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查士丁尼认为，为了扼杀再发生“尼卡骚乱”之类事件的可能性，必须强化皇权，除了加强军力以外，还要削弱元老院的影响。
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查士丁尼为了统一人们的思想，对于非基督教的异教加强了镇压。他认为这些异教邪说是不利于皇权的巩固的。他下令关闭了著名的雅典哲学学院，许多教授被赶走了，有些教授逃往伊朗，学院的财产也被没收。
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查士丁尼神化皇权和他本人的另一项重要措施是大建教堂，费钱再多也在所不惜。君士坦丁堡原来的圣·索菲亚教堂在公元532年“尼卡骚乱”时被群众焚毁。查士丁尼不想在原址上修复，决心重建。费时6年，耗费的黄金总量多达32万磅，据说为此耗尽了国库里的黄金，终于建成了新的圣·索菲亚大教堂，其恢宏程度远远超过了罗马城内所有的教堂（见图3-1）。除圣·索菲亚大教堂外，在首都君士坦丁堡，查士丁尼还新建和改建了24座教堂。而在东罗马帝国境内的其他城市，也都仿照君士坦丁堡而大建教堂，总数达1000多座。
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图3-1 圣·索菲亚大教堂
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盛世中危机四起
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“尼卡骚乱”的爆发和镇压，是查士丁尼一世执政时期的一个转折点，使查士丁尼感觉到自己的统治远不是那么巩固，从另一个角度表明深层次的社会矛盾的存在，社会危机的四起可能同国运的衰落有密切关系。
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公元539年，也就是“尼卡骚乱”结束后的第7年，伊朗萨珊王朝便以查士丁尼不遵守诺言、拒不把西征的战利品分给萨珊王朝为借口，向东罗马帝国开战。萨珊王朝采取的是突然袭击的战法，占领了某些城市，掳到居民和财富就撤，等东罗马援军赶到，伊朗军队已撤回本土。东罗马军队疲于奔命，查士丁尼不得不向萨珊王朝求和，并向萨珊王朝缴纳贡品。
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接着，到了公元559年，北部边境在平静了大约100年之后，又遭到匈奴骑兵的侵袭。匈奴骑兵人数并不多，突然越过多瑙河，穿过巴尔干半岛，直逼君士坦丁堡城下。东罗马帝国毫无准备，惊慌不已。查士丁尼只得再让年事已高的贝利撒留率军迎战，大败匈奴人，保卫了君士坦丁堡。查士丁尼由此感到帝国北部防务一刻也不能松懈，为此必须增加北部防务开支。
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同萨珊王朝之间关系紧张需要增拨军事经费，为了巩固北部边防和防止匈奴人再度南侵，也需要增拨军事经费，而在君士坦丁堡和东罗马境内各个城市大修教堂又耗尽了国库财力，此外，消灭汪达尔王国和东哥特王国后派兵留守同样需要军费，在此财政紧急关头，查士丁尼不得不开征新税。更重要的是，查士丁尼下令实行新的地产纳税联保制，由此开征“连保地税”。比如说，在战争时期，居民逃亡了，或瘟疫盛行，居民都逃奔他乡，留下了荒芜的土地和闲置的房屋，于是纳税负担落到了不愿出逃或无力出逃的居民头上，他们要为纳税负连带责任。
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此外，为了保证军粮的供应，查士丁尼一世又恢复了罗马帝国历史上曾经实行过的、由城市中富裕户承担的军粮缴纳制。这又加重了城市工商业户的负担。
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国家对工商业生产和经营的管制这时也强化了。纺织品、陶器、贵重装饰工艺品的生产等等，主要由政府直接经营。国家甚至还经营染坊、羊毛和亚麻纺织工场、面包房。某些产品尤其是丝绸的进口，全部由国家买下，实行垄断经营。于是私营丝绸工场、店铺不得不关闭，大批技术熟练的丝绸工匠不得不逃往萨珊王朝境内谋生。
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尽管查士丁尼在执政初期曾经推行过鼓励工商业发展的经济政策，但后来财政危机日益严重，他又转到了重税、苛税甚至强征暴敛的道路上来。
