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亚东虽设立海关，但有名而无实。1894～1913年，亚东海关近20年里，实际上始终没有收过税。亚东海关经费由清政府的总税务司署通过汇丰银行拨给，按季汇拨，每次3000至5000海关两（关平银）不等。亚东海关仅对进出口货物进行检验，查禁违禁之物，对货品种类、数量、价值等进行登记、造册，按月季年分别统计，上报总税务司署。亚东海关历任官员（税务司）都是由清政府雇佣的英国人。[143]
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亚东海关对1894～1910年（光绪二十年至宣统二年）中国西藏与英印之间贸易情况有详细的登记，这些保存完整的资料为我们今天了解当时的经济贸易交往情况，提供了珍贵的历史资料。根据统计数据在17年间亚东海关贸易数额进口货物总额14006329卢比，出口货物总额13619535卢比，进出口总值27625864卢比。
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下表反映了清末亚东海关贸易的基本情况：
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1894～1910年西藏亚东海关贸易情况统计表
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续表
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西藏亚东等地被英国强迫开辟为商埠之后，英印输往西藏的商品数额急剧上升。有统计资料表明，英属印度向西藏输入商品的价值额在1889～1890年为131458卢比，在1890～1891年为199788卢比，在1891～1892年为203131卢比，在1892～1893年为229117卢比，在1893～1894年为331613卢比，在1894～1895年为447802卢比。[144]仅从这份资料看，英印在1889～1895年向西藏输入的商品数额都是逐年增长的，其年平均增长率为22.7%。其中1889～1893年的增长幅度不大，而1893年后的增长幅度则极为明显，1893～1894年的增长率为44.74%，而1894～1895年英印向中国西藏输入商品的价值额是1892～1893年的近两倍。[145]
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西藏地区在1889～1907年经由亚东出口的商品总值各年分别为：
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1889年为131548卢比，
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1890年为199788卢比，
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1891年为20313l卢比，
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1892年为229117卢比，
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1893年为331613卢比，
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1894年为398131卢比，
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1895年为634086卢比，
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1896年为781269卢比，
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1897年为820300卢比，
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1898年为817851卢比，
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1899年为822760卢比，
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1900年为710012卢比，
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1901年为783480卢比，
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1902年为815338卢比，
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1903年为687324卢比，