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关于“理科”即“哲学”部分，《西学凡》介绍说：“理学者，义理之大学也。人以义理超于万物，而为万物之灵。格物穷理，则于人全，而于天近。然物之理藏在物中，如金在砂，如玉在璞，须淘之剖之，以斐禄（按：前引为“録”）所费亚之学。此斐禄所者，立为五家，分有门类，有支节，大都学之专者，则三四年可成。初一年学落日加。夫落日加者，译言明辩之道，以立诸学之根基，辩其是与非，虚与实，表与里之诸法，即法家、教家必所借径者也。总包六大门类，一门是落日加之诸豫论，凡理学所用诸名目之解。一门是万物五公称之论，即万物之宗类，如生、觉、灵等物之本类，如牛、马、人等物之分类，如牛、马、人所以相分之理。物类之所有，如人能言，马能嘶，鸟能啼，犬能吠，狮能吼等，物类听所有无，物体自若，如艺于人，色于马等。一门是理有之论，即不显形于外，而独在人明悟中义理之有者。一门是十宗论，即天地间万物十宗府。一谓自立者，如天、地、人、物；一谓依赖者，不能自立，而有所赖焉以成。自立独有一宗，依赖则分而为九：一为几何，如尺寸一十等；二为相接，如君臣父子等；三为何状，如黑白冷热甘苦等；四为作为，如化伤行言等；五为抵受，如被化受伤等；六为何时，如昼夜年世等；七为何所，如乡房厅位等；八为体势，如立坐伏侧等；九为得用，如用袍裙，如得田池等。一门是辩学之论，即辩是非得失之诸榷法。一门是知学之论，即论实知与憶度与差谬之分。此第一家也。”〔27〕
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以上是《西学凡》介绍“哲学”学科第一年应学之课程，总名为“落日加”（应为Logic之音译），即“逻辑学”，包含六大门类：概念学、分类学、形而上学、性质学、辩学、知识论等。
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《西学凡》介绍第二年应学课程如下：“第二年学费西加，为斐禄所之第二家。费西加，译言察性理之道，以剖判万物之理而为之，辩其本末，原其性情，由其当然，以究其所以然。依显测隐，由后推前，其学更广博矣。亦分有六大门类。其第一门谓之闻性学，又分为八支：其一为费西加之诸预论；其二总论物性；其三总论有形自立之物性；其四讲物性之三原；其五总讲变化之所成；其六总讲物性之所以然；其七讲依赖有形者，如运动、作为、抵受、处所、几何等各有本论；其八总论天地与其有始无始否，有尽无尽否。而此八大支论，各有本书具载。此为闻性之学也。其第二门则论有形而不朽者，如言天之属。三门论有形而能朽者，如人兽草木等，与其生长、完成、死坏诸理。四门总论四元行、本体、火气水土与其相结而成物。五门详空中之变化，地中之变化，水中之变化。六门论有形而生活之物，分为五支：其一先总论生活之原，所以魂者是也；次论生长之魂，与其诸能；次论知觉之魂，与其五官之用、四识之职等；次论灵明在身之魂，与其明悟爱欲之诸理；次论灵魂离身后之诸能何如，而性命之理尽，格物之学可造矣。”〔28〕
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《西学凡》所列第二年的学习内容，总名“费西加”（应为Physics之音译），即“物理学”。包含六大门类：性质学、天论、万物论、种子说与四根说、空间论、灵魂学等。
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第三年应学课程为：“第三年进斐禄所第三家之学，所谓默达费西加者，译言察性以上之理也。所谓费日加者，止论物之有形，此则总论诸有形并及无形之宗理。分为五大门类：其一豫论，此学与此学之界；二总论万物所有超形之理，与其分合之理；三总论物之真与美；四总论物之理与性与体与其有之之由；五论天神谙若终论万物之主，与其为独一，为至纯，为无尽，为无终始，为万物之原等种种义理。此皆因物而论究竟，因变化之自然而究其自然之所以然。此所论天主与天神，特据人学之理论，之尚未到陡禄日亚所按经典天学而论，盖彼又进一学也。”〔29〕
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《西学凡》所列第三年的学习内容，总名“默达费西加”（应为Metaphysics之音译），即“形而上学”。分为五大门类，最终以“天主”为归结。
