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13.问题在于,能在多基因分数系统中使用的变量,必须在我们分析所使用的54个数据集中,都与教育相关联。
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14.J. Yang, R.J.F. Loos, J. E. Powell, S. E. Medland, E. K. Speliotes, D.I. Chasman, et al., “FTO genotype is associated with phenotypic variability of body mass index,”Nature490, No. 7419 (2012): 267– 272.
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15.具体详见附录4,有关表观遗传学领域发现的讨论。
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16.利用这些关于MAO-A基因功能的生物学研究成果,一些抗抑郁和抗焦虑的药物,比如单胺氧化酶抑制剂(MAOIs),能减弱该基因的活性。据此,这些药物阻止了单胺神经递质的分解,从而增加其对于神经应激的约束作用。这些药物发展历史悠久,最初是用来治疗结核病的,不过研究人员发现,同时患有抑郁症和结核病的病人,其抑郁程度会减轻,这就导致了单胺理论的出现。在20世纪50年代,单胺氧化酶抑制剂被广泛使用。由于此类药物中的一部分会产生有害的副作用,从而推动了对其他类型的抗抑郁药物的发现过程。尽管在过去的10年,副作用较小、对饮食影响较小的新型单胺氧化酶抑制剂类药物已被发明出来,但是在MAOIs以及新型药物SSRIs中都存在着一个明显的悖论,那就是,在候选基因的研究中,低活性的基因会使人更容易患精神方面的疾病,但是这些药物均是通过抑制基因活性来达到治疗效果。这个悖论可以从三个方面来解释:一是候选基因的研究本身有问题;二是这些药物通过不同的方式来产生疗效,例如,激活脑源性神经营养因素(BDNF);三是大脑有产生真正影响的补偿机制。
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17.相比之下,这个领域的很多研究会让成年人回忆他们的童年时光,这么做会存在一个问题,即这些回忆的叙述可能会受到某些事件持续的影响。例如,某些人如果成年以后生活不如意,那么他们更有可能在回忆童年的创伤时,加大其严重程度,而那些成功人士则往往会“忘记”那些不愉快的事情。因此个人成年后的成功与否会影响到他们对于童年创伤的回忆,那么把这两者放在一起进行数据分析也将朝着错误的方向发展。
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这种类型的出版偏倚存在了很长一段时间,并且影响了很多类型的研究。另一个调查的例子是,研究人员向人们询问他们目前的就业状况,随后继续询问是否自身存在某些缺陷限制了他们去获得工作。一些未找到工作的人,倾向于“编造”自身存在某种缺陷,以此为他们的无业状态做辩护。在调查中,这些“编造”的过程都受到了“评判偏差”(justificationbias)的影响。换言之,当人们试图描述自身目前的就业状态时,会刻意去回答另一些方面的问题。总的来说,失业状况会导致有关自身缺陷的报告数量增加,而成年后较差的生活状况会导致有关童年创伤的报告产生,但是如果其生活状态有所改善,这些报告也可能不会出现。
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18.A. Caspi, K. Sugden, T. E. Moffitt, A. Taylor, I. W. Craig, H.Harrington, J. McClay, et al., “Influence of life stress on depression: Moderation by a polymorphism in the 5- HTT gene,”Science301, No. 5631 (2003): 386–389.
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19.N. Risch, R. Herrell, T. Lehner, K.- Y. Liang, L. Eaves, J. Hoh, A.Griem, M. Kovacs, J. Ott, and K. R. Merikangas, “Interaction between the serotonin transporter gene (5- HTTLPR), stressful life events, and risk of depression: A meta- analysis,”JAMA301, No. 23 (2009): 2462– 2471; K. Karg,M. Burmeister, K. Shedden, and S. Sen, “The serotonin transporter promoter variant (5- HTTLPR), stress, and depression meta- analysis revisited: Evidence of genetic moderation,”Archives of General Psychiatry68, No. 5 (2011): 444–454.
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20.E. Walker, G. Downey, and A. Bergman, “The effects of parental psychopathology and maltreatment on child behavior: A test of the diathesisstress model,”Child Development60, No. 1 (1989): 15– 24, http://www.jstor.org/stable/1131067.
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21.为了试图理解“冒险型”基因型可能因其对某些表型的有益性而存在于人群中,一种新颖的方法是对全基因组关联分析得到的数据进行逆向分析,也称作全表型关联分析(Phenome-Wide Association Studies,PheWAS)。研究人员针对某一基因型扫描上千种表型,以期发现有关这些推定存在的“冒险型”基因型的新型关联,M. Rastegar- Mojarad, Z. Ye, J.M. Kolesar, S. J. Hebbring, and S. M. Lin, “Opportunities for drug repositioning from phenome-wide association studies,”Nature Biotechnology33 (2015)
:342– 345. doi
:10. 1038/nbt.3183。
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22.K. Donohue, L. Dorn, C. Griffith, E. Kim, A. Aguilera, C. R. Polisetty,and J. Schmitt, “The evolutionary ecology of seed germination of Arabidopsis thaliana: Variable natural selection on germination timing,”Evolution59, No. 4(2005): 758– 770, http://www.ncbi.nlm .nih.gov/pubmed/15926687.
