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除了总部的处室，中央司令部有4个兵种成员司令部（美国空军中央司令部、美国陆军中央司令部、美国海军中央司令部和美国海军陆战队中央司令部），以及另外3个下属实体（安全援助办公室、美国中心特别行动司令部、联合航空航天行动中心）。它的成员司令部中，陆军和空军司令部的总部位于南卡罗来纳州萨姆特的索肖空军基地；美国海军司令部位于巴林岛的海军支持行动基地；海军陆战队和特种作战司令部位于麦克迪尔。在科威特和卡塔尔也有司令部和下属设施。中央司令部各部门中总部有2140人，兵种成员司令部有3268人，其他下属实体有589人。
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到2014年6月，总部人员中有1169人为中央司令部的情报机构情报处和中央司令部联合情报中心（Joint Intelligence Center, Central）工作。情报处通过“实施全资源搜集、分析、融合、测向、编制和分发”，向中央司令部司令官、成员司令部、美国使馆驻该国的小组、总统和国防部长“提供威胁预警、测向情报和评估报告”。如图6.2所示的情报处组织架构图所示，它的主要成员包括了5个分部：情报、监视和侦察（Intelligence, Surveillance, and Reconnaissance, ISR）；行动；计划；资源和需求；反情报与安保部门（X），其主要致力于搜集工作。据中央司令部的司令官称，该处与国家情报总监办公室保持着一个“紧密的工作关系”。
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图6.2 中央司令部情报处组织机构图
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如图6.3所示，为司令部提供的分析性情报支持来自情报处和中央司令部联合情报中心，其任务是为中央司令部司令官提供全源情报和预警、行动情报和评估，以满足战时和和平时期的需求，为成员司令官提供以任务为导向的情报支持，并制作和分发完整的情报。它的主要成员机构是分析和情报编制部门（南亚和中亚部、伊朗部、近东部、地区部和非国家威胁部）和测向和地理空间准备部门（联合定位因素部、地理空间情报部和作战序列部）。
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图6.3 中央司令部联合情报中心（JICCENT）组织架构图
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美国情报界（第7版） [:1702968356]
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欧洲司令部
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欧洲司令部（EUCOM）负责包括51个国家的地理区域。如上所述，非洲司令部的建立解除了欧洲司令部对于非洲大陆国家的职责。在苏联解体之后，欧洲司令部承担了对格鲁吉亚、亚美尼亚和阿塞拜疆的职责。它还负责以色列。
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欧洲司令部总部设在斯图加特，是两个前沿部署区域作战司令部之一；它有5个成员司令部，人员超过9.4万（包括超过7.3万名军人和2万多名文职人员）：美国海军欧洲和非洲部队（位于那不勒斯的海军支援设施基地）、美国陆军欧洲和非洲部队（德国威斯巴登）、美国空军欧洲和非洲部队（德国拉姆施泰因）、美国海军陆战队欧洲和非洲分部（斯图加特）以及美国欧洲和非洲特种作战司令部。欧洲司令部在战区还有21个基地或站点。
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欧洲司令部的J2部门负责管理欧洲联合情报行动中心（Joint Intelligence Operations Center-Europe）。据欧洲司令部的一份情况说明称，该部门“专注于优先为司令官提供预警、情况分析、相关预测评估，以及有关行动的‘动态安全’和方向战略的战略性内容”。这份情报说明还称，J2部门“平衡了战区战略决策者和行动司令官的需求”。如图6.4所示的组织架构图，欧洲联合情报行动中心的关键部门包括计划、行动和人力情报部和反情报部。
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图6.4 欧洲司令部联合情报行动中心（JIOCEUR）组织机构图
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司令部的分析性情报编制是“联合分析中心”（Joint Analysis Center）的职责，位于莫尔斯沃斯（后搬迁至布劳登英国皇家空军基地），直属于J2部门。联合分析中心的职能包括：
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●战区范围的全源分析和评估；
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●搜集管理；
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●多资源情报处理、开发利用和分送；
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●迹象和预警支持；
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●目标情报支持；
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●支持北约多国部队和美国联合特遣部队；
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●情报成品的分发。
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联合分析中心编制的报告包括：战区当前情报摘要；战区的区域评估；电子、空气、防御导弹和地面战斗序列；专题报告；迹象和预警报告；反恐、反情报和禁毒事件报告；演习分析和支持。
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2005年3月，欧洲司令部司令官詹姆斯·L·琼斯将军（James L.Jones）对国会某个委员会说，欧洲司令部“为巴尔干半岛的维和行动、美国在高加索的决策者提供了支持，并为非洲的危机应对和反恐行动提供了支持”。此外，琼斯说，欧洲司令部“以反恐分析的形式支持了全球反恐战争，并将近乎四分之一的分析员临时部署到伊拉克和阿富汗”。