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先是遭到禁止，后又再次获准出版，这反而让大众对《百科全书》的兴趣更加浓厚了。这也给勒·布雷顿和与他合作的出版商带来了意外之财。《百科全书》新的几卷即将出版的消息刚刚传出，大批订阅者就开始预订了。到了1752年末，订阅数量增长了50%，达到了3000人。两年后，编辑们又收到了额外的1200单订阅，最终的印刷数达到了4200套。
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18世纪50年代中期，百科全书派度过了只能用“风暴眼”来形容的一段时光。尽管达朗贝尔在1752年3月向多方表明自己将不再参与《百科全书》的工作，但在同年7月，他又勉为其难地同意继续负责辞典数学部分的工作。两年之后，他甚至重新回到了编辑的工作状态，执笔了辞典第四卷的前言，在其中自豪地列举了辞典的杰出贡献者，并宣称辞典在与落后势力的斗争中取得了胜利。[26]
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《百科全书》的哲人们此时明显是顺风顺水。法兰西学术院之前基本由创作的作品少、发表的作品更少的高阶主教组成，现在却越来越多地纳入启蒙运动的成员。1746年，伏尔泰当选为学术院的成员，七年后，这个威严的组织吸纳了布丰伯爵乔治-路易·勒克莱尔，他是御花园的管理者，还创作了18世纪最重要的书籍之一《自然通史》（1749—1788）。次年，达朗贝尔也成为法兰西学术院的一员。和伏尔泰与布丰伯爵一样，在这位数学家接管之前，这个职位一直由高等神职人员占据。无论是哲人还是神职人员，都很清楚这个方向性变化意味着什么。[27]
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对狄德罗来说，18世纪50年代中期也是个好时候。此时，他和图瓦妮特已经结婚十年，这十年来的生活似乎不停地被一个又一个心碎的时刻打断。尽管图瓦妮特生养了三个孩子，但从没有两个孩子同时活着的时候。他们的女儿安热莉克在1744年9月死去，死时才刚刚满月。六年后，四岁的弗朗索瓦-雅克·德尼也因病死去。同年7月，灾难又一次降临。就在狄德罗和图瓦妮特的第三个孩子德尼-洛朗受洗的当天，他的教母失手把他掉在地上，他的脑袋砸在了圣斯德望堂的石阶上。五个月后，这个小男孩便死去了。情况终于在狄德罗和图瓦妮特的第四个孩子身上有所好转。1753年9月，一个女婴诞生在夫妇二人位于吊刑路公寓的二楼，这个名叫玛丽-安热莉克的小女孩（也就是未来的范德尔夫人）是狄德罗的孩子中唯一活过了危机重重的婴幼儿时期的。她很快就成为狄德罗快乐的源泉。
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随着这个里程碑式的事件而来的还有其他几个重要变化。到了1754年，《百科全书》的其他几位编辑清楚地认识到，狄德罗对于辞典的重要性已经远远超过了名声不小但脾气更大的达朗贝尔，真正成为这个项目的核心和灵魂人物。狄德罗肯定也意识到了这一点，不然他也不会在那一年谈妥了一个对自己更有利的合同。狄德罗用四位印刷商的资金购买的众多书籍，而合同将狄德罗规定为这些书的唯一所有者，他还可以在辞典每一卷出版时获得2500里弗尔的报酬。在这笔源源不断的收入之外还有更加丰厚的奖金：四位印刷商同意在辞典最后一卷出版时，支付狄德罗2万里弗尔。[28]
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杜尔哥绘制的巴黎地图，1734—1739，塔兰内路，位于图的右下角
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这是狄德罗有生以来第一次手头相对宽裕，生活欣欣向荣，于是他决定举家搬出吊刑路上拥挤的旧公寓，来到塔兰内路上的一栋楼房，将家安置在位于楼房第五层的公寓。这里处于圣热尔曼区，比狄德罗之前居住的区域要更接近中产阶级水平。这个新居所一年的租金是600里弗尔，有6个房间，4个壁炉，公寓后面还有专门的厨房区域。但这里最大的优势是楼的第六层还有一个单独的书房，头顶就是楼房的孟莎式屋顶。狄德罗就是在这里度过了他人生余下的三十年光阴，穿着他的家居长袍和拖鞋，在书海中笔耕不息。
