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系统聚类法的核心是距离分类法,将一个样品看作p维空间的一个点,并在空间定义距离,距离较近的点归为一类,距离较远的点归为不同的类。
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下面,先来了解一下关于距离的计算。常见的有关距离计算的公式有以下几种形式。
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(1)绝对值距离
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通过公式表达如下:
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(2)欧氏距离
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通过公式表达如下:
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(3)明科夫斯基距离
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通过公式表达如下:
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(4)切比雪夫距离
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即当明科夫斯基距离在p→∞时,有
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下面将介绍两种常用的系统聚类方法,即最短距离法和最长距离法。
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系统聚类分析尽管方法很多,但归类的步骤基本上是一样的,所不同的仅仅是类与类之间的距离有不同的定义方法,从而得到不同的计算距离的公式。
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下面,通过使用dij表示样品Xi与Xj之间的距离,用Dij表示类Gi与Gj之间的距离。
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Excel统计分析与应用大全 12.1.3 最短距离法
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定义类Gi与Gj之间的距离为两类最近样品的距离,即
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Dij=mindij
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其中,Xi∈Gi,Xj∈Gj
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