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23.S. F. Levy, N. Ziv, and M. L. Siegal, “Bet hedging in yeast by heterogeneous, age-correlated expression of a stress protectant,” PLoS Biology 10, No. 5 (2012): e1001325, http://journals .plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio. 1001325.
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24.S. R. Jaffee and T. S. Price, “Gene– environment correlations: A review of the evidence and implications for prevention of mental illness,”MolecularPsychiatry12, No. 5 (2007): 432– 442。
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25.M. Rutter, “Gene– environment interdependence,” Developmental Science 10, No. 1 (2007): 12– 18, http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1467–7687. 2007.00557.x/full.
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26.A. Caspi, J. McClay, T. E. Moffitt, J. Mill, J. Martin, I. W. Craig, A.Taylor, and R. Poulton, “Role of genotype in the cycle of violence in maltreated children,”Science297, No. 5582 (2002): 851– 854; A. Caspi et al., “Influence of life stress on depression.”
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27.C. Jencks, “Heredity, environment, and public policy reconsidered,”American Sociological Review(1980): 723– 736.
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28.即使是对于詹克斯所做的研究来说,你也许会疑惑,我们如何去评估某种基因型和环境之间的相互作用会导致智力迟钝这一结论呢?如果我们所关注的环境因素即饮食,事实上只是部分受到基因—相关性的影响那该怎么办呢?在这种关联性中,有能力的家庭能够选择饮食习惯,而其他家庭不行,这种能力在某种程度上与不同家庭的基因差异有关。
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29.拿学校教育来说,由于学校资源的分配过程不是随机的,而且很有可能与遗传因素有关,所以当评估学校质量和多基因风险分数两者之间的基因环境相互作用时,我们就遇到了重大困难。一种解决办法是去关注那些基于抽签、测试分数取舍点或田纳西州STAR小型干预实验来分配的学校环境。J. B. Cullen, B. A. Jacob, and S. Levitt,“The effect of school choice on participants: Evidence from randomized lotteries,”Econometrica74,No. 5 (2006): 1191– 1230; A. Abdulkadiroğlu, J. Angrist, and P. Pathak,“The elite illusion: Achievement effects at Boston and New York exam schools,” Econometrica 82, No. 1 (2014): 137– 196; A. B. Krueger and D. M. Whitmore,“The effect of attending a small class in the early grades on college-test taking and middle school test results: Evidence from Project STAR,”EconomicJournal111, No. 468 (2001): 1– 28.
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30.隐约来说,我们假设基因型不会随出生日期不同而产生系统性的变化。虽然有些研究人员发现在1年中,基因型的确会随出生日期而变化,但是“越战抽签征兵”这件事情被认为打破了这种联系。SeeC. A. Rietveld and D. Webbink, “On thegenetic bias of the quarter of birth instrument,”Economics and Human Biology21 (2016): 137– 146.
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31.L. Schmitz and D. Conley, “The long- term consequences of Vietnamera conscription and genotype on smoking behavior and health,”BehaviorGenetics46, No. 1 (2016): 43– 58.
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32.J. M. Fletcher, “Enhancing the gene-environment interaction framework through a quasi-experimental research design: Evidence from differential responses to September 1 1,” Biodemography and Social Biology 60, No. 1 (2014): 1– 20, http://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/19485565.2014.899454#.U2ZF-Bbo09U.
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33.在这项研究中有四组调查对象,第一组调查对象拥有“冒险型”基因型并且在“9·11”事件前接受采访;第二组调查对象拥有“冒险型”基因型并且在“9·11”事件后接受采访;第三组调查对象拥有“保守型”基因型并且在“9·11”事件前接受采访;第四组调查对象拥有“保守型”基因型并且在“9·11”事件后接受采访。我们利用双重差分模型进行分析,它能够检测出在拥有“冒险型”基因型的人和拥有“保守型”基因型的人之间,在“9·11”事件后接受采访比在“9·11”事件前接受采访,在抑郁症状方面是否有较大的差异。
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34.Caspi et al., “Influence of life stress on depression.”
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35.我们在研究中使用同卵双生子出生体重差异的随机性作为和5-HTT基因起相互作用的环境冲击因素,这使我们更直觉地相信凯蒲赛效应可能是错误的。众所周知,出生体重能够反映产前营养和子宫环境的状况,并且它可以被用来预测各种未来的情况,从认知发展到身高、心脏疾病再到工资等各种结果。由于同卵双生子有相同的子宫环境、胎龄以及基因型,所以出生体重轻的一方可能被认为被随机分配了更少的卡路里,并且处于胎盘靠后的位置。这种方法已经被用来确定胎儿生长情况对以后的影响,并且排除了其他可能伴随的因素。
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当我们实施这项研究并且根据有无5-HTT长启动子基因型来区分双生子基因型时,我们发现事实上至少有一个短小型5-HTT基因的双生子会对出生体重有反应。然而,我们的结果与凯蒲赛等人的发现不同,他们认为额外的营养补充会增大未来患抑郁症的风险。虽然在这种情况下环境压力因素是“随机”分配的,但是基因型不是。我们比较的是双生子基因型的影响(同卵双生子在定义上是完全一样的,因此我们在这两者之中看不到基因型的影响),那么我们如何知晓它真的是基因环境之间的相互作用而不是环境对环境的影响呢?换言之,也许我们得到的环境部分是正确的,并且由于人群分层,短小型基因代替了某些环境差异的影响。
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