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强烈反对
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这段平静的时光并没有持续多久。18世纪50年代中后期，《百科全书》的批评者们联合起来，发起了新一轮的猛攻。反对势力远及里昂，在那里，一个新的、影响力强大的耶稣会组织，针对当时“百科全书主义”导致的精神“流沙”，制造诽谤文章，组织研讨会议，开始高声反对《百科全书》，并产生了重要影响。在巴黎，新类型的批评也开始出现。在18世纪50年代加入这个阵营的最有力度的声音来自埃利·卡特林·弗雷龙，这位才华横溢的保守派批评者备受法国王后的青睐和提携。1754年，他开始出版法国第一本真正意义上的文学期刊《文学年代》。期刊每十天出版一期，影响力强，传播广泛，很快成为不断扩大的反对哲人们和《百科全书》的声浪中最尖锐的声音。弗雷龙尤其享受仔细审阅《百科全书》新出版的每一卷，一丝不苟地对其中所谓的剽窃行为进行嘲笑，并对其中的反宗教观点提出严厉的斥责。[29]然而，对《百科全书》产生最大影响的，并不是被指控剽窃和对上帝及宗教不敬，而是后来的一次政治刺杀行动。
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罗贝尔-弗朗索瓦·达米安，版画
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1757年1月5日，罗贝尔-弗朗索瓦·达米安——一名高大魁梧的男子，据说精神状态不太稳定，坚信自己的行动得到了上帝的准许——想办法进入凡尔赛宫宫殿周围的区域，意图杀害，或者如他后来坚称的，伤害路易十五。刚进入凡尔赛宫，达米安便查明国王当晚将离开自己居住的区域，前去看望病中的女儿维克图瓦公主。马车停在凡尔赛宫北花园和皇家庭院之间的道路上等候国王，达米安于是混进了一小群围观者和侍卫的队伍中，与他们一同在马车附近徘徊。
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下午5点45分，四十六岁的路易十五从位于主宫殿的小套房中走出，走下台阶，朝着等候的马车走去。[30]达米安一直按兵不动，等到路易十五要踏入马车时才突然从冬天黑暗的夜色中冲出，一下子抓住了国王的左肩，然后将一把袖珍折刀刺入了国王第四、第五根肋骨之间的位置。尽管厚重的冬衣保护了国王，但他依然血流如注。警卫迅速地将路易十五抬到了寝宫，而国王则感到自己受到了致命一击。尽管卧室内的所有人都告诉国王，达米安的武器造成的伤口并不会危及生命，但国王还是让人找来了自己的告解神父，并为自己给王后带来的所有痛苦而向她致歉。路易十五仅用了一周时间就完全康复了；唯一无法修复的伤口是他的精神和他作为君主的威望。
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在遇刺后的几天乃至几周中，路易十五的注意力从自己的身体痊愈转移到了一个让他深感不安的想法上：达米安的行动背后很可能有更大的阴谋。为了查清楚这到底是不是真的，法国最专业的刑讯人花了两个半月的时间对达米安严刑逼供，先是在凡尔赛宫，后来在巴黎古监狱中。1757年3月28日，复活节刚过，达米安就被处以极刑，方式极其残忍，这也准确反映了路易十五在经历了给他带来严重精神创伤的刺杀之后，法国发生了怎样的变化。
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行刑当日，下午3点不到，巴黎古监狱的狱卒将达米安拖出牢房。他很快被扒了个精光，绑在一辆车上，跨过塞纳河来到格列夫广场，在这里，16名行刑人已经安排好了一出将让他生不如死的壮观表演。他们使用了与处死弗朗索瓦·拉瓦亚克——一名狂热的天主教信徒，他在1610年杀害了受国民敬爱的亨利四世——同样的方法。首先，他们割开了达米安刺伤国王的那只手；然后，他们将煮沸了的硫黄、铅、油和蜡的混合物，倒在伤口上；继而对犯人身体的其他部分如法炮制。紧接着，行刑人开始准备将犯人开膛破肚、四马分尸。但计划实施得不太顺利。四名马夫（以及他们骑的四匹马）尝试了三十多次，但达米安的关节依然没有断裂。到了下午6点，行刑人决定将犯人的四肢稍稍切开，以便马匹再次尝试；这一回，达米安的胳膊和腿终于被扯断了，这个阴谋险些得逞的弑君者也断了气。作为最后一个象征性的动作，行刑人把达米安的残骸收拾到一起，扔进了熊熊烈火中。
