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《敬三宝法》一卷
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全名称《明诸经中对根起行浅深敬三宝法》。
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《对根起行法》一卷
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亦作《明一切众生对根上下起行法》，有五段文义。敦煌文书S.2446为此书的残卷，首缺，五段是：第一段，明三阶出世道不同所由义；第二段，明三阶出世处所不同所由义；第三段，明三阶借伴不借伴不同所由义；第四段，明三阶断障不同所由义；第五段，明三阶六法具不具所由义。此为全面概要介绍三阶教教义的重要著作。
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《头陀乞食法》一卷
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亦作《依诸经论略抄出头陀乞食法》。
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《明乞食八门法》一卷
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《诸经要集》二卷
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《十轮依义立名》二卷
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全称《大方广十轮经学依义立名》。《大方广十轮经》八卷，失译，《开元释教录》将其目录附于《北凉录》之中，与唐玄奘译《大乘大集地藏十轮经》为同本异译，是三阶教常用佛经之一。
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《十轮略抄》一卷
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亦作《大方广十轮经人集录略抄出》。
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《大集月藏分依义立名》一卷
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全称《大集月藏分经明像法中要行法人集录略抄依义立名》。
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《大集月藏分抄》一卷
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全称《大集月藏分经明像法中要行法人集录略抄出》。
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《月灯经要略》一卷
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《月灯经》即《月灯三昧经》，三卷，北齐那连提黎耶舍译。
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《迦叶佛藏抄》一卷
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亦作《明一切出家人内最恶出家人断恶修善法如迦叶佛藏经说》。《迦叶经》二卷，北魏时来华的中印度优禅尼国王子月婆首那所译。《佛藏经》三卷，后秦鸠摩罗什译。此为二经摘抄。
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《广七阶佛名》一卷
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也称《观药王药上菩萨经佛名》。南朝宋良耶舍译有《观药王药上二菩萨经》一卷。此为经抄。
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《略七阶佛名》一卷
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敦煌文书中发现多种《七阶佛名经》（或称《礼佛忏悔文》），是三阶教供养和礼佛时用的法仪文字。
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在以上三阶教籍目录中，常有“人集录”字样。在敦煌文书中发现一份三阶教典籍目录，题目为《人集录都目》，除无《明乞食八门法》外，目录全同《开元释教录》卷十八所载者，只不过题目皆用全名。由此可以证明，当初三阶教曾把自己的教籍的全部抄录出来单独流行。此外还发现称作《龙录内无名经论律》的文献，其中载有别的目录中未见的三阶教籍目录，如《两阶发心》、《三阶佛法密记》、《略说禅师本末》等。《三阶佛法密记》有三卷，现从敦煌文书中发现了其上卷，是对《三阶佛法》的注释，里面引用了三阶学僧谂法师之说。这部著作条理明晰，介绍三阶教理比较清楚。