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生理心理学实验中被试的选择，被试可分为病人和健康人。病例的选择应该有明确的纳入和排除标准，被试的依从性好，能真实可靠地反映主观感受。依从性是指被试在实验过程中对于处理因素的服从程度。同时，要尊重被试的权利，必须遵守实验的伦理要求。
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3．实验效应
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一般是通过某些观察指标，定量或定性地反映实验效应。研究者应当对欲研究的问题有较为全面的了解，在实验设计中千万不要遗漏了某些重要的观察指标，以免实验结果不可靠。选择观察指标的基本原则如下：
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（1）客观性。可以选择客观指标，避免一些笼统的、不确切的指标。有时，客观指标还具有判断的主观性问题，如猫的假怒行为是客观的，但判断时存在主观性问题，所以，对于这种情况，须制定明确的判断标准。
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（2）精确性。选用的指标应尽量精确。指标的精确性包括准确性和精密性，准确性是指所观察结果的真实程度，即观测值与真值的接近程度，属系统误差；精密性是指所观察结果的深度，即重复观测时，观测值与平均值的接近程度，属随机误差。实验效应指标既要准确又要精密，而首先是准确可靠。
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（3）灵敏性。应尽量选择高灵敏性的指标，即选择能够显著提高灵敏性的仪器对观察指标进行测量。但也要考虑实验经费问题，灵敏度高的仪器，往往费用昂贵，应根据实验经费，选择既相对廉价，灵敏度又高的测量方法。
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（4）指标的观察。对实验效应的观察应避免偏倚，例如，实验者都期望阳性结果出现。可以采用双盲设计来进行控制。
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三、实验设计的基本原则
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实验设计除了对实验对象、处理因素、观察指标做出合理的安排以外，还必须遵循实验设计的四个原则，即对照原则、随机原则、重复原则和均衡原则。
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1．对照原则
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有比较才有鉴别，对照是比较的基础。所谓对照就是要设立参照物，在实验分组时必须设立处理组和对照组。对照原则要求处理组和对照组除了处理因素外其他可能影响实验的因素应力求一致。对照形式有：
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（1）空白对照，又称正常对照，指不对受试对象做任何处理的对照。例如，实验组动物给药，而对照组动物不给药。
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（2）假处理对照，又称实验对照，指不进行实验特定的处理，其余处理相同的对照。例如，实验组动物做手术摘除卵巢，假处理对照组的动物只做开腹手术再缝合，而不摘除卵巢。
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（3）自身对照，指对照与处理在同一受试对象中进行，这种对照可以最大限度的减少抽样误差，但应考虑处理的后效应问题。
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（4）组间对照，又称互相对照，指处理组间互为对照。
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（5）标准对照，又称阳性对照，指用标准值或正常值作为对照。
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（6）历史对照，指用以往的研究结果或者历史文献资料为对照。但由于时间、地点和条件不同，差异相当大，动物实验中一般不用此方法。
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2．随机原则
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随机原则是指被研究的样本是从总体中随机抽取的，即在抽取时要使每一个样本有同等机会被抽取。随机抽样是缩小抽样误差的基本方法。随机抽样的方法很多，如抽签法、摸球法等，也可以查随机数字表来确定。
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3．重复原则
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重复是保证实验结果可靠性的重要措施。每一实验都应有足够数量的例数和重复次数，样本所含的数目越大或重复的次数越多，则越能反映给予变异的客观真实情况。但是样本例数很多或者实验重复次数很大，不但在实验上有一定的困难，而且也是不必要的。实验设计就是要使样本的重复次数减少到不影响实验结果的最小限度。
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4．均衡原则
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均衡即指各处理组非实验因素的条件基本一致，以消除其影响。
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