1700231070
这种类型的出版偏倚存在了很长一段时间，并且影响了很多类型的研究。另一个调查的例子是，研究人员向人们询问他们目前的就业状况，随后继续询问是否自身存在某些缺陷限制了他们去获得工作。一些未找到工作的人，倾向于“编造”自身存在某种缺陷，以此为他们的无业状态做辩护。在调查中，这些“编造”的过程都受到了“评判偏差”（justificationbias）的影响。换言之，当人们试图描述自身目前的就业状态时，会刻意去回答另一些方面的问题。总的来说，失业状况会导致有关自身缺陷的报告数量增加，而成年后较差的生活状况会导致有关童年创伤的报告产生，但是如果其生活状态有所改善，这些报告也可能不会出现。
1700231071
1700231072
18.A. Caspi, K. Sugden, T. E. Moffitt, A. Taylor, I. W. Craig, H.Harrington, J. McClay, et al., “Influence of life stress on depression: Moderation by a polymorphism in the 5- HTT gene,”Science301, No. 5631 (2003): 386–389.
1700231073
1700231074
19.N. Risch, R. Herrell, T. Lehner, K.- Y. Liang, L. Eaves, J. Hoh, A.Griem, M. Kovacs, J. Ott, and K. R. Merikangas, “Interaction between the serotonin transporter gene (5- HTTLPR), stressful life events, and risk of depression: A meta- analysis,”JAMA301, No. 23 (2009): 2462– 2471; K. Karg,M. Burmeister, K. Shedden, and S. Sen, “The serotonin transporter promoter variant (5- HTTLPR), stress, and depression meta- analysis revisited: Evidence of genetic moderation,”Archives of General Psychiatry68, No. 5 (2011): 444–454.
1700231075
1700231076
20.E. Walker, G. Downey, and A. Bergman, “The effects of parental psychopathology and maltreatment on child behavior: A test of the diathesisstress model,”Child Development60, No. 1 (1989): 15– 24, http://www.jstor.org/stable/1131067.
1700231077
1700231078
21.为了试图理解“冒险型”基因型可能因其对某些表型的有益性而存在于人群中，一种新颖的方法是对全基因组关联分析得到的数据进行逆向分析，也称作全表型关联分析（Phenome-Wide Association Studies，PheWAS）。研究人员针对某一基因型扫描上千种表型，以期发现有关这些推定存在的“冒险型”基因型的新型关联，M. Rastegar- Mojarad, Z. Ye, J.M. Kolesar, S. J. Hebbring, and S. M. Lin, “Opportunities for drug repositioning from phenome-wide association studies,”Nature Biotechnology33 (2015)
:342– 345. doi
:10. 1038/nbt.3183。
1700231079
1700231080
22.K. Donohue, L. Dorn, C. Griffith, E. Kim, A. Aguilera, C. R. Polisetty,and J. Schmitt, “The evolutionary ecology of seed germination of Arabidopsis thaliana: Variable natural selection on germination timing,”Evolution59, No. 4(2005): 758– 770, http://www.ncbi.nlm .nih.gov/pubmed/15926687.
1700231081
1700231082
23.S. F. Levy, N. Ziv, and M. L. Siegal, “Bet hedging in yeast by heterogeneous, age-correlated expression of a stress protectant,” PLoS Biology 10, No. 5 (2012): e1001325, http://journals .plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio. 1001325.
1700231083
1700231084
24.S. R. Jaffee and T. S. Price, “Gene– environment correlations: A review of the evidence and implications for prevention of mental illness,”MolecularPsychiatry12, No. 5 (2007): 432– 442。
1700231085
1700231086
25.M. Rutter, “Gene– environment interdependence,” Developmental Science 10, No. 1 (2007): 12– 18, http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1467–7687. 2007.00557.x/full.
1700231087
1700231088
26.A. Caspi, J. McClay, T. E. Moffitt, J. Mill, J. Martin, I. W. Craig, A.Taylor, and R. Poulton, “Role of genotype in the cycle of violence in maltreated children,”Science297, No. 5582 (2002): 851– 854; A. Caspi et al., “Influence of life stress on depression.”