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查士丁尼王朝的终结
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查士丁尼自公元527年登上皇帝宝座到公元565年因病去世，在位38年。皇后狄奥多拉死于公元548年。她死后，查士丁尼变得心灰意冷，疑心越来越重，对谁都不相信，一心想使自己神化，并使这种神化成为制度。
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查士丁尼年老时同大多数老皇帝一样，好猜忌、多疑，唯恐将领、贵族和身边的人篡位夺权。跟随他几十年的大将贝利撒留立功无数，威信极高，一直到老年时还率军打败了匈奴人从北部边境对君士坦丁堡的进犯。但战争一结束，查士丁尼就撤去了他的兵权。
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查士丁尼临终前，帝国从外表上看仍是强盛的，但国库已经空虚，兵力也已大大减少。有限的兵力除了分布于东帝国各地外，还要分布于查士丁尼收复的失地。留守于首都君士坦丁堡的，不过是少数禁卫军而已。
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查士丁尼死后，接下来的三个皇帝是：查士丁二世（公元565-578年）、提比留二世（公元578-582年）、莫利斯（公元582-602年）。他们虽然称不上是什么雄才大略的君主，但也都不是昏君或暴君。他们力图支撑起这座已千疮百孔的大厦，却都力不从心。而国际形势则继续发生不利于东罗马帝国的变化。
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第一个变化是：公元568年，日耳曼人中的一支伦巴第人从北部进入意大利，赶走了驻防在意大利北部的东罗马军队，建立了伦巴第王国。据说他们比任何其他北方蛮族部落都更为凶残，西罗马帝国境内那些曾被东哥特人占领的地区的意大利人又陷入苦难之中，而东罗马政府对此已无能为力。
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第二个变化是：在东罗马帝国北部边境上，又聚集了两支准备入侵的蛮族军队：一支是斯拉夫人，他们由东欧南下，陆续进入巴尔干半岛；另一支是阿瓦尔人。阿瓦尔人是中国南北朝时期北方游牧民族柔然人的一支，属于鲜卑族，他们约在公元5世纪初在中国北方建立了强大的国家，即柔然汗国。柔然人起先想南下，但中国北方这时已建立较强大的北魏政权，后被北魏击败。突厥人原来依附于柔然汗国。柔然人被北魏打败后，突厥人力图摆脱柔然的统治，并于公元552年打败柔然。柔然人被迫西移，越过乌拉尔山，进入东欧，再南下逼近东罗马边境。公元582年，柔然人（这时被称为阿瓦尔人）侵入东罗马境内，成为东罗马的又一劲敌。
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第三个变化是：由于赋税加重，兵源又不足，只有使军费不断增加才能招募新兵来对抗斯拉夫人和阿瓦尔人的南侵，查士丁尼以后的三个皇帝都为此事发愁。三个皇帝中的最后一位——莫利斯想出了一个办法，就是禁止修道院收容难民。这等于断了修道院的财路。逃难者则认为莫利斯断了他们的生路。
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由于军费不足，军队发不出军饷，军官和士兵都反对莫利斯。公元602年，军官福卡斯发动政变，篡夺皇位，杀死了莫利斯皇帝、皇后和他们的子女，查士丁尼王朝亡。朝中的大臣和贵族大批被处决。福卡斯是一个野心家，急于立功，下令把驻防在巴尔干防区的军队调往西亚，同伊朗萨珊王朝开战，不料竟被打败。而巴尔干防区空虚后，阿瓦尔人乘虚进攻，一直打到君士坦丁堡城下。在这万分危急之际，君士坦丁堡的臣民请求阿非利加总督赫勒克留率军来保卫君士坦丁堡。赫勒克留以年长为借口，派儿子小赫勒克留率舰队在君士坦丁堡登陆，保住了君士坦丁堡，并推翻了篡位者福卡斯。
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公元610年，小赫勒克留被拥戴为皇帝，从此开始了东罗马帝国的另一个王朝：赫勒克留王朝。
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