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三阶教的教义，在理论上并非复杂，只是抓住如来藏、佛性论加以发挥，引导教徒坚信自己与一切众生皆有佛性，皆可成佛。虽主张不轻易与外宗派的人来往，但要求在路上见到一切僧俗皆应礼敬，并且要坚持苦行，还不提倡供养佛舍利、礼拜佛塔。《三阶佛法》卷二要求三阶教的“一切出家人皆悉普唯学一切无名相法坐禅，皆悉普不供养一切佛舍利，皆悉普不礼拜一切佛塔，乃至一拜。除一切在家人不在其限”。信行又反复宣传，学习普法八法，对任何人都适宜，“学之纯益无损”，而如果学习别法，如第三阶众生学第一、二阶佛法，因为“不当根”，是“纯损无益”的。（《对根起行法》）
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信行还主张三阶教僧众在死后尸体放置于山林僻远之处，供鸟兽吃。据《故大信行禅师铭塔碑》，信行死后，“送枢于雍州终南山阜尸陀林所，舍身血肉，求无上道。生施死施，大士有苦行之踪……”尸陀林，音译自梵文，意为寒林，本是位于中印度王舍城附近的林名，是放置死尸的场所。中国佛教徒用此名称呼放置尸体的地方。信行的弟子在他的尸体被鸟兽吃尽之后，封骨建塔。弟子本济、僧邕等人效仿之，死后也被葬于信行的塔所。
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（三）所谓“无尽藏”
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“无尽藏”原来的含义十分广泛，在佛教中凡认为具有无限功德、利益的事物皆可称之为“无尽藏”。“藏”意为储藏、收藏，作为名词是收藏东西的地方，相当于仓库；“无尽”意为用之无穷尽。晋佛陀跋陀罗译《华严经》卷十二《菩萨十无尽藏品》介绍了十种无尽藏，即：信、戒、惭、愧、闻、施、慧、正念、持、辩，认为按照这十个方面修行，对众生有无限功德，“以一切法门，入一切佛法”。
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信行在著作中所说的“无尽藏”，尽管包括的方面很多，但侧重于施舍的财物，主张在寺院中设置存放施舍物品的无尽藏，用来维修寺院，为佛教活动提供经费，赈济贫穷，等等。然而在一般情况下，这种无尽藏中的资财也可用来借贷赚取利息。从这个功能说，无尽藏也可称为“无尽财”、“长生钱”。（见《释氏要览·三宝物》）
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三阶教文献《大乘法界无尽藏法释》是对信行《大乘法界无尽藏法》的解释，其中说：
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小乘法中，唯明自利；大乘法内，自利利他，是故菩萨依大悲心立无尽藏法。六波罗蜜[217]，檀度（按：意为布施）为初；四摄行[218]中，布施为首。上同诸佛，内应法身，外利众生，穷尽法界。众生界尽，此藏乃尽。法身无尽，施行无穷。由境界常行相续，故立无尽藏名。究竟深广，含蕴一切，故名为藏。藏有轨仪，复名为法，故曰大乘无尽藏法。
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这里强调六度中的布施在建立无尽藏中的重要性。布施包括财施、法施。这里主要是指财施，即向寺僧施舍财物。施舍相续不停，施财含义深广，故称无尽藏。凡愿意向无尽藏施舍财物的，须“日舍一分钱或一合粟”。在《无尽藏法略说》中介绍两种施舍财物法：一，总施，每天施钱十六分；二，总别共施（总别具行），每天施钱三十分。其中详细讲了有十六种无尽藏法，也称十六种常乐我净（意为具有涅槃解脱的功德）。这十六种无尽藏法是：
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①供养佛无尽，如礼佛；
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②供养法无尽，如转经（诵经）；
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③供养僧无尽，对持戒犯戒之僧也要供养；
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④供养众生无尽；
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⑤离一切恶无尽；
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⑥修一切善无尽；
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⑦施香无尽；
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⑧施光明无尽，如灯烛；
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⑨施洗浴无尽；
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⑩施音声无尽，如钟呗；
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施衣服无尽；
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施房舍无尽；
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施床坐无尽；
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施食器无尽；
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