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长江下游地区是南方诸政权的核心区域，建邺（建兴元年即公元313年之后改称建康，即今南京）是其政治中心，也是当时最大的城市。因此，现在已经报道的六朝墓葬中，有1/4都集中于南京地区也就不足为奇了[106]。
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南京地区的墓葬可以分为三个发展阶段：吴至西晋时期（公元222～317年）；东晋至刘宋时期（公元317～479年）；以及南朝最后的三个朝代，齐、梁和陈（公元479～589年）[107]。
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许多墓葬的形制在六朝之初（即公元3～4世纪）就已出现，其中明显源自汉代的墓葬形制是一种双室砖墓，有穹隆顶（有的后室用券顶而不是穹隆顶）。这种墓葬中，连接前后两个墓室的只有简单的券门，将宽敞的前室和狭窄的后室相隔；也有的前后两个墓室是完全隔开的，其间以甬道相连，这种墓葬在平面上形成了两段式或束腰的外形（图4.37和图4.38）。面积一般都较大，平均地面面积为11平方米。
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图4.37 南京地区某双室墓平、剖面图
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图4.38 南京地区某双室墓平、剖面图
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另外一种重要的形制是带有甬道的单室墓。在南京，甬道一般位于墓葬的中线上（称之为“凸”字形墓）；而在其他地方，甬道都位于墓室的一侧（即所谓“刀形墓”）。这种墓葬有些是券顶，但大多数是穹隆顶。极少量墓葬还有面积狭小的耳室，不过这种墓葬在逐渐减少。“凸”字形墓的墓底面积平均为8.2平方米，略小于复杂的多室墓（图4.39）。
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图4.39 南京地区某单室墓平、剖面图
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此外，还有一种没有耳室或甬道的长方形墓葬，有券顶，偶尔也用叠涩顶，面积比带有甬道的墓葬要大，墓底面积平均为5平方米。
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还有一种简单的竖穴土坑墓，有的将棺放在砖砌的地面上，不过很少见诸报道[108]。
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这一时期的砖面装饰相对简单，包括压印的绳纹或几何纹、树叶纹以及鱼纹，它们都曾流行于汉代。西晋末期（即公元4世纪早期）开始出现模印的龙、虎和朱雀图案。
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墓葬的其他特征如排水系统，开始只见于大型墓葬，但从公元4世纪早期开始变得越来越普遍。祭台也是如此，通常由几块砖砌成，也在公元4世纪早期始见于中等规模的墓葬里。
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总体而言，这一地区的墓葬较之中原地区更加固守传统，如在中原地区，小耳室在东汉时期就已经不再流行，双室穹隆顶墓在西晋时期已被单室穹隆顶墓所取代，而在南京地区，这种墓葬形制仍在使用。
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在第二个阶段，随着都城迁往南京，北方的影响也变得更加明显，旧式的东吴传统迅速消亡。无论两个墓室都是穹隆顶，还是一个穹隆顶，另一个券顶，这种双室墓都与上述北方墓葬的发展趋势一样，逐渐消失了。带有券顶和甬道的单室墓成为最普遍的形制，尤其中型墓葬表现最为明显，平均面积为8.7平方米（图4.40），墓道变得越来越长，一道木门将其分成两段，墓壁开始外凸，墓室的后部出现砖台[109]。
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图4.40 南京地区某单室墓平、剖面图
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这时的新变化还包括封门的扩大，封门已扩大到墓壁处，高度上超过了墓口，有的封门实际上成了一道护墙。穹隆顶在前一时期即已减少，这一时期更是几近消失，哪怕简单的长方形墓也开始使用券顶。个别还有穹隆顶的墓葬，面积也增大了，平均可达13.8平方米（图4.41），而简单的长方形墓面积要小得多，平均只有4.6平方米。
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图4.41 南京地区某穹隆顶墓平、剖面图
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这一时期的墓内继续使用壁龛，龛内一般放一只碗，很可能代表了长明灯（里面有油和灯芯），在壁龛的下面出现了嵌入墓壁的砖砌假棂窗。排水系统有所改进，棺床更为常见，这点在南京以外地区尤其明显。不过祭台的使用呈减少的趋势。此外，墓砖变小了，但装饰更加华丽；有的大墓中可以看到一些模印着四神或怪兽的墓砖。这一时期，素为考古学家所重的纪年砖变得更为普遍。
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