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1700261448 第四块关键的拼图碎片,就藏在我们自己的身体内,它就是端粒酶。
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1700261450 人类以及真核域的一切成员最主要的遗传物质都是线状的双链DNA,它们被封装在一条条的染色体里,通过一次次的细胞分裂世代传递。但是,细胞的DNA复制系统有一种先天缺陷:DNA的头尾两端都会有一小截复制不下来,直接丢失掉,复制的次数多了,整个DNA就散架了。
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1700261452 对此,我们的细胞有一系列的对策。首先就是让DNA的两头更加“耐磨”:每条线状DNA的两头不安排任何基因,而是一大段无意义的重复序列。而且这段重复序列会与特殊的蛋白质结合起来,缠得紧紧的,好像鞋带两端的铁皮包头一样——这个结构,就是著名的“端粒”。在真核细胞中,只要端粒尚未耗竭,DNA复制就不会伤及正经的基因。可惜这又只是缓兵之计。显然,一次次的细胞分裂总有耗尽端粒的一天,等那一天到了,DNA不只有两端的基因会被破坏,整个染色体也会像拿掉了橡皮筋的发辫一样,在细胞的水环境中迅速解体,整个细胞也就不得不凋亡了。
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1700261454 所以,真核细胞还会合成一种端粒酶,专门用来延长端粒。
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1700261456 我们今天已经知道,“端粒酶”也是一种逆转录酶,而且是一种自带RNA模板的逆转录酶。DNA复制之后,细胞只要能够激活端粒酶,就能利用那个内置模板,及时地恢复端粒长度了。[15]
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1700261458 那么,端粒酶究竟要怎样延长端粒呢?这个过程如图4—57所示,看着有些复杂,原理却是很简单的:端粒序列,就好比一个循环的故事,“从前有座山,山里有个庙,庙里有个老和尚,他在讲:从前有座山,山里有个庙,庙里有个老和尚,他在讲:从前有座山,山里有个庙,庙里有个……”奈何DNA聚合酶却是个傻子,完全参不透其中有什么规律,每次复制都只能死记硬背,还背不全,总会漏掉头几句,背来背去,就全忘光了,端粒也就耗尽了。
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1700261463 图4—56 2009年的诺贝尔生理学或医学奖颁给了伊丽莎白·布莱克本(左)、卡罗尔·格雷德(中)和杰克·绍斯塔克(右),因为他们“发现了端粒和端粒酶如何保护了染色体”。(来自Science History Institute.Conrad Erb、Gerbil、Prolineserver)
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1700261465 好在端粒酶内部携带了一条“端粒酶RNA”,刚好蕴含了端粒的重复序列,它总能结合在端粒的开头处,把漏掉的那几句提醒出来。DNA聚合酶再来依样画葫芦,补全整个端粒。就这样,端粒就恢复了长度,甚至,如果端粒酶足够活跃,提醒得够多,端粒还会比原先更长。
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1700261467 第四块碎片到此为止似乎都和前文没什么联系,既没有迷你螺旋,也没有CCA尾。但是追究起来,端粒酶RNA上的重复单元大多是C,有少许A,偶尔夹杂很少的U,比如酿酒酵母是CCCA,四膜虫是CCCCAA,疟原虫是CCCUAA,拟南芥是AAAUCCCC,哺乳动物是CCCUAA,粉红面包霉菌是CCCUAA……[16]这就不禁让人推测端粒酶RNA与CCA尾有什么渊源了。从现代细胞内的机制来看,DNA上的端粒完全是端粒酶RNA逆转录的产物,将此倒回去,倒回到端粒最初起源的时候,那想必也同样是一次特殊的逆转录。所以,端粒酶RNA上的重复序列,应该比端粒本身的DNA序列更能说明问题。
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1700261469 所以,韦纳夫妇提出,最初的端粒是一个酶RNA,这个酶RNA带有迷你螺旋,而且迷你螺旋挂着一串重复的CCA尾。它能以自己为模板,在DNA的断口上启动连续多次的逆转录,也就形成了最初的端粒,这个过程就像转运RNA的迷你螺旋启动了逆转录病毒的逆转录一样。但是在漫长的进化中,这个酶RNA的大部分序列都一点一点地退化,替换成了功能更加强大的蛋白质,恰似那艘忒修斯之船的木头一片片地坏掉,然后换上了新的、更好的硬木。最后,当初的酶RNA就只剩下一串重复的CCA了,而且由于CCA能够重复即可,具体序列并不重要,所以在不同的真核细胞里,端粒酶RNA中的CCA也突变成出了各异的版本。[17]
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1700261474 图4—57 端粒酶的工作原理示意图。注意,核酸链上的碱基序列要从5’端向3’端读。(作者绘)
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1700261479 图4—58 这些拼图碎片构成的线索。(作者绘)
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1700261481 最后,这些拼图整合在一起,就是韦纳夫妇的基因组标签假说:带着CCA尾的迷你螺旋起先并不是用来翻译蛋白质,而是用来给RNA序列提供复制起点和末端保护的。
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1700261483 生命的起源:所有生命的共同祖先在40亿年前是怎样诞生的? [:1700256353]
1700261484 延伸阅读HIV的逆转录过程
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1700261486 HIV,即“人类免疫缺陷病毒”,是“获得性免疫缺陷综合征”,即“艾滋病”的传染病原体。它是一种逆转录病毒,全体基因组是一条单链线状RNA,因此每一个病毒颗粒还同时包裹了一些“逆转录酶”,用来把病毒的单链RNA逆转录成双链DNA。但核酸的聚合反应只能从模板链的3’端逆推到5’端,逆转录又必须有引物启动,所以这个逆转录酶的催化过程非常烦琐,包括了许多步骤。
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1700261488 第一步,HIV的单链RNA上有一个“引物结合位点”,刚好与人体的转运RNA的3’端序列,尤其是CCA尾互补配对,于是两者结合了起来。而结合产生的结构又将与病毒的逆转录酶结合起来。
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1700261493 图4—59 HIV逆转录的第一步,注意虚线框内的所有结构都属于人体的转运RNA。不同色彩标记了不同功能的序列。(作者绘)
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1700261495 第二步,转运RNA将成为整个逆转录过程的引物。逆转录酶先以CCA尾为起点,把单链RNA的5’端序列全部逆转录成DNA,由此形成了一半是转运RNA,一半是新形成的DNA的杂交链。
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