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复杂生命的起源 术语表
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ATP 三磷酸腺苷的缩写，所有细胞通用的能量“货币”。生命体利用ATP后产生的分解产物是ADP（二磷酸腺苷）和磷酸基团（PO43–）。呼吸作用产生的能量会被用来重新结合磷酸基团和ADP，再次合成ATP。乙酰磷酸是一种更简单的（二碳）能量货币，作用方式与ATP类似。早期地球的地球化学作用可能可以直接合成乙酰磷酸。
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ATP合酶 一种精巧的蛋白质旋转机器。它是嵌在膜上的纳米涡轮，通过膜外质子回流驱动ATP合成。
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DNA 脱氧核糖核酸的简称。DNA是遗传物质，呈双螺旋结构。寄生DNA是指利用生物体的基因组藏身，“自私”地复制自己的DNA。
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pH值 酸度（准确地说是质子浓度）的衡量单位。酸的质子浓度高（pH值低，小于7）。而碱的质子浓度低（pH值高，7～14）。纯水呈中性，pH值为7。
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RNA 核糖核酸的简称。它是DNA的近亲，但是因为有两处微小的差异，结构和性质都有别于DNA。RNA有三种主要形式：信使RNA（转录自DNA的代码脚本）、转运RNA（会根据遗传密码运送指定的氨基酸）和核糖体RNA（充任核糖体机器的部件）。
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RNA世界 一种科学假说中的早期演化阶段，其中RNA同时充任自我复制的模板（如同DNA现在的地位）和加快反应的催化剂（如同现在蛋白质的地位）。
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埃（符号为Å） 一种长度单位，原子的尺寸大约是1埃。具体的换算如下所示：1埃等于1米的一百亿分之一（10–10 m）。1纳米等于10埃，即10–9米。
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氨基酸 一类生物小分子，共有20种，是生命的基础构件。各种氨基酸可以连成一条长链，形成蛋白质分子（一个蛋白质通常由几百个氨基酸分子相连而成）。
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不平衡状态 一种具有反应潜力的状态，分子“想要”互相发生反应，但还没有发生。有机物和氧气就处于不平衡状态；如果机会合适（比如点燃一根火柴），有机物就会氧化燃烧。
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重组 在“流动”的染色体中，某个染色体上的一小段DNA，与另一个染色体上相同位置的DNA互相交换。最终，重组后的染色体会带有位置相同但组成不同的基因（特别是指等位基因）。
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单亲遗传 子代细胞只从双亲中的一方系统地继承线粒体，通常继承自卵子而非精子。双亲遗传是指子代细胞的线粒体继承自双亲两方。
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单源辐射演化 从一个共同祖先（或是单独一个分类门）分化出多个物种的现象，可以用车轮的辐条从轮轴中心发散的结构类比想象。
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蛋白质 由氨基酸串成的长链分子，有严格的序列顺序，由基因中的DNA字母序列指定。多肽是较短的氨基酸链，不一定有严格规定的序列。
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等位基因 一个基因在生物种群中的特定形式。
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电子 一种亚原子粒子，带有一个单位负电荷。电子受体是得到一个或多个电子的原子或分子；而电子供体是失去电子的原子或分子。
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凋亡 细胞程序性死亡。这是一种由基因编码设定的耗能过程，细胞自己降解、拆碎自己，剩下的物质循环利用。
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多态性，方差（variance） 方差是统计学中一组数值分散程度的量度。如果方差等于零，表示所有的数值都相同；如果方差很小，表示所有数值都很接近平均值；如果方差很大，表示这组数值分布很散，彼此差异很大。本书原文中的variance通常用来描述一组同源生物学实体（例如等位基因、线粒体）之间的分布差异，因此一般翻译为多态性。
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多系辐射演化 从数个不同的祖先（或不同的分类门）各自独立分散演化出多个不同物种，就像车轮上不同的辐条，从各自的轮轴中心发散开去。
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发酵作用 发酵作用不是无氧呼吸。发酵作用是纯粹的化学过程，能够直接产生ATP，与跨膜质子梯度和ATP合酶没有关系。不同生物的发酵作用，其反应路径也略有不同。人类发酵作用的代谢副产物是乳酸，酵母则会产生酒精。
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反向转运蛋白 一种“旋转门”式的蛋白质，通常嵌在细胞膜上，用一个原子（离子）进入交换另一个原子（离子）出去。比如，质子（H+）交换钠离子（Na+）。
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放能（exergonic） 反应会放出自由能，可以用于做功的化学反应。放热（exothermic） 反应是会放出热量的化学反应。
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复制 细胞或分子（通常指DNA分子）从一份复制成两份的过程。
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古菌 生物的三大域之一。另两个域是细菌和真核生物（包括人类）。古菌是原核生物，没有细胞核来储存DNA，也不像复杂真核生物那样拥有各种精巧繁复的内部构造。
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固定（fixation） 某个特定形式的等位基因传播到了种群中的每一个个体。
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