此“高科技”的强大医疗技术暂时只能“被娱乐”?因为科学家们目前对我们的基因跟疾病之间的相关性还了解得太少。你肯定会追问怎样才能了解更多?答案是,这是一个典型的“先有鸡,还是先有蛋”的问题。
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1701074357 科学家们首先需要海量的基因组数据,并且同时拥有“贡献”这些基因组数据的人的疾病档案,有了这些足够的“大数据”(数据样本)之后,才能进一步分析验证特定基因与特定疾病之间的关系,才能找到真正对人类健康极具价值的“基因组密码”。届时,个人基因组应用才能对现有医学进行颠覆性、革命性的改变。问题是,如果个人基因组测试暂时还不能提供真正有用的健康状况分析,靠着“测测你是否有欧洲祖先”这种娱乐性动机,到底还会有多少人愿意主动付费测试?比如,就我个人来说,我想做基因组测序的动机就非常低,觉得“不实用”“不划算”啊!但它之所以暂时“不实用”,又主要是因为像我这样的用户不愿意“贡献”数据(科学家们说,你们先做个人基因组测序贡献数据,我才能提供真正有用的预测分析。大众说,不,你先提供有用的预测分析,我才给你数据)。
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1701074359 不过,如今已经有很多创业公司推出了各种基因组“应用”(APPS)。比如,Helix是位于旧金山的亿明达的分公司,想要创建第一个关于基因信息的“应用商店”,它的想法是,让一个基因APP的用户能够选择将结果分享给其他基因APP,以这种“众包”的方式促进创业公司对个人基因组信息的解读和应用。当你从亚马逊买一本书,亚马逊会根据你的喜好给你推荐其他书。Helix也类似如此,它可以根据你的情况向你推荐其他基因组应用,帮助你了解更多关于自己DNA的信息。
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