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因果式结构中，公文的层次由原因与结果两项要素构成，排列顺序为由因到果或由果溯因。在决定、意见、请示、函等文种中，这种结构方式的使用率很高，如“请示”的内容中，请示的理由与请示的事项构成因果关系。例如北京市委宣传部《关于商请新华社提供首都国庆55周年游园活动照片的函》，大意是：首都国庆55周年游园活动受到中央领导的充分肯定和群众热烈欢迎，为总结成果、留下历史资料，市里准备制作电视专题片、编一本画册。由于游园活动图片是由新华社统一拍摄，现商请新华社提供中央领导参加游园活动图片。以上内容中，前面讲的都是商请新华社提供图片的缘由，最后一句是结果。
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时序式结构是按照事情发生的时间顺序安排层次段落，如《铁道部关于193次旅客快车发生重大颠覆事故的报告》，先写193次旅客快车发生重大颠覆事故的时间、地点和人员伤亡情况，接着写事故发生后组织抢救、抢修情况，再写对这次事故原因的调查分析，然后写为了吸取教训、堵塞漏洞，迅速采取的安全保证措施，最后写对这次事故责任人的处理结果。可以看出，以上结构是按事情发生、发展的先后顺序安排的。
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在多层级结构的公文中，既有横式结构也有纵式结构。横式、纵式可以在一篇公文的不同层级中分别运用，但是不能够在同一层级中交叉运用，后面将具体说明这一问题。
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上面说的是公文结构的组合方式，下面说说层次段落组合的原则。在一个多层级结构的公文中，有大层次、中层次、小层次，如下图：
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这种多级层次结构的组合，必须遵循以下几个原则。
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1．内涵相称原则
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在同一层级的结构中，各层次的内涵应大体相称。借用逻辑学中“子母项”的概念，将大层次作为“母项”，中层次为“子项”，“小层次”为“子子项”……，各个层次一定要“辈分相等”。就是说，“母项”层级中的各项，都应具备“母辈”资格，不能出现“子辈”，比如中层次A1-1不能安排到大层次的层级中；同样，“子项”层级中的各项，都应具备“子辈”资格，不能出现“子子辈”，更不能出现“母辈”，如小层次A1-1-1、大层次A1不能安排到中层次A1-1、A1-2的层级中。否则，便为越级，使文章的层次混乱不清，不能正确反映层次之间的逻辑关系。例如2005年国务院《政府工作报告》的结构：
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一、过去一年工作回顾
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二、2005年工作总体部署
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三、继续保持经济平稳较快发展
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四、大力推进经济体制改革和对外开放
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五、积极发展社会事业和建设和谐社会
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六、加强行政能力建设和政风建设
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七、坚持和平发展道路与独立自主的和平外交政策
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在这个结构的安排上，就出现了各层次的内涵不一致的问题。如，第一个层次说的是全年的工作，是整体性工作；而第三至第七层次，每个层次只是全年中的某一项工作，是局部性工作。显然，将整体工作和局部工作内涵差别很大的层次段落，列在同一层级是不恰当的，有违内涵相称的原则。
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2．层级从属原则
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在多层级的结构中，较低层级中的各层次段落，必须从属于与之对应的上一层次。以子母项来说，某子项必须安排在具有嫡系关系的某母项之下，而非其他母项之下，正如俗话讲：“谁家的孩子谁家抱”。否则，就会造成内容交叉、层次混乱等“血统不清”问题。拿上面的结构示意图来说，中层次A1-1，必须安排在大层次A1之中；若安排在大层次A2之中，虽然辈分不错，但是“血统不清”。例如，《北京市电梯安全监督管理办法》：
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第二章 电梯的生产
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第九条 电梯制造单位应当按照安全技术规范的要求提供相应的随机文件，并保证制造电梯的配件供应。
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第十二条 从事电梯日常维护保养的单位应当做好下列工作：
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第三章 电梯的使用
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