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第四年的学习任务是：“第四年总理三年之学，又加细论几何之学与修齐治平之学。几何之学，名曰马得马第加者，译言察几何之道，则主乎审究形物之分限者也。复取斐禄之所论天地万物，又进一番学问，是第四家。盖斐録本论其性情变化，而玛得玛第加独专究物形之度与数，度其完者以为几何大数，其截者以为几何众。然度数或脱物体而空论之，则数者立筭法家，度者立量法家，或二者在物体而偕其物论之，则数者在音声相济以为和，立律吕家，度者在动天转运为时，立历法家，而各家始分流别派矣。此度与数所关最巨，不但识各重天之厚薄远近大小与其昼夜之长短，节气之分至，启闭年月之闰余，道里之围径，地海之广深，而农以此知旱潦，医以此察运气，商以此计蓄散，工以此详坚脆，无不资焉。即如国家大事，治水者而不审高卑，何由酌其聚泄；用兵者而不谙器数，何从运其方略。故西方所尚，虽不立此科取士，若有精于此者，便人人推毂而国王隆礼延之，以为其学之师尊显之矣。故士人多相传习，自备测天之器，天地之仪，笔筭之书，测量之具，以为读书玩好，其于国家之事，屡显有大功用。
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“修齐治平之学，名曰厄第加者，译言察义理之学。复取斐録之所论物情性理，又加一番学问，是第五家。大约括于三事。一察众事之义理，考诸德之根本，观万行之情形，使知所当从之善，当避之恶，所以修身也。一论治家之道，居室处众资业孳育，使知其所当取，所当戒，以齐家也。一区别众政之品节，择贤长民，铨叙流品，考覈政事，而使正者显，庸邪者迸弃，所以治天下也。而身既修，家既齐，国既治平，则人道庶几备矣。故西土学者，德业必求其精，纲常伦理之详，日用细微之节，无一不求得其处置之宜，总从知己本性始，以至知万有。知万有即知万有之至尊，然后可以复其初，反其本也。既明于此，又推广至尊之仁以及于物，使各充其职而尽其分数，则学始大全矣。”〔30〕
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第四年的课程是前三年的总理与延伸。主要包括“几何之学”与“修齐治平之学”两项。前者名“马得马第加”（应为Mathematics之音译），后者名“厄第加”（应为Ethics之音译）。前者即“数学”，后者即“伦理学”。后者实际上还包括社会学与政治学的内容。
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以上四年的课程，第一年逻辑学，第二年物理学，第三年形而上学，第四年数学与伦理学，已经把当时“西洋哲学”的全部内容包涵在内了。“西洋哲学”的完整框架，已经在F. 培根活动的那时节，出现在明末中国的学术界。
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如果说以上还只涉及“论”的方面，还缺“史”的部分，则《西学凡》接下来的介绍，就弥补了“史”方面的不足。它在介绍完四年的学习任务后，还有这样一大段话：“大斐録之学何所起乎？昔我西土古贤，观天地间变化多奇，虽已各著为论，开此斐録之学，然多未免似是而非，终未了决。其后有一大贤，名亚理斯多，其识超卓，其学渊深，其才旷逸，为历山大王之师。历山尝云：‘我为天下主，不足为荣，惟一得亚理斯多而师之，以是为荣耳。’此大贤裒集群书，多方忝酌采取，凡普天之下有一奇物，不惜赀费以求得，不辞勤劳以寻究，必亲为探视，而奇秘无一之不搜。每物见其当然，而必索其所以然，因其既明，而益觅其所未明。由显入微，从粗及细，排定物类之门，极其广肆，一一钩致而决定其说，各据实理之坚确不破者，以著不刊之典。而凡属人学所论性理，无不曲畅旁通，天学得此以为先导。此在天主降生前所作，至今二千余年，无人不宗服之，而与陡禄日亚正相主辅。自此大贤之后，递生聪明才智，青出于蓝，及至天主降世，又有众圣迭兴，各于斐録之学，互相阐发，而加之以天主超性之确理，人学愈为透露也。斐録所费亚之学既毕，则考取之，分为四学，或学医法，或学国法，或学教法，或学道法。”〔31〕
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以上是从“史”的角度介绍“西洋哲学”，以“亚里士多德哲学”与“经院哲学”为重点。虽不全面，但重点还是抓住了。