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处决达米安，版画
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达米安的处决经过精心设计，意在名副其实地对他的身体和难以想象的行动“毁尸灭迹”。然而，这个狂人对君主的袭击成功地让路易十五的统治蒙上了一层阴影，使这位君主进入了一个异常阴暗且愈发保守的时期。尽管哲人们和百科全书派人士用了很多年的时间，强烈谴责导致达米安罪行的宗教狂热主义，但因为某些神职人员将《百科全书》与可能发生的革命带来的威胁联系了起来，辞典的编撰工作再次进入了险象环生的阶段。
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1757年，正当《百科全书》的编辑们准备出版辞典的第七卷时，辞典的批评者——保守派作家和愤怒的神职人员——又迎来了新一代的文学讽刺作家的加入，这群人花费了大量笔墨，写了很多反对启蒙运动哲人和《百科全书》的文章。[31]1757年10月，雅克-尼古拉·莫罗，一个为《风雅信使》供稿的写专栏文章的老手和政府的吹鼓手，发表了一些有关法国哲人的“实用性建议”。他在文中发明了一个伪人种论的术语——“鼓噪之徒”（Cacouac），用以描述宣扬思想自由的这个“部族”。他宣称这个术语源于希腊语（来自希腊语的kakos，意思是“坏的、卑鄙的”），这个词原本是用来让人们联想到愚蠢的鸭子嘎嘎的叫声，暗中将哲人们斥为一种“怪异”、“恶毒”且“腐化堕落”的生物，他们扭曲的思想则会产生毒液。[32]由于这第一篇文章取得了成功，莫罗继而发表了《作为鼓噪之徒的历史的新回忆录》，在书中他细致描写了这些奇怪人类的习性，以及打败他们的方法——吹口哨（相当于喝倒彩）。[33]这本书取得了不错的销量。
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能与莫罗的讽刺才能媲美的，只有机会主义作家、剧作家夏尔·帕利索·德·蒙特努瓦。和莫罗一样，帕利索意识到反对哲人的作品拥有广阔的市场。1757年，他发表了《有关大哲学家的小书信》，在书中指责狄德罗和达朗贝尔剽窃，嘲笑他们狂妄自大，奚落他们的观点前后矛盾，斥责他们对批评神经过敏。[34]除了这些攻击，《百科全书》还受到了更多更严重的谴责。最令人心惊的是由国王签署的一个控制煽动性言论和自由思想的声明，他想以此警告大众：任何人如果“创作，命人创作，或是印刷攻击宗教、煽动思想、损害国家权威、妨碍国家秩序与平静”的作品，将被判处死刑。[35]
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1757年，《百科全书》的第七卷就在这样一个充满火药味的氛围中问世了。在众多招致批判的条目中，达朗贝尔编写的“日内瓦”尤其不谨慎，吸引了最多的炮火。这一条目的其中一部分写于1756年，当时这位数学家正在日内瓦拜访伏尔泰，这个类似游记的条目可能是《百科全书》中唯一一个引发了国际性事件的条目。[36]
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达朗贝尔在条目的开头称赞了日内瓦的各种优点。他滔滔不绝、充满诗意地描述了这座城市在莱芒湖上的地理位置如何完美，它的人民如何富裕和勤劳。但是，在这段长度远超其他条目的文段中，达朗贝尔偷偷夹杂了不少无礼的观点。首先，他对日内瓦这座加尔文教城邦禁止一切戏剧作品的演出提出了批评，同时还贬低了这里的清教教堂中唱诗的质量。更令人难以忍受的是，他还将根本不属于这座城市的清教神职人员的神学信仰归于他们。据他说，大多数瑞士牧师都开始警惕地看待迷信和不必要的抽象化概念，甚至认为耶稣基督的神性以及其他基督教谜团（比如地狱）是荒谬且不必要的。他暗示说，这和国境线另一边的天主教神职人员的迷信行为，形成了极好的对比。[37]
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