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国家反恐怖主义中心主任的其中一项工作，就是对恐怖主义威胁的问题做定期的涉密或非涉密评估。例如，2011年9月，中心主任向参议院国土安全委员会和参议院政府事务委员会作报告《“9·11事件”十周年：我们比以前更加安全了吗？》，内容包括恐怖主义威胁的演变、基地组织分支的形成，以及国家反恐怖主义中心的角色定位、活动和其所面临的挑战。
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情报理事会（Directorate of Intelligence）负责“指挥美国联邦政府反恐怖主义形势的分析和整合”。主要内容包括评估恐怖主义势力的安全港、分析支持恐怖主义活动的国家、推进全球反恐合作以及分析地区公布注意组织等，这些工作的开展都要求整个情报系统的相互协调配合。
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图17.2 美国国家反恐怖主义中心组织结构图
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追击小组（Pursuit Group）是情报理事会的一个部门，于2010年1月创建。该小组主要负责追踪恐怖主义行踪，尤其侧重于那些有可能威胁到美国或其在海外利益的恐怖主义行踪。追击小组的分析师们追踪“恐怖主义威胁与美国之间的不明显的或不明原因的联系，辨别未知的、已知的或有嫌疑的恐怖分子，并深究那些看上去并不重要的细节，以防止其对美国利益产生危害”。除此之外，情报理事会的组成部门还包括（或曾经包括）：激进或极端信息小组，武器、战术与目标小组以及基地组织和逊尼派极端主义小组——这些小组内部都活跃着很多曾在情报系统各个机构工作过的分析师们。
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战略行动计划理事会（Directorate of Strategic Operational Planning）负责指导联邦政府的计划——动用国家的一切力量抗击恐怖主义威胁。国家反恐怖主义中心主任于2011年表示，该委员会整合了计划周期的全部过程——提出计划、监督实施、评估其有效性与资源分布情况——并创造了协调整合计划并实施计划的利益共同体。行动支持理事会（Directorate of Operational Support）负责向反恐怖主义部门提供全天候的情报作战视图（common intelligence picture），以帮助各部门了解反恐态势、恐怖分子威胁以及对全球、全国突发事件的跟踪报告。
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恐怖分子身份资料理事会（Directorate of Terrorist Identities）（前身为信息共享与发展理事会）巩固了其作为信息资源库的职能，主要负责搜集全球恐怖分子的身份信息，并确保联邦政府机构能够获取他们需要的恐怖分子身份信息。国家反恐怖主义中心（NCTC）在2012年5月发布的名为“信息共享规则与渠道”的文件中规定，国家反恐怖主义中心将与共同致力于反恐怖主义活动的兄弟机构共享资源信息。
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恐怖分子资料理事会的一份文件描述了2013年实施完成的两项任务，即：成功地建立了100万人的恐怖分子资料数据库环境（Terrorist Identities Datamart Environment）和Kingfisher图片处理库源代码扫屏工具的扩展，该工具“可以综合大量数据的格式以有助于提高现有恐怖分子资料信息的用途”。国家反恐中心还指定恐怖分子资料理事会负责向波士顿马拉松爆炸案的调查提供支持，并为生物鉴定报告的制作提供支持，以及帮助恐怖分子资料数据库环境的进行分类指导。这些都是国家反恐中心所取得的成就。
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国家情报管理办公室（Office of National Intelligence Management）的前身为情报任务管理理事会。该办公室现在主要负责与反恐怖主义情报和任务有关的战略管理，并决定情报分析和搜集任务的优先级，同时负责间谍情报技术的分析与培训，并制定战略计划、评估计划完成效果与安排预算。
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国家反恐怖主义中心还与国土安全部和联邦调查局共同参与了联合反恐评估小组（Joint Counterterrorism Assessment Team）。联合反恐评估小组建立于2013年4月，前身是2007年成立的跨部门恐怖主义威胁评估协调小组。联合反恐评估小组的指责是产出联邦协调情报，内容涉及“有可能影响当地或地区公共安全状况的重大国际恐怖主义事件”。
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美国情报界（第7版） [:1702968445]
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国家反扩散中心
