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霍乱、伤寒和痢疾都是古老的病名，不过这里所说的霍乱和伤寒都是指现代医学中的概念，与传统医学所指不是一回事。关于伤寒这一概念，绪论中已做辨析，于此不赘，仅对霍乱一词略作考辨。
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（一）霍乱
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在中国的文献中，霍乱是一个古老的名词。早在《黄帝素问》中就有记载：“土郁之发，民病霍乱。”[33]“太阴所至，为中满，霍乱吐下”。对此，明代的张景岳注释说：“挥霍撩乱，上吐下泻。”[34]又有干霍乱之名：“更有吐泻无物，亦有上下关闭，竟不吐泻者，为干霍乱。惟心腹绞痛，令人立毙”[35]，所以又称绞肠痧。[36]虽然，现代一般认为，嘉庆二十五年（1820年）之前，中国所谓的霍乱是指多发于夏秋二季的急性肠胃炎或细菌性食物中毒；现代医学所指的由霍乱弧菌引起的烈性传染病，即Cholera，系嘉庆二十五年时从印度由海路传入。[37]然而，在学术界，这一论断并非定论，争论的焦点主要集中在以下两个方面：一是这场大疫的霍乱究竟是一种新的疾病，还是原本就有的霍乱的一种变型；二是这次是不是真性霍乱的首度传入中国。
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关于前者，实际上，从疫病发生后不久就存在争议。比如当时的霍乱名家王士雄，在其所著的《霍乱论》中将嘉庆季年出现的新疾病称为“霍乱转筋”，认为吊脚痧[38]不过是转筋霍乱而已。[39]而稍后的徐子默则明确指出吊脚痧非霍乱。[40]而且，根据程恺礼的研究，认为是传统疾病的，除王士雄等人外，洛克哈特（Lock—hart）、德贞（Dudgeon）和汤姆森（Thomson）等西方的医生也持同样的看法，他们在仔细阅读资料后，认为“霍乱”确实是霍乱，而且它自“古早”即存在于中国。“对他们来说，在医学古籍中关于这个疾病的临床描述是莫大的确证，即使没有提到这种疾病的传染本质。他们坚持说，霍乱真正的性质可以进一步由中医明显的关心得到证明，他们自古代就对这个疾病开出许多处方并治疗的方法。这些治疗法如果不很有用（通常和他们自己的疗法相似），至少值得更深入的考察。”[41]其实，在清代的医生中，认为吊脚痧为霍乱或寒霍乱者，远非王士雄一人，比如光绪年间，钱塘的连文冲将霍乱分为自生霍乱和传染之症，主张治霍乱应先辨阴阳，“庶按症施治，得其指归也，然无非师法古人”[42]。而湖州的莫枚士则公然反对“矜言创新，以新一时之耳目”，认为“今瘪螺痧即暑月之中寒耳，其吐泻者即霍乱耳”[43]。
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那么，它和传统所谓的霍乱究竟是不是同一种疾病呢？虽然那些持肯定论者的意见并非不值一顾，最终的确认也还有待医学界进一步深入探究，但就笔者已有的认识来看，它们应该不是同一种疾病。西方学者所指出的两条理由：古代医籍对霍乱症状的重视和记载以及治法类似，其实并不足以说明问题，古代医籍虽然对霍乱多有记载，但有两点明显与真霍乱不符，一是它的传染性不明显；二是伴有腹痛。[44]至于说治法类似，这并不奇怪，当时一些明确指出吊脚痧为一种新疾病的医生所提出的治法也与传统治法类似。[45]就是现代医学，对这两种疾病的治疗所用的药物也基本一致。[46]至于中国医生的认识，根据陈方之对王士雄《霍乱论》所列医案的研究，王所经验的48例，其中有38例陈认为是真霍乱，其他10例见腹痛者，王自己也断为非霍乱。[47]这就是说，虽然王对吊脚痧与霍乱在名称上不加分别，但在实际临床治疗中所指的霍乱其实就是真霍乱。王以后一些医生认为它并不是一种新疾病，大概与中国传统的遵经法古传统有关，特别像莫枚士是著名的泥古遵经人士，他们的意见并不完全足以为据。何况，从大历史观来看，确认一种疾病是否过去存在，不应仅仅拘泥于个别症状的比较和确认，特别是像霍乱这种危害重大的传染病，更需要将其置于广阔的历史背景中，从某一地区自然社会环境状况和社会反应等多方面加以综合考察。从过去文献中并无有关霍乱大流行的记载而此后却记载不断这一点来看，两者应该不是一种疫病。
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关于后者。范行准根据涂绅《百代医宗》中有关嘉靖甲子年的记载，指出真性霍乱“在十六世纪中，已由海舶或从印度、安南等处传入”[48]。西蒙则认为真霍乱第一次造访中国是在1669年，由马六甲经海传来，第二次则在1769年，由南亚传入。[49]不过，程恺礼认为西蒙的证据并不充足，然而对西蒙所说的第二次传入，倒由一则医籍中的资料可以作证，一位称为上浣觉因的道人在咸丰元年仲秋指出：
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乾隆年间，黔中人多感异症。病发则立死。方书不载治法。有人于丹平山得神授奇方，分四十九痧，全活甚众。后此方传至关中，以治诸怪异急症，无不奇验。道光壬午（二）年，粤东奇症，多有相似者，偶得此方试之立效。当经刊布。今岁夏秋之间，浙中时疫俗名吊脚痧，亦颇类此。爰急重梓，以广流传。[50]
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在这段话中，道光二年（1822年）的奇症和咸丰元年（1851年）名之曰吊脚痧的显系真霍乱，因此乾隆年间贵州的异症也应该有真霍乱的可能，贵州离南亚和东南亚较近真霍乱完全有可能从这些地区由陆路传入。由此可见，尽管这次大疫的霍乱并非传统的霍乱，但真霍乱的传入中国却可能在此之前，也就是说，就整个中国而言，真霍乱在嘉庆末出现时应该不算是什么新的疾病。不过，虽然它或许已传入，但由于缺乏适宜的条件，并没有造成大范围的流行。甚至自生自灭了。