1700231089
1700231090
27.C. Jencks, “Heredity, environment, and public policy reconsidered,”American Sociological Review(1980): 723– 736.
1700231091
1700231092
28.即使是对于詹克斯所做的研究来说，你也许会疑惑，我们如何去评估某种基因型和环境之间的相互作用会导致智力迟钝这一结论呢？如果我们所关注的环境因素即饮食，事实上只是部分受到基因—相关性的影响那该怎么办呢？在这种关联性中，有能力的家庭能够选择饮食习惯，而其他家庭不行，这种能力在某种程度上与不同家庭的基因差异有关。
1700231093
1700231094
29.拿学校教育来说，由于学校资源的分配过程不是随机的，而且很有可能与遗传因素有关，所以当评估学校质量和多基因风险分数两者之间的基因环境相互作用时，我们就遇到了重大困难。一种解决办法是去关注那些基于抽签、测试分数取舍点或田纳西州STAR小型干预实验来分配的学校环境。J. B. Cullen, B. A. Jacob, and S. Levitt,“The effect of school choice on participants: Evidence from randomized lotteries,”Econometrica74,No. 5 (2006): 1191– 1230; A. Abdulkadiroğlu, J. Angrist, and P. Pathak,“The elite illusion: Achievement effects at Boston and New York exam schools,” Econometrica 82, No. 1 (2014): 137– 196; A. B. Krueger and D. M. Whitmore,“The effect of attending a small class in the early grades on college-test taking and middle school test results: Evidence from Project STAR,”EconomicJournal111, No. 468 (2001): 1– 28.
1700231095
1700231096
30.隐约来说，我们假设基因型不会随出生日期不同而产生系统性的变化。虽然有些研究人员发现在1年中，基因型的确会随出生日期而变化，但是“越战抽签征兵”这件事情被认为打破了这种联系。SeeC. A. Rietveld and D. Webbink, “On thegenetic bias of the quarter of birth instrument,”Economics and Human Biology21 (2016): 137– 146.
1700231097
1700231098
31.L. Schmitz and D. Conley, “The long- term consequences of Vietnamera conscription and genotype on smoking behavior and health,”BehaviorGenetics46, No. 1 (2016): 43– 58.
1700231099
1700231100
32.J. M. Fletcher, “Enhancing the gene-environment interaction framework through a quasi-experimental research design: Evidence from differential responses to September 1 1,” Biodemography and Social Biology 60, No. 1 (2014): 1– 20, http://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/19485565.2014.899454#.U2ZF-Bbo09U.
1700231101
1700231102
33.在这项研究中有四组调查对象，第一组调查对象拥有“冒险型”基因型并且在“9·11”事件前接受采访；第二组调查对象拥有“冒险型”基因型并且在“9·11”事件后接受采访；第三组调查对象拥有“保守型”基因型并且在“9·11”事件前接受采访；第四组调查对象拥有“保守型”基因型并且在“9·11”事件后接受采访。我们利用双重差分模型进行分析，它能够检测出在拥有“冒险型”基因型的人和拥有“保守型”基因型的人之间，在“9·11”事件后接受采访比在“9·11”事件前接受采访，在抑郁症状方面是否有较大的差异。
1700231103
1700231104
34.Caspi et al., “Influence of life stress on depression.”
