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李旦与荷兰人早在日本就建立了商务关系，在中国台湾、福建和日本的三角贸易中，也是一方之霸。之前福建总兵俞咨皋[3]即曾通过李旦的影响力，不让日本商人与中国海商到澎湖和荷兰人做生意，使荷兰人孤立无援；这次更通过李旦让荷兰人撤出澎湖到台湾去。现在回头看，荷兰人占领台湾，福建地方官应负起直接责任。
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李旦介入谈判时，向荷兰人分析情势，建议荷兰人据守台南安平港，因为鸡笼和淡水不是优良的船舶停靠地，且附近番人很凶恶，虽然有金矿，但中国人不会说出金矿的产地。他的话影响荷兰人选择到中国台湾南部，也是中国台湾历史从南向北发展的原因。
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李旦之所以积极协调，力促荷兰人放弃澎湖，带有私人利益的考量。他属于漳泉海商，菲律宾是其主要贸易地区，荷兰人占据澎湖之后，坚持“不准中国商船到马尼拉”条款，使他在中国台湾、福建与日本的三角贸易受到影响，若能让荷兰人放弃这个条件，最大受益者正是李旦等海商（图2.8）。后来荷兰人来到台湾，甚至完全要依赖李旦的中介，才能取得中国大陆的生丝。
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图2.8 16、17世纪的汉人海商
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按翁佳音教授的研究，16世纪以来，海盗与地方官、海商之间利害关系盘根错节、互为应援，与地方府县财政税收、地方势力经济利益相互挂钩有关。（台湾“中央研究院”台湾史研究所翁佳音教授提供）
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民间海商竟然可以介入国家重大事务，可见明朝地方官商勾结情况之严重。但也正因如此巨大的商业利益，官商之间才积极合力地促成荷兰人在中国台湾落脚！荷兰人与中国台湾的关系竟在这种前提下联结，如今看来不免令人心生感触。
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附注
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1. 此事件记载于中国史书《粤剑篇》。
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2. 此事件记载于《明神宗实录》。荷兰人韦麻郎为何可以随意停泊在澎湖，难道澎湖是无人管辖之地吗？元朝时（1360年[4]，至正二十年）澎湖曾设立巡检司，隶属福建省晋江县；明朝建立后，1387年（洪武二十年）加以撤除；1597年（万历二十五年）增设澎湖游兵，一总四哨，战船两艘，兵八百，春冬汛守。也就是说，官兵驻守之期约在4月到6、7月，以及10月到12月前后，将近半年。韦麻郎登陆可能是在冬天明军驻守撤防的空隙；也可能是负责的官兵玩忽职守，因而让韦麻郎得以自由进入。
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3.科恩规划的蓝图是：先由班达群岛开始，占领长满豆蔻与香料的岛屿，再将触角伸向出产丁香的摩鹿加群岛，及出产胡椒的爪哇与苏门答腊，最后再夺取亚洲所有的贸易点，包括马六甲、锡兰、中国澳门以及菲律宾。
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4.传说中，巴达维亚（Batavia）人居住在尼德兰地区，曾反抗过罗马帝国，并把罗马人赶走，“巴达维亚人”象征英勇、道德与爱好和平。到了16世纪及17世纪荷兰的“黄金时代”，这个传说成为荷兰人文化身份认同的标志。荷兰人将雅加达命名为“巴达维亚”，希望在东印度地区建立荷兰人的海外国度。
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5.雷尔生所率舰队进入澎湖列岛时，是在1622年（明天启二年）7月10日，正是明朝驻守撤防之际。
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6.翁佳音教授强调，一般以为在荷、郑时代以前，澎湖只是荒凉的海盗渊薮之地，其实是误解。近代初期东亚交易往来圈的脉络中，不能忽略其在荷兰时代是重要的转运站。
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7.甲必丹（Captain）是由葡萄牙语Capitão（舰长）而来。
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今昔地名对照 西印度 今加勒比海地区 东印度 今印度及其以东地区，现改称为“东亚”或“远东” 东印度群岛 今印度尼西亚各群岛 香料群岛 摩鹿加群岛 巴达维亚 今印度尼西亚首都雅加达 暹罗 今泰国 锡兰 今斯里兰卡 大事记
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1581 荷兰脱离西班牙，但至1648年才真正独立
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1600 英国东印度公司成立
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1601 荷兰人范聂克到中国澳门，中国史书上第一次出现“红毛人”
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1602 荷兰东印度公司成立
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1604 荷兰人韦麻郎到中国大陆和澎湖，并开始探勘台南安平港
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1612 科恩抵达印度尼西亚，1619年升任为荷兰东印度公司总督
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1622 荷兰人占领澎湖，雷尔生在风柜尾建城堡
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1623 福建巡抚南居益诱杀荷兰人法兰斯尊
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1624 明、荷爆发澎湖之战，李旦介入议和；荷兰人放弃澎湖列岛，转而占领台湾岛