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这样的话，霍乱就包括两层含义：急性肠胃炎和食物中毒之类的假霍乱即类霍乱；从印度等地传入的真霍乱。
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霍乱等肠道传染病大都爆发、流行于夏秋湿热季节，主要通过食物、水和接触传染，江南温暖湿润的气候，密布的水网，以及当地人长期以来养成的某些生活和用水习惯，非常有利于其滋生流行，实际上，这类疾病也是清代江南最主要的急性传染病。真性霍乱在清代江南存在的时间虽还不到一百年，但却可以说是对当地社会危害最大的瘟疫，真霍乱的症状，除了前文所言外，还有就是它是众多急性传染病中唯一不发热的疾病，而且在吐泻的同时也基本没有腹痛。该疾病首先于嘉道之际传入我国，并迅速蔓延，几乎传遍大半个中国。在江南地区，嘉庆二十五年（1820年），首先通过海路在宁波和上海地区登陆，继而沿主要交通线、特别是水路迅速扩散，成为清代江南持续时间较长、影响最为广泛的一次瘟疫，对江南社会产生了极其重要的影响。[51]此后，霍乱在江南不断肆虐。
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真性霍乱自1817年在印度大流行后，曾在世界各地肆虐长达一个多世纪。世界医史学界一般认为有6～7次世界性的霍乱大流行，其中伍连德认为是7次：1817—1823，1826—1837，1846—1862，1864—1875，1883—1887，1892—1895，1910—1925。[52]上官悟尘则列举了6次，前4次与伍相同，后两次为：1883—1896，1902。[53]很明显，上官实际上是把伍的第5和第6次合并为第5次，真正的区别只在于最后一次，伍没有注意到1902年的情况，而上官对清末以后的情况没有顾及。根据我们搜集的资料，霍乱的流行与上述流行时间虽有相合之处，也存在不小的出入，伍对1902年的忽视显然不符合江南的情况。除却第1次流行，清代江南可以确定的真霍乱流行情况如下：
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道光十七年八九月间，杭州盛行霍乱转筋之症。
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道光二十一年，宁波霍乱流行。
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道光二十四年五月，杭州霍乱流行。
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咸丰元年秋，象山疫。宁波再现霍乱。
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咸丰六年夏秋之交，杭州人患吊脚痧，吐泻腹痛，足筋拘急，不即救，一二时即死。
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咸丰十一年秋，嘉兴濮院盛行霍乱转筋之症。
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同治元年夏，石门大疫。嘉善正月大寒，人多冻死，夏大疫，秋米腾贵，斗米千钱。四月间，嘉兴有吐泻等病，不及一昼夜即死。娄县、上海、川沙、南汇夏五月大疫。金山夏秋之间，大疫。金山张堰夏五月大疫。青浦蒸里兵乱，田多不治，夏大疫。上海有数百人死于霍乱。秋八月既望，昆新道馑相望，疬疫大行，有全家病殁者，琐尾流离，至斯为极。夏秋之交，吴县大瘟疫。夏秋以来，常熟时疫流行，名子午痧，朝发夕死。无家不病，病必数人，数人中必有一二莫救者。吴江时疫流行，日死数十人，名吊脚痧，无方可治，不过周时。
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同治二年，富阳大疫。海宁自四月下旬，旱灾严重，七八月，复遭潮灾，米价腾贵。又遭时疫（原注：吊脚痧），亦伤无计。六月常熟疫气大作，病者只半日不治。八月，吴江各处时疫流行，死者甚多。新阳信义，大乱初平，继以大疫，乡间无槥可售，尸骸枕藉。五月，嘉兴疫。时天热亢旱，酷热，盛川死疫者经掩埋局收管，三日间计死二百余，余镇亦每日各有数人，皆半日病而已。
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同治三年，上海霍乱流行。
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光绪三年，上海霍乱再度流行，有22位外国人死于霍乱。宁波被霍乱波及。
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光绪七年十二月初三日，上海温如仲春，是岁疫且饥。有251位中国人及25位外国人死于霍乱。青浦疫且饥。
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光绪八年，苏州被霍乱波及。
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光绪十一年，夏秋间，嘉定屡次大风雨，潮溢，秋疫症流行。宝山夏四月淫雨，六月二十日飓风，秋疫。宝山罗店七八月疫，患者上吐下泻，手足挛急，子发午死，名曰子午痧，一家有毙三四人者。夏秋，湖州瘪螺痧盛行，死者日数十人。
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光绪十二年，定海霍乱盛行。无锡金匮霍乱流行。
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