1700231105
1700231106
35.我们在研究中使用同卵双生子出生体重差异的随机性作为和5-HTT基因起相互作用的环境冲击因素，这使我们更直觉地相信凯蒲赛效应可能是错误的。众所周知，出生体重能够反映产前营养和子宫环境的状况，并且它可以被用来预测各种未来的情况，从认知发展到身高、心脏疾病再到工资等各种结果。由于同卵双生子有相同的子宫环境、胎龄以及基因型，所以出生体重轻的一方可能被认为被随机分配了更少的卡路里，并且处于胎盘靠后的位置。这种方法已经被用来确定胎儿生长情况对以后的影响，并且排除了其他可能伴随的因素。
1700231107
1700231108
当我们实施这项研究并且根据有无5-HTT长启动子基因型来区分双生子基因型时，我们发现事实上至少有一个短小型5-HTT基因的双生子会对出生体重有反应。然而，我们的结果与凯蒲赛等人的发现不同，他们认为额外的营养补充会增大未来患抑郁症的风险。虽然在这种情况下环境压力因素是“随机”分配的，但是基因型不是。我们比较的是双生子基因型的影响（同卵双生子在定义上是完全一样的，因此我们在这两者之中看不到基因型的影响），那么我们如何知晓它真的是基因环境之间的相互作用而不是环境对环境的影响呢？换言之，也许我们得到的环境部分是正确的，并且由于人群分层，短小型基因代替了某些环境差异的影响。
1700231109
1700231110
为了解决这个问题，我们分析了异卵双生子的情况，他们有相同的子宫环境，但是基因型不同。因此我们可以比较双生子有无短小型5-HTT基因来观察遗传效应，不受任何环境影响，因为那些差异（如第三章所讨论的）在本质上是被随机分配的。再回到出生体重的问题上，它不是一个纯粹的环境问题，因为测量到的双生子出生体重的差异，其实是着床位置的随机性、胎盘结构和他们本身生长的遗传倾向三者共同影响的结果。因此，我们所检测的可能就是基因与基因之间的相互作用，存在于5-HTT基因启动子测量差异和其他子宫内未测量到的基因型差异之间。在此困境下的妥协之法是用这两种方法同时分析，即分别针对同卵和异卵双生子进行分析，并且在使用每种方法时都设定不同的假设。如果两个分析结果一致，则我们能更加确信所使用的方法能够最终发现真正的效应，尽管不是百分之百确定。这两种方法的确导致了一个不同于凯蒲赛的奇怪发现，但是大多数情况下，我们之所以提及这项研究，是为了展现在得到一个真正的基因环境之间相互作用的因果关系，所以会遇到令人难以置信的挑战。D.Conley and E. Rauscher, “Genetic interactions with prenatal social environment effects on academic and behavioral outcomes,”Journal of Health and SocialBehavior54, No. 1 (2013): 109–127.
1700231111
1700231112
36.J. D. Angrist and A. B. Krueger, “Does compulsory school attendance affect schooling and earnings?”Quarterly Journal of Economics106, No. 4(1991): 979– 1014; J. M. Fletcher, “New evidence of the effects of education on health in the US: Compulsory schooling laws revisited,”Social ScienceMedicine127 (2015): 101–107.
1700231113
1700231114
37.对于一项研究的可信度来说，重复实验是一个关键要素，原则上会给研究意义造成很大影响。在遗传分析中，某项研究发现能够用第二个数据集进行重复实验是极其重要的，但是在很多社会科学研究中，重复实验的重要性并不大。这种差异可能反映出在探究因果关系的过程中，环境和背景的重要性存在分歧。遗传学家可能更相信不随环境而改变的过程，如基因A编码蛋白质B，但是社会科学家对环境依赖性可能有一种总体的信念。
1700231115
1700231116
38.我们自己关于“越战抽签征兵”的文章就是运用多基因分数系统而不是候选基因来研究基因环境相互作用的实例。我们认为，在不久的将来，风险分数的使用将会更加普遍，因为很多数据集已经从只能用于候选基因分析，转变为能够用于基因组遗传学评估。
1700231117
1700231118
39.除了使用全基因组数据来进行多基因风险分数的测量外，通过部署主成分分析，我们同样能用这些数据来控制基因环境相关性（见第二章）。考虑到主成分分析方法摆脱了人群分层数据的影响，我们可以清楚地看到，所测量的遗传效应就是实际的效应，但是这种统计学的方法并没有解决一个问题，即人们可能是基于我们寻求了解的基因相互作用，来选择他们所处的环境。
1700231119
[
上一页 ]
[ :1.70023107e+09 ]
[
下一页 ]