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徐宗泽《明清间耶稣会士译著提要》视《西学凡》为“一本欧西大学所授各科之课程纲要也”，“书中将各科课程标准，撮要列论，而理科中尤详论五宗十府，道科中博究圣多玛斯超性学要之三大支”〔32〕。如此则我们可以视《西学凡》为“西洋哲学”输入中国之始，亦可以视《西学凡》为“西洋文学”、“西洋医学”、“西洋神学”、“西洋伦理学”、“西洋逻辑学”等等学科输入中国之始。这是目前中国学术界没有注意到的，至少是没有引起重视的。
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四、《灵言蠡勺》（1624）对西洋哲学的介绍
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《灵言蠡勺》，意大利传教士毕方济口授，徐光启笔录。初刻于明熹宗天启四年（1624），刻地上海或嘉定。李之藻《天学初函》所收，为杭州慎修堂重刻本。新会陈垣曾于民国八年（1919）重校刊印。该书分四篇，一论灵魂之体，二论灵魂之能，三论灵魂之尊，四论灵魂所向美好之情，是约400年前一部专门介绍西洋“灵魂”学说的哲学典籍。
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“灵魂”一词，英文为soul，是指与“肉体”相对应的非物质方面。相当于中文“灵与肉”中的那个“灵”，西文“物质与精神”中的那个“精神”。其说在西洋哲学中至关重要，可说是西洋哲学的“半壁江山”。所有的“唯物论”与此有关，所有的“唯心论”亦与此有关。又由于其输入之时，正当中国明末“心学盛行”之期，两种“心学”相碰撞，就极有可能造成以西洋“灵魂”之学释读中国“心学”的学术格局，这又是“儒西之争”的一个重要方面，当然亦是“佛西之争”或“禅西之争”的一个重要方面。
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兹先撮述“灵魂”之学在西洋的演进过程。古希腊哲学中“灵魂”被视为生命之原则。泰勒斯以“灵魂”为事物内部所固有，是事物运动变化之内在动力，一如磁石吸铁是因磁石有“灵魂”。阿那克西美尼视灵魂为“气”，人而能抟为一体，即赖此“气”。赫拉克利特则以“逻各斯”为“灵魂”所固有，“灵魂”具有思想与理智之功能，具有意识之功能，人之智慧即在于认识“逻各斯”，听从“逻各斯”。毕达哥拉斯学派则分“灵魂”为生气、心灵、表象三部分，其中“心灵”系“灵魂”之理性部分，为人所独有。又接受“灵魂不死”之说，认为“灵魂”依命运之规定而轮回。德谟克利特则以“原子”释“灵魂”，认为“灵魂”是由圆形、表面光滑之“原子”构成，故是能动的；又认为“灵魂”与“理智”同类，能产生感觉与思想。
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苏格拉底以“灵魂”为活动事物所具自己活动之力量，因而“灵魂”被视为人体生命之源，人体呼吸与再生之力量。柏拉图提出神赋予世界以“灵魂”、“世界灵魂”弥漫全宇宙之观点，认为有形事物受“灵魂”主宰与统治，是非独立的与有死的。又以“实体”释“灵魂”，作为平常意义上之个人是实体，作为个体死亡后能活下来者亦必是实体。又认为人之“灵魂”由理智、意志、欲望构成，把“灵魂”与有理性、意志、行动之个人等同。
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亚里士多德撰《论灵魂》，以“形式—质料”之说释“灵魂”，认为“灵魂”与肉体是不可分离的，“灵魂”乃是一切生命体之原因与基础。他分“灵魂”为营养的、感觉的与理性的三种，分别对应植物、动物与人类。人类“灵魂”中营养与感觉部分随人体生灭而生灭，理性部分则独立于人身实体，不随人体生灭而生灭，故是不朽的。此不朽之部分，即是所谓“心灵”。他以为“灵魂”乃肉体之“隐德莱希”与“能动的合目的性”，它是高于肉体的，因而只有它才是人之“本质”。斯多葛派（Stoics）则以“白纸”喻“灵魂”，外物映之则有“印象”，加工印象则有“表象”，回忆表象则成“观念”，加工观念（如通过判断推理等）则有可靠之知识。卢克莱修分“灵魂”为灵魂、心灵两部分，心灵又含理性、意志等。此两部分均是有死的。生命与感觉源于灵魂与肉体之结合。
