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《说无垢称经》六卷
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是《维摩诘经》的异译。
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《分别缘起初胜法门经》二卷
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与隋达磨笈多译《缘生初胜分法本经》二卷同本。专论十二因缘之首的“无明”，为本经特色。
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《药师琉璃光如来本愿功德经》一卷
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与隋达磨笈多译《药师如来本愿经》一卷及唐义净译《药师琉璃光七佛本愿功德经》二卷为同本异译。为药师佛信仰的基本经典[48]。
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此外还译有：《称赞净土佛摄受经》一卷，与鸠摩罗什译《阿弥陀经》一卷同本；《甚希有经》一卷，与《未曾有经》一卷（后汉失译）同本；《最无比经》一卷，与隋阇那崛多译《稀有较量功德经》一卷同本；《称赞大乘功德经》一卷，与唐智严译《说妙法决定业障经》一卷同本；《如来示教胜军王经》一卷，与刘宋沮渠京声译《谏王经》同本，此后义净译《胜光天子经》亦为异译本；《缘起圣道经》一卷，与吴支谦译《贝多树下思惟十二因缘经》同本；《佛地经》一卷；《受持七佛名号所生功德经》一卷；《佛临涅槃记法住经》，简称《法住经》，一卷，谓正法住世千年后将灭，当有诸菩萨出世护法，饶益众生；《寂照神变三摩地经》一卷；《菩萨戒本》一卷，出自《瑜伽师地论·本地分·菩萨地》，故亦称《瑜伽戒本》；《菩萨戒羯磨文》一卷，出处同前。
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玄奘还译有密教经典：《不空索神咒心经》、《十一面神咒心经》、《咒五首经》、《胜幢臂印陀罗尼经》、《诸佛心陀罗尼经》、《拔济苦难陀罗尼经》、《八名普密陀罗尼经》、《持世陀罗尼经》、《六门陀罗尼经》各一卷。
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4.小乘经典
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《缘起经》一卷
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译于龙朔元年（661）。是《增一阿含经》卷四十六《放牛品》的异译，讲十二因缘。
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《本事经》七卷
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《天请问经》一卷
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《阿毗达磨发智论》，简称《发智论》，二十卷
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印度伽多衍尼子著。显庆五年（660）译完，玄则笔受。是说一切有部的基本论书，故也称《发智身论》。“身”喻根本。全书分八蕴（音译犍度）四十四纳息，意为八章四十四节。以说一切有部学说为基本内容，兼论部派之间争论的一切问题。前秦僧伽提婆译《阿毗昙八犍度论》三十卷，是其异译本。此论另有六部辅助性论书，称“六足论”，玄奘译了其中的如下五种。
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《阿毗达磨法蕴足论》十二卷
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印度大采菽氏著。“六足论”之一。译于显庆四年（659）九月。
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《阿毗达磨集异门足论》二十卷
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印度舍利子说。“六足论”之一。译毕于龙朔三年十二月（已进入公元664）。
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《阿毗达磨识身足论》十六卷
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印度提婆设摩著。“六足论”之一。译毕于贞观二十三年（649）八月。
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《阿毗达磨品类足论》十八卷
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印度筏苏蜜多罗著。“六足论”之一。译于显庆五年（660）十月。与刘宋求那跋陀罗等译《众事分阿毗昙论》十二卷为同本异译。
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《阿毗达磨界身足论》三卷
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印度筏苏蜜多罗著。“六足论”之一。