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然而有些时候，美联储作为最后贷款人，在危机来临时所采取的拯救措施也不一定是合适的。1998年对LTCM公司的拯救行动，就使美联储受谴责。
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LTCM公司是美国最大的对冲基金之一，其创始人是被称为点石成金的华尔街债券之父约翰·麦瑞威瑟，同时一些著名的经济学家以及官员亦聚在该公司旗下，如1997年诺贝尔经济学奖得主罗伯特·C·默顿同迈伦·休斯，前美联储副主席大卫·莫里斯，以及前所罗门兄弟公司债券交易部主管罗森菲尔德。
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麦伦·休斯和罗伯特·C·默顿皆为LTCM主要发起人。
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对冲基金的特点是采取奖励性的佣金（通常占15%-20%），基金投资于多种资产，只做多头的基金，利用杠杆效应或利用各种套利技术牟利。格林斯潘界定对冲基金是一家通过将客户限定于少数十分老练而富裕的个体，组织安排他们避开管制，以追求大量金融工具投资和交易运用下的高回报率的共同基金。
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LTCM的确是一家这样的公司，1994年创立，初始资本50亿美元，各大金融机构借入1200亿美元，最高交易额高达12500亿美元。在1994-1997年间业绩辉煌，每年投资回报分别为28.5%、42.8%、40.8%、17%，1997年，1美元分派2.82美元红利。随后，LTCM将业务投向一些新的领域，如股票和商业抵押，以及新兴地区市场，如俄罗斯、巴西等地。
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1998年俄罗斯金融危机爆发，8月宣布卢布贬值，停止国债交易，并冻结国外投资者贷款偿还期90天，投资者从新兴市场和较落后国家的有价证券撤资转持低风险高质量的美国和德国政府公债，大量资金涌入美国和德国公债价格迅速上涨，利率不断下降，全球借贷利差急剧加大，由于LTCM的风险分散是地域性而非战略性，故而在8月21日这天损失了5.5亿美元，8月31日，净资产下降至23亿美元，遭受了惨痛的损失。
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在整件事情当中，美联储所做的事情包括：
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1.1998年9月初，LTCM合伙人与美联储官员接触，通报所处的困境，以及与投资公司商谈计划，募集新资本。
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2.1998年9月19日，纽约联储银行行长向美联储主席通报，LTCM的状况正在恶化，募集资本的努力已告失败，联储局派遣工作小组到LTCM。
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1998年9月23日，美孚银行、贝尔斯登、大通曼哈顿、高盛、J.P.摩根、雷曼兄弟、美林证券、摩根士丹利添惠和所罗门兄弟等公司的老板们在纽约联准银大楼10楼会议室会面协商援助LTCM事宜。
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3.1998年9月21日，纽约联储银行与LTCM的主要投资人高盛、美林证券和J.P.摩根接触，希望单个买家能收购LTCM的所有投资组合。但是，当天LTCM单个交易日损失5亿美元，资本金缩减到6亿美元。LTCM的主要结算代理商贝尔斯登要求LTCM对未来的结算额提供担保。
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4.1998年9月22日，美联储官员与LTCM的其他信贷人接触，讨论由LTCM的主要债权人和OTO市场的各大交易商（14家）成立合资公司，向LTCM注入资本金。
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5.1998年9月23日，美联储官员通电外国中央银行官员，通报LTCM的情况。财政部向商品期货交易委员会通报了LTCM的问题，商品期货交易委员会派出审计人员到LTCM，贝尔斯登，美林证券调查LTCM的账户。总统工作小组成员举行电话会议，合资公司的14位成员同意成立合资公司协议的条款，LTCM接受方案。
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6.合资公司（托管合伙人）向基金注入36亿美元，并正式管理和经营基金。在接管以后的头两周内，LTCM继续亏损，到1998年12月中旬，盈利4亿美元，到1999年6月30日，逐步走出困境，发起合伙人得到合资公司的许可，开始筹建新的机构，至此，LTCM危机基本消除。
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但是美联储对于不属于其监管对象的LTCM实施援助，导致批评之声此起彼伏。批评者认为LTCM应该为其投资失败承担相应的责任，美国政府一向标榜市场自由开放政策，反对干预，而在LTCM事件上却放任美联储出手干预，这违背了市场公平原则；其次，这件事为整个市场开了一个危险的先例，美联储无异于向市场发出了一个错误的信号——你赌得越大，政府越不会让你破产，所导致的结果是各类金融机构将会更加放心地进行大额投机，人们相信只要交易额够大并把一些大型金融机构牵扯进来，就不用害怕自己会倒闭，这等于是用整个国家的金融系统来要挟政府，反正最终美联储一定会出面救助；最后，当政府要求领取社会救济的母亲去工作，并拒绝给予小公司、小农场补贴，同时却去救助像LTCM这样的投机商，这种举措会迫使失公众对政府的经济改革失去信心，救助LTCM可以说是对亿万富翁在华尔街赌博行为的奖励。
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不过对于这些批评，美联储却有着不同的看法。
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美联储认为这一行为虽然罕见，却并非完全不合理。格林斯潘表示，首先，LTCM在世界各地投资总额超过900亿美元，如果倒闭，会导致市场资金流动陷入混乱，对全球已经波动剧烈的金融市场无疑于雪上加霜；其次，美联储并没有使用公共资金来援助LTCM，也没有提出动用政府资金的建议，等于没有损害广大纳税人的利益；最后，LTCM是一个孤立的事件，这决不意味着再遇到这样的状况，美联储仍然会给予救助，美联储反而应当加强对对冲基金的管制。
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客观来看，无论谁对谁错，作为最后贷款人的美联储，在今天已经成为了美国金融体系必不可少的反危机组织，并在其成立以来的数次危机中都起到了至关重要的作用。最后贷款人的作用在2000年后的次贷危机中更是体现得异常充分。
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2000年美国互联网泡沫破灭后，为了缓解其对经济增长造成的冲击，美联储于2001年1月将联邦基金利率由6.5%下调5个基本点，从此拉开了降息的大幕。“9·11”恐怖袭击进一步打击了消费者信心，美国经济在2001年陷入谷底，GDP增长率从1997年至2000年的年均4%左右，一下子跌落到了0.8%。
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为了刺激居民消费，提升企业和个人投资意愿，美联储采取了极具扩张性的货币政策。经过13次降息，到2003年6月联邦基金利率已下降至1%，创45年来最低水平。
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在美联储长达3年的扩张性货币政策刺激下，美国经济重新走强，但也带来了经济运行风险。长期持续的低利率降低了借款成本，引起信贷的急剧膨胀（2003-2007年中，美国年均信贷量增长了7%），也推高了资产价格，特别是刺激了房地产市场的快速扩张。房地产市场的繁荣带动了房价一路攀升。
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2000-2007年房价涨幅大大超过了过去30多年来的长期增长趋势，标准普尔凯斯席勒房价指数显示，2006年6月美国房价涨至189.9的历史新高，是1996年年底的2.34倍，2000年以来上涨了93.2%。
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