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③ 卡夫卡（Franz Kafka），捷克作家，表现主义文学的先驱。他的小说中（尤其是《审判》和《城堡》）经常描写死板僵化到荒谬程度的官僚制度。——译者注
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④ 准确地说，是“几乎”无所事事。有些内含子获得了某种功能，比如与转录因子结合，有时候又像RNA一样具有活性，可以影响蛋白质合成或其他基因的转录。遗传学界正处在关于非编码DNA功能的大争论之中，争论的结果可能会开启这个领域的新时代。有些非编码DNA显然具有一定功能，但我比较偏向怀疑论者。怀疑论者认为（人类）基因组中的大部分序列都不受限制，可以随意漂移变化，而DNA的功能却是由序列精确定义的，这些不受限制的DNA成分也就没有功能可言。如果一定要我做个估计，我会说人类基因组中大约20%的序列是有功能的，其他的基本上是废物。但这并不是说它们一点用处也没有，也许它们有其他的目的，比如填满空间。毕竟，自然讨厌真空。
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⑤ 棘轮是一种机械装置，只能往一个方向转动。——译者注
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⑥ 我们称同一个基因的不同版本为等位基因（alleles）。特定的基因在一条染色体上的位置是固定的（这个位置称为基因座，locus），但在不同的生物个体之间，这个特定基因的具体序列可能有差异。如果某些特定的基因版本在种群中很普遍，那么它们就被定义为等位基因。等位基因就是在不同生物个体的相同染色体、相同基因座上，具有多态性的各个变体。等位基因和突变基因的区别在于出现频率不同。一个种群中出现新突变的频率很低。如果这个突变带来一些优势，它就有可能在种群中扩散，直到这个优势被某种劣势平衡。稳定下来的新突变基因，就成了一个等位基因。
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⑦ 即所谓的男性基因，以SRY基因为代表。这些基因的功能是发出信号，促使整个个体发育出男性特征（人类胚胎在发育初期，在SRY基因没有启动之前，全都是女性构造）。所以这些基因是有表现型的，也就会接受自然选择。——译者注
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⑧ 有效种群的规模反映了一个种群中基因多态性的丰富程度。从抵抗寄生感染的角度来看，一个无性生殖的种群就相当于一个单一个体。只要有寄生物发生适应性变化，让它能够针对这个种群独特的基因组合，那么感染就可能摧毁整个种群。相反，有性生殖的大种群，虽然基因都是那些基因，但同一个基因一般都有很多版本的等位基因，所以基因多态性很丰富，基因组合非常多。那么，总有一些个体对某种特定的寄生感染具有抵抗力。上述两个种群即使个体数目相同，后者的有效种群规模也要大得多。
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⑨ 另外还有一位著名的英国生物科普作者马特·里德利（Matt Ridley），他著有《基因组：人种自传23章》《红皇后》等科普名著，也深入讨论了有性生殖的问题。此处不应混淆。——译者注
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⑩ 布莱克斯通甚至根据线粒体的生物物理特性，提出了一个可能的机制。宿主细胞因为基因突变而生长受阻，对ATP的需求也会很低，细胞内很少有ATP被分解为ADP。而因为呼吸作用中的电子流是由ADP浓度决定的，ADP浓度降低就会导致呼吸链开始堆积电子，反应性升高，形成氧自由基（下一章会详细讨论自由基的问题）。今天的某些藻类，自由基从线粒体中泄漏时会刺激形成配子和进行有性生殖；这种反应还可以被抗氧化剂阻断。那么自由基有没有可能直接刺激细胞、触发膜融合呢？有这种可能性。我们已知细胞受到辐射伤害时，自由基会以某种机制导致膜融合。如果是这样，这种天然的生物物理过程就可以作为后续自然选择的基础。
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⑪ 从数学角度看，这三种假说只不过是彼此的不同版本，每个版本都取决于线粒体的突变率。在简单突变累积模式中，突变线粒体的累积速率当然取决于突变率。同样，当自私的突变线粒体出现时，它的复制会比一般种类快一些，所以新的突变线粒体会在种群中扩散。数学上这等同于更快的突变率，即在相同的时间内会出现更多的突变线粒体。相互适应（coadaptation）模式则完全相反。有效突变率降低的原因是核基因会适应线粒体的突变，让这个线粒体不再有害；根据我们的定义，它就相当于没有突变。
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⑫ 还有很多其他的可能原因，比如确保远缘交配、生物信号和外激素。既然有性生殖需要两个细胞结合，首先它们必须找到对方，还要确定对方是正确的细胞（属于同一物种）才行。细胞通常靠趋化性（chemotaxis）来寻找对方，也就是说它们会释放外激素（就像是一种气味），然后其他细胞会沿着外激素的浓度梯度向上移动，寻找释放的源头。如果两个配子都释放同样的外激素，彼此就有可能搞混，然后追着自己释放的外激素转圈。最好只有一个配子释放外激素，而另一个游过去。所以，两种交配型的区别或许与求偶问题有关。
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⑬ 例如，发育生物学家利奥·巴斯（Leo Buss）认为，会移动的动物细胞有可能出于自私的目的侵入生殖细胞，企图延续自身。而植物细胞则因为有细胞壁而无法移动，所以不需要形成带有差异的配子。但是，海绵和珊瑚也由可以移动的动物细胞组成，然而它们和植物一样，没有特化的生殖细胞。所以我很怀疑这种说法。
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⑭ 随着年龄增长，人体细胞、组织、器官所发生的变性、坏死等病理变化。——编者注
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