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国家恐怖袭击委员会向联邦政府建议，设立防止大规模杀伤性武器扩散中心，并归国家情报总监领导。在其2005年3月发布的报告中，美国大规模杀伤性武器情报能力委员会（Commission on the Intelligence Capabilities of the United States Regarding Weapons of Mass Destruction）明确建议，总统应成立一个国家反扩散中心（NCPC），其机构规模应相对较小（工作人员少于100人），负责在整个情报界范围内管理和协调与核武器、生化武器相关的情报。
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即使是在这份报告发布之前，2004年《情报改革与防范恐怖主义法案》的一个条款已经明确规定，美国总统应在该法案生效的18个月内成立一个国家反扩散中心（NCPC），并成为分析和整合一切与核扩散有关的情报的主要部门，确保美国各部门能够及时获得情报支持并帮助其开展反扩散行动，协调不同部门和机构之间的反扩散计划和行动以及为美国政府机构执行战略性反扩散行动。该法案还为美国总统放弃一些对提升美国反扩散能力没有帮助的条款提供了法律保障。2005年8月8日，根据《情报改革与防范恐怖主义法案》的规定，国家情报总监约翰·内格罗蓬特任命肯尼斯·布里尔为反扩散任务负责人（Counter-proliferation Mission Manager）和即将成立的国家反扩散中心主任，这使得布里尔成为国家情报总监在反大规模杀伤性武器扩散问题上的主要顾问。
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由于布什总统放弃了一些新的条款，新建立的反扩散中心并不完全是情报改革方案内容中所要求的那样。因此，该中心并没有取代中央情报局武器情报、防扩散和军备控制中心。新建立的中心主要负责在情报系统内部协调战略计划，并为美国阻止大规模杀伤性武器扩散、阻止武器和原材料的运输以及相关技术流通提供情报支持。国家反扩散中心还被允许与情报界协作，辨别情报搜集、分析与运用过程中关键的情报缺口与不足，并为改善或弥补这样的情报缺口提出解决方案。该中心还要负责鉴别远期的扩散威胁，并提出工作要求以便确保情报系统能够妥善处理这些威胁和难题。国家反扩散中心还要保持与情报系统内外不同机构、组织的联系，这有助于中心发现新的工作方法或获得新技术，帮助提高情报系统工作能力，在未来有效地发现和阻止核扩散威胁。这要求反扩散中心与情报系统不同部门、其他政府机构、政策制定者、专家学者以及商界人士取得很好的沟通。图17.5是国家反扩散中心的组织架构图。
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图17.3 国家反扩散中心组织架构图
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美国情报界（第7版） [:1702968446]
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国家反情报与安全中心
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国家反情报与安全中心（National Counterintelligence and Security Center, NCSC）于2014年12月1日成立，它是国家反情报执行局（National Counterintelligence Executive, NCIX）（1995年成立）的延续。2002年颁布的《反情报促进法案》指定反情报执行官为国家反情报执行办公室（ONCIX）的负责人，并使他/她负责美国政府的反情报与安全工作。2004年的《情报改革与防范恐怖主义法案》规定国家反间谍执行局（NCIX）和国家反情报执行办公室归国家情报总监办公室管理。
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NCSC负责编制《国家威胁识别和优先级评估报告》（NTIPA）、其他反情报分析材料以及美国国家反情报战略。此外，该中心还负责为反间谍情报的搜集、对间谍活动的调查以及反间谍行动等工作设置优先级。其工作职能还包括监督和管理反情报计划预算和成果评估以及培训和提高反情报意识（counterintelligence awareness）。此外，该中心还负责进行损害评估（damage assessment），其中就包括安娜·贝兰·蒙特斯事件——这位供职于美国国防部情报局的高级古巴情报分析员向古巴情报部门提供了情报。
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2010年，国家反情报执行局吸收了国家情报总监特别安全中心（DNI Special Security Center）——该中心后来整合为国家反情报执行办公室特别安全理事会（ONCIX Special Security Directorate, SSD）——和安全评估中心（CSE）两个部门。国家反情报执行办公室特别安全理事会（ONCIX SSD）的职能包括制定、管理和监督情报系统的密级评级系统，并作为国家情报局与安全管理部门的对接单位。图17.6是美国国家反情报执行局组织结构图。安全评估中心负责在情报系统和国务院之间协调情报相关事务。
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图17.4 美国国家反情报执行局组织结构图
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