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图2.3 “沈有容谕退红毛番韦麻郎等”纪念石碑
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此碑于1919年被发现，为中国台湾现存年代最早的石碑，目前保存于台湾澎湖县马公市天后宫。（蓝启瑞先生提供）
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韦麻郎被迫离开澎湖8年后的1612年，高等商务员科恩（Jan Pieterszoon Coen）率领两艘船抵达万丹（Banten，印度尼西亚爪哇岛最西端的贸易重镇）后，继续前往雅加达，后来科恩成为荷兰在万丹与雅加达的商馆馆长。
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科恩具有旺盛企图心和战略宏图，他向董事会提出一份要将整个东印度地区纳入荷兰统治的新蓝图3。到印度尼西亚7年后，他被升任为荷兰东印度公司总督，将雅加达定名为“巴达维亚”4，作为公司在亚洲的总部。对于荷兰人来到中国台湾，他任内的决策颇具关键性作用。
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为了要开发巴达维亚，科恩从非洲东岸、印度半岛与锡兰（今斯里兰卡）运来了大量奴工；但是他更属意中国劳力，认为“没有人能比中国人更好地为我们服务”。一方面是因需要劳力，另一方面是荷兰东印度公司董事会一再要求他打开对中国的贸易，而要获得中国生丝，最理想的地点就是与广东省接壤的澳门，于是他决定占领澳门。
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为了对付占领澳门的葡萄牙人与马尼拉的西班牙人。科恩和英国合作，各派5艘船，以日本平户为基地，在台湾海峡与菲律宾之间巡行，以阻止西、葡的船只前往日本贸易，也阻挡中国船只前往马尼拉经商。
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于是马尼拉的西班牙人主张在中国台湾设立基地，以便突破荷兰和英国的海上阻拦，和中国进行贸易。
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科恩得到消息后，为了避免让西班牙人在对中国贸易上先驰得点，很快命令雷尔生（Cornelis Reijersen）组成舰队，攻占澳门或澎湖列岛，并先到台湾寻找良港。
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雷尔生按照科恩的计划，进攻澳门失败后，就直接驶往澎湖马公，并占领澎湖5，同时找了一名熟悉大员情况的渔民当向导，实地勘察后却发现港口不适合大船进入，只好放弃在台湾寻求良港。虽然荷兰人这次没有在台湾停留，却间接影响了日后留在台湾的决定。
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福建巡抚商周祚听到荷兰人占领澎湖，立即要求他们撤出，建议荷兰人改道台湾淡水，还愿意提供引航人员，但雷尔生仍表示要固守澎湖。
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当时荷兰人比较台湾岛和澎湖列岛，觉得除了澎湖的港口更适合让船货转运或停泊的因素之外，对于由巴达维亚、暹罗（今泰国）出航往来台湾与日本的荷兰海船来说，澎湖更是重要的中继站；再者，澎湖列岛距离中国大陆较近，可以阻截马尼拉的西班牙人、澳门的葡萄牙人与中国大陆、日本间往来的商船。就商业据点的选择而言，荷兰人认为台湾岛不如澎湖列岛理想 6。
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于是，雷尔生开始在澎湖风柜尾筑城作为根据地（图2.4、2.5）。以荷兰人当时对澎湖地理位置的认识，却选择了海风非常强劲的风柜尾，这至今仍令人疑惑，因为风柜尾虽然地势可以扼守出入马公湾的船只，却不适合大船避风与货物装卸。可能荷兰人真正属意的还是到中国大陆沿海找寻通商据点，澎湖只是短暂停留之处；而且在商言商，荷兰人采取不卷入当地社会的立场，另一岸的妈祖庙附近为汉人居住、中国官员活动之处，因此据守风柜尾应是不得已而做出的选择（图2.6）。
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图2.4 荷兰人绘制的澎湖风柜尾图
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依据1623年所绘《澎湖港口图》及史料记载，荷兰城堡平面呈正方形，长、宽各约55米，城墙高约7米，其四角正对着东、南、西、北四个方位。城堡每一角上各有外凸的棱堡，其上共安置了29门大炮。（台湾“中央研究院”台湾史研究所翁佳音教授提供）
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图2.5 风柜尾位置图
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图2.6 风柜尾
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左边凸出去的部分是荷兰人建造城堡的所在位置，正中小路靠海小石碑处是荷兰船靠岸、人员登陆之地。对岸即马公市中心。翁佳音教授认为荷兰人在澎湖选择筑城地点，与来台湾后选择地点建造热兰遮城（今安平古堡）有同样的思维模式。
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荷兰的城堡建筑得很“克难”，巴达维亚命令不要盖得太大，以免造成公司财务负担；而且巴达维亚对供应砖石、石灰等建材，态度非常消极，因此大部分建材都是就地取材，通过挖掘现场土石堆成，再用草皮黏固。虽然有些部分是敲凿山上的岩石而成，但整体结构仍相当脆弱；加上澎湖多风雨，城墙经常倒塌，不断填土、用木板固定，仍然无济于事。这座位于风柜尾的“红毛城”可以说相当简陋（图2.7）。
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