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1700260311 [8]切赫选择的RNA是四膜虫的核糖体26S RNA,这个RNA带有长约400个碱基的内含子。
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1700260313 [9]需要与“酶RNA”区分的概念是“RNA酶”,“RNA酶”是指能够分解RNA的酶,通常是蛋白质,但也可能是RNA。所以,如果一个酶RNA能够催化分解RNA,就会被叫作“RNA酶RNA”。我们马上就会在下文遇到这样的东西,你可以惦记着找找看。
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1700260315 [10]蛋白质成分在酶RNA中发挥的辅助作用主要是固定底物,也就是把待催化的分子固定在容易催化的位置上,这有些类似它们在许多铁硫蛋白里扮演的角色。
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1700260317 [11]2000年,波尔·尼森(Poul Nissen)等人测得核糖体大亚基中正在形成的肽键周围的1.8nm范围内,除了23S rRNA状态域V的部分原子外,不存在任何核糖体蛋白质侧链原子,从而证明了核糖体是一种核酶。
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1700260319 [12]严格地说,自剪接内含子是先催化两次水解,再催化一次聚合,但总的来说,仍是把长的变短,把大的变小。
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1700260321 [13]经过上一章的讨论,你应该会意识到,这里所谓的“复制”包含了两次聚合过程。第一次以目标RNA为模板,聚合出它的镜像序列,第二次以镜像序列为模板,聚合出新的目标序列。但为了表述方便,下文不再区分这两次聚合,都统一称作“复制”。
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1700260323 [14]RNA复制酶主要出现在被RNA病毒感染后的细胞内,它们更正式的名称是“RNA依赖性RNA聚合酶”,但这本书为了不那么拗口,统一叫它们“RNA复制酶”。
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1700260325 [15]该研究所涌现出了4位诺贝尔奖得主。
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1700260327 [16]“圣杯”原本是指耶稣在最后的晚餐上喝酒用的那个杯子,耶稣遣走加略人犹大之后,吩咐剩余的11个门徒喝下里面的红葡萄酒,说那象征着他的血,由此创立了受难纪念仪式。后来的基督徒相信这个杯子具有某种神奇的能力,喝下它盛过的水就能长生不老甚至死而复生。因此,“寻找真正的圣杯”在过去1 000多年中都是西方文学的经典话题。
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1700260332 生命的起源:所有生命的共同祖先在40亿年前是怎样诞生的? [:1700256331]
1700260333 生命的起源:所有生命的共同祖先在40亿年前是怎样诞生的? 第十四章施皮格尔曼怪
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1700260335 竞争的RNA世界
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1700260337 对于“进化的起点在哪里”这个问题,“与生命的起源一同开始”似乎已经是个极致的回答。但是,我们却在实验室里证明了,既然有了资源、复制、变异和竞争,进化完全可以出现在生命诞生之前的RNA世界。
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1700260339 在那里,有的RNA在进化中日趋复杂,却有另一些RNA发展成了寄生者,而这些寄生者,很可能就是第一批病毒,或者更准确地说,是一类亚病毒因子。
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1700260341 经过前两章的讨论,对于RNA世界的早期面貌,我们大致有了这样的构想:白烟囱里海绵似的毛细管道具有热泳浓缩的效果,这可以促使核苷酸随机聚合成RNA。后来,这些RNA中涌现出了具有催化能力的酶RNA,尤其是一些RNA复制酶RNA,它们构成了自我复制的团体,呈指数级扩增。
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1700260343 而在这个宇宙中,任何指数级的自我复制都意味着同一件事——进化。
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1700260345 本来,自我复制意味着信息的世代传递,也就是遗传的建立。但在这个宇宙里,任何信息传递都不能保证永远准确[1],RNA的复制也不例外。考虑到早期的酶RNA未必能有多精密,那些数量惊人的自我复制的产物想必充满了随机突变。那么可以想见,有些突变会提高酶RNA的催化效率,因此加快团体的扩增,而有些突变就会反过来妨碍扩增。而且,白烟囱的环境再好,也没有无限的资源供给,RNA的指数级扩增迟早会超过核苷酸的产出速度,到那时,不同的团体就会相互竞争,只有扩增最快的团体才能延续下去,这是一种简单却又不可避免的自然选择。
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1700260347 于是,加快扩增的突变会累积增多,妨碍扩增的突变会不断被淘汰。在那些自复制RNA团体中,进化的车轮悄悄启动了,其中的重大意义,无论怎么强调都不过分。
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1700260349 现如今,在小小的试管里,杰拉德·乔伊斯只用24轮模拟进化就获得了已知最好的RNA复制酶RNA,在40亿年前那永不停歇的白烟囱里,进化又会给我们带来怎样的惊喜呢?我们似乎已经可以想象,一个个自我复制的RNA团体会争先恐后地攫取白烟囱里的核苷酸,在激烈的竞争中进化出越来越复杂的代谢机制,然后顺利地发展成了的生命……
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1700260351 但是,回头仔细推敲一些细节,进化又好像不那么顺利了。
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1700260353 生命的起源:所有生命的共同祖先在40亿年前是怎样诞生的? [:1700256332]
1700260354 ·极端自私的RNA·
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1700260356 RNA世界里刚刚启动的进化与今天的进化并没有根本的不同,一段碱基序列能否逐渐成为群体的主流,只看它能否在世代更替中复制得更快。
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1700260358 那么,怎样的碱基序列才能最快地复制呢?
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