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中世纪经院哲学以“上帝”释“灵魂”，认为“个人灵魂”乃上帝在人当中之“影象”；又视“灵魂”为上帝之创造，如托马斯·阿奎那。“灵魂”高于肉体、“灵魂”是肉体的本质等观点，得到普遍认同，如托马斯·阿奎那认为“灵魂”之智慧能力（他以为“灵魂”有感觉与智慧两种能力）完全不受肉体束缚，约翰·邓斯·司各脱认为“灵魂”是肉体的本质形式，布鲁诺认为“宇宙灵魂”乃是物质运动之内在原因。
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布鲁诺与毕方济同是意大利人，但布鲁诺活动的时间比毕方济稍早，且前者反叛天主教，而后者献身于天主教。1582年毕方济出生时，布鲁诺刚刚出版其一系列著作，如《论原因、本原与太一》（1584）、《论无限、宇宙与众多世界》（1584）、《论英雄热情》（1585）、《论单子、数与形》（1590）等。1592年，布鲁诺被指控为异端，落入宗教裁判所之手，此时毕方济刚好十岁。在布鲁诺1600年被烧死于罗马百花广场十年之后，毕方济抵达澳门（1610），开始其华土传教事业。又十四年后撰成《灵言蠡勺》，既是输入西洋宗教之书，又是输入西洋哲学之书，对于F. 培根（1561—1626）之前的西洋哲学，特别是西洋灵魂哲学，大致上都作了介绍。培根的《新大西岛》一书，与《灵言蠡勺》同年出版（1624）；之前培根著有《论说文集》（1597）、《学术之进步》（1605）、《新工具》（1620）等。
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F. 培根被马克思视为“英国唯物主义和整个现代实验科学的真正始祖”〔33〕，他关于“灵魂”的学说，也完全是“近代性”的。如他以“神经活动”释“灵魂”，以“真正的物质”释“灵魂”，以“分子之最初运动”释“灵魂”等等。当然他并未完全摆脱经院哲学的影响，如区分“人之灵魂”与“动物灵魂”，并视前者源于“上帝一口气”等。灵肉关系入近代，以“精神与物质”、“思维与存在”、“心与身”、“心与物”等等的名目，再次进入西洋哲学讨论的中心话题，如笛卡尔、洛克、莱布尼兹、贝克莱、休谟、康德、黑格尔、费尔巴哈等大哲，无不致力于此。只是不在毕方济《灵言蠡勺》的介绍范围之内。
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毕方济于天启甲子（1624）七月撰《灵言蠡勺·引》，论及“灵魂”之学与西洋哲学的关系，云：“亚尼玛（译言灵魂，亦言灵性）之学，于费禄苏非亚（译言格物穷理之学）中为最益，为最尊。古有大学，牓其堂曰：认己。谓认己者，是世人百千万种学问根宗，人人所当先务也。其所称‘认己’何也？先识己亚尼玛之尊，亚尼玛之性也。若人常想亚尼玛之能，亚尼玛之美，必然明达世间万事。如水流花谢，难可久恋，惟当罄心努力，以求天上永永常在之事。故格物穷理之君子，所以显著其美妙者为此。推而齐家治国平天下，凡为人师牧者，尤宜习此亚尼玛之学，借此理以为齐治均平之术。”〔34〕“灵魂”之学是西洋哲学（“费禄苏非亚”）中最为重要的部门之一，介绍“灵魂之学”，自然也就介绍了“西洋哲学”。苏格拉底“认识你自己”（“认己”）之说，在这里再次被介绍到中国，这是中国学界应当重视的。
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《灵言蠡勺·引》又说：“盖亚尼玛之学，理居其至崇高之处，以临御亚尼玛之欲能怒能（说见篇中），可以驾驭使之从理。凡诸情之动能节制之，治人之法，一切临御驾驭节制之势，略相似焉。君子在上，以恩德柔善良，欲能之象也；以威棱御强梗，怒能之象也；以法制禁令消弭乱萌，节度诸情之象也。亚利斯多曰：医者欲疗肉体之病，尚须习亚尼玛之学，治人者疗灵心之病，其须习也殆有甚焉。等而上之，欲论天上之事，其须知此，又更有甚焉者。”〔35〕亚里士多德（“亚利斯多”）的哲学在这里再次被介绍到中国，也是中国学界应当重视的。
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