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欧洲司令部（EUCOM）负责包括51个国家的地理区域。如上所述，非洲司令部的建立解除了欧洲司令部对于非洲大陆国家的职责。在苏联解体之后，欧洲司令部承担了对格鲁吉亚、亚美尼亚和阿塞拜疆的职责。它还负责以色列。
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欧洲司令部总部设在斯图加特，是两个前沿部署区域作战司令部之一；它有5个成员司令部，人员超过9.4万（包括超过7.3万名军人和2万多名文职人员）：美国海军欧洲和非洲部队（位于那不勒斯的海军支援设施基地）、美国陆军欧洲和非洲部队（德国威斯巴登）、美国空军欧洲和非洲部队（德国拉姆施泰因）、美国海军陆战队欧洲和非洲分部（斯图加特）以及美国欧洲和非洲特种作战司令部。欧洲司令部在战区还有21个基地或站点。
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欧洲司令部的J2部门负责管理欧洲联合情报行动中心（Joint Intelligence Operations Center-Europe）。据欧洲司令部的一份情况说明称，该部门“专注于优先为司令官提供预警、情况分析、相关预测评估，以及有关行动的‘动态安全’和方向战略的战略性内容”。这份情报说明还称，J2部门“平衡了战区战略决策者和行动司令官的需求”。如图6.4所示的组织架构图，欧洲联合情报行动中心的关键部门包括计划、行动和人力情报部和反情报部。
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图6.4 欧洲司令部联合情报行动中心（JIOCEUR）组织机构图
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司令部的分析性情报编制是“联合分析中心”（Joint Analysis Center）的职责，位于莫尔斯沃斯（后搬迁至布劳登英国皇家空军基地），直属于J2部门。联合分析中心的职能包括：
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●战区范围的全源分析和评估；
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●搜集管理；
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●多资源情报处理、开发利用和分送；
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●迹象和预警支持；
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●目标情报支持；
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●支持北约多国部队和美国联合特遣部队；
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●情报成品的分发。
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联合分析中心编制的报告包括：战区当前情报摘要；战区的区域评估；电子、空气、防御导弹和地面战斗序列；专题报告；迹象和预警报告；反恐、反情报和禁毒事件报告；演习分析和支持。
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2005年3月，欧洲司令部司令官詹姆斯·L·琼斯将军（James L.Jones）对国会某个委员会说，欧洲司令部“为巴尔干半岛的维和行动、美国在高加索的决策者提供了支持，并为非洲的危机应对和反恐行动提供了支持”。此外，琼斯说，欧洲司令部“以反恐分析的形式支持了全球反恐战争，并将近乎四分之一的分析员临时部署到伊拉克和阿富汗”。
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欧洲司令部包含了两个主要的处：支持处和情报处。如图6.5所示，情报处有5个下属部门：反恐（IDX）、欧洲/黎凡特（IDE）、欧亚大陆（IDR）、地理空间情报（IDG）和行动感知（IDO）。
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图6.5 欧洲司令部联合分析中心组织架构
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美国情报界（第7版） [:1702968357]
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北方司令部
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联合司令部结构方面的最大变化，是2001年9月11日恐怖袭击发生之后建立了北方司令部（NORTHCOM）。袭击发生之后不久，即出现了这个想法，得到了美国军方高层人士的支持。该司令部建立之前，有许多问题需要解决，包括该指挥部是否要控制自己的军事力量或是依赖于其他司令部提供军事力量以及对于以执法为目的地使用军事力量的法律限制。早在比尔·克林顿执政时期，建立这样一个指挥部的构想曾被提出过，但这个想法受到美国公民自由主义者和（据有关报道称）右翼民兵组织的抗议之后就被终止。
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2002年4月17日，美国国防部宣布成立美国北方司令部，将其他军事组织正在实施的国土防御和其他公民支持任务汇集到一个司令部。该司令部与北方航空航天防御司令部（Northern Aerospace Defense Command）一起驻扎在科罗拉多州彼得森空军基地，于2002年10月1日具备了初始工作能力。
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美国北方司令部有两个主要任务：
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●实施行动，探测、预防和打击针对美国、美国领土和特定职责区域利益的威胁和所有侵略行动，其中包括通过空中、陆地和海洋方式到达美国大陆、阿拉斯加和周围约500海里的水域以及墨西哥湾、波多黎各和维京群岛；
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●在总统或国防部长的指令下，提供对文职部门的防御支持，包括后果影响控制。