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舌形亚纲（Pentastomida）：目前发现有4目7科24属129种。体形酷似舌头，故称为舌形蠕虫。以前曾被建立一个门——舌形动物门（Pentastoma）或称五口动物门，但根据精子形态和分子生物学研究，应归入颚足纲。全部为寄生性，成虫主要寄生在犬科动物的鼻腔和副鼻窦内，有时也见于人、羊、马的鼻腔和颅腔内；若虫主要寄生在牛、羊等有蹄类的肠系膜淋巴结等脏器内，有时也见于人体内。代表属有头节舌形虫（Cephalobaena）、孔头舌形虫（Porocephalus）、蛇舌形虫（Armillifer）。
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须虾亚纲（Mystacocarida）：已知仅1科2属13种。体长一般不足1毫米。该类群于1939年首次发现于美国东北部的新英格兰地区，1943年才得到正式命名。分为长唇虾属（Derocheilocaris）8种，栉唇虾属（Ctenocheilocharis）5种。由于形态差异极小，很难鉴别。
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桡足亚纲（Copepoda）：约有10目130科13000种，其中约有2800种生活在淡水，其他均为海生。是重要的海洋浮游动物，通称为哲水蚤、剑水蚤、猛水蚤等。体长一般1～2毫米，生活在极地地区的种类可达10毫米。自由生活的种类适合各种水域，甚至潮湿的植物上都有；寄生种类主要出现在鱼的体表、鳍、鳃、鼻孔、口腔或眼眶等处。物种的多样性也导致了食性的多样化，有滤食型、掠食型、刮食型和混合型等。
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常能看见虎鱼身上挂着弹簧状的物体，其实这是寄生性的桡足类
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与鳃足纲的各种水蚤近似，桡足类也是许多经济鱼类的重要饵料。通过了解桡足类的分布，还可以预测海流的流向、测定水体污染的程度。
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介形纲（Ostracoda）
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本纲也是比较大的类群，已发现的种类达7万种，但只有13000种现生，其他均为化石种。分为2亚纲——壮肢亚纲（Myodocopa）和尾肢亚纲（Popodopa）。壮肢亚纲有2目：壮肢目（Myodocopida）和海介虫目（Halocyprida）；尾肢亚纲也有2目：简肢目（Platycopida）和尾肢目（Podocopida）。
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叶肢介化石／刘晔 摄
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体长一般为1毫米左右，但范围为0.2～30毫米，其中最大的类群是巨海萤（Gigantocypris），可达3厘米。头胸甲由两瓣介壳构成，故名。整个身体完全包被在壳瓣内，两介壳有闭壳肌，介壳会有一定程度的钙化，表面常有各种突起和纹路。介形类可见于从海岸到4000米的深海海底。河流、湖沼以及高山湖泊中也有分布。多数为底栖，少数营浮游生活。介形类的化石种，对于指示海底石油资源的勘探和地质年代的确定，以及海洋古生态的研究都具有重要意义。
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软甲纲（Malacostraca）
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本纲是甲壳亚门中最高等、形态结构最复杂的一纲，也是现生的甲壳类多样性最丰富的类群。目前已知现生种类为16目26000种。包括各类虾、龙虾、蟹、南极虾等。
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体多呈虾形，或缩短为蟹形。有些类群的头部与胸部全部或大部分体节愈合，形成头胸部。海生类型自潮间带到深海底都有分布，已知深达1万米的海底都发现过端足目、等足目、涟虫目的种类。大部种类为底栖型，部分为浮游型，等足目的许多种则属于寄生型。
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本纲分为3亚纲——真软甲亚纲（Eumalacostraca）、掠虾亚纲（Hoplocarida）、叶虾亚纲（Phyllocarida）。
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真软甲亚纲（Eumalacostraca）
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本亚纲是软甲纲中最高等、种类最多的，包括了80％的种类，约22000种，如果将化石种也算上的话，种数可达4万种。有19个体节，头部5节，胸部8节，腹部6节。背甲之间无闭壳肌，胸部附肢有分化。
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合虾总目（Syncarida）
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亦称原虾总目，除已灭绝的古虾目（Palaeocaridacea），尚有2目——地虾目（Bathynellacea）和山虾目（Anaspidacea），约160种。
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地虾目（Bathynellacea）：仅2科，即地虾科（Bathynellidae）和拟地虾科（Parabathynellidae），约有38属140种。体型均小，最大者为3.4毫米。虽然有虾形，但似蠕虫状，几乎没有视力。属嗜热性，有的种类生活在热泉中，可自由生活在55℃的热水中。
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山虾目（Anaspidacea）：分为4科11属16种。体略呈长圆柱状，虾形。无头胸甲。全部生活在淡水中，底栖于沙间。分布在澳大利亚、新西兰、南美洲等地的洞穴、湖泊、溪流、高山湖泊等地。
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囊虾总目（Peraeurida）
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多样性丰富，形态结构亦多样。雌性部分或全部的胸肢基部内侧有复卵片（板），构成育卵囊，故名囊虾。受精卵保存在囊中，孵出的幼体与成体相似，仅缺一对附肢。共分为9目，约20000种。
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穴虾目（Spelaeogriphacea）：现生仅有1科3属4种，另有1个灭绝的化石属。亦称盲虾目、洞虾目。均被发现于洞穴内，无视力。Potiicoara属在巴西发现，穴虾属（Spelaeogriphus）在南非发现，Mangkurtu属的2种则在澳大利亚发现。这种广布性，也说明该类群在特提斯洋（Tethys Sea，即古地中海）出现前就已广泛分布于冈瓦纳大陆（Gondwana）的地下水域中，之后大陆飘移而分布在南半球的各大陆。善于在